Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G307700.1
Synonym Sb02g033770
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X979
Pfam -
Panther DB PTHR33672 PTHR33672:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G44660 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g31660.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK16115
Barley HORVU2Hr1G050580.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G233100 - -
2 Sobic.006G115532 - -
3 Sobic.001G115200 - -
4 Sobic.010G227600 - -
5 Sobic.005G107250 - -
6 Sobic.005G019650 - -
7 Sobic.010G180300 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G142550 - -
9 Sobic.006G185150 - -
10 Sobic.006G024101 - -
11 Sobic.010G165925 - -
12 Sobic.006G090450 - -
13 Sobic.006G212300 - -
14 Sobic.003G030100 pentatricopeptide, putative, expressed -
15 Sobic.001G369701 - -
16 Sobic.010G263051 - -
17 Sobic.007G003250 - -
18 Sobic.003G294550 - -
19 Sobic.008G135401 - -
20 Sobic.010G236950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G307700 Sobic002G307700 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic002G307700--Sobic004G233100 Sobic006G115532 Sobic006G115532 Sobic002G307700--Sobic006G115532 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic002G307700--Sobic001G115200 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic002G307700--Sobic010G227600 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic002G307700--Sobic005G107250 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic002G307700--Sobic005G019650 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic002G307700--Sobic010G180300 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic002G307700--Sobic002G142550 Sobic006G185150 Sobic006G185150 Sobic002G307700--Sobic006G185150 Sobic004G233100--Sobic010G227600 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic004G233100--Sobic001G509901 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic004G233100--Sobic009G248200 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic004G233100--Sobic003G030100 Sobic004G233100--Sobic001G115200 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic004G233100--Sobic004G061100 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic004G233100--Sobic004G079400 Sobic004G233100--Sobic006G115532 Sobic009G206900 Sobic009G206900 Sobic004G233100--Sobic009G206900 Sobic006G115532--Sobic004G233100 Sobic003G373700 Sobic003G373700 Sobic006G115532--Sobic003G373700 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic006G115532--Sobic008G157400 Sobic006G115532--Sobic002G307700 Sobic004G115950 Sobic004G115950 Sobic006G115532--Sobic004G115950 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic006G115532--Sobic010G263151 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic006G115532--Sobic010G165925 Sobic006G212300 Sobic006G212300 Sobic006G115532--Sobic006G212300 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic006G115532--Sobic006G196800 Sobic001G115200--Sobic005G107250 Sobic001G115200--Sobic005G019650 Sobic001G115200--Sobic010G180300 Sobic001G115200--Sobic006G185150 Sobic006G024101 Sobic006G024101 Sobic001G115200--Sobic006G024101 Sobic001G115200--Sobic002G142550 Sobic003G294550 Sobic003G294550 Sobic001G115200--Sobic003G294550 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic001G115200--Sobic001G369701 Sobic010G263051 Sobic010G263051 Sobic001G115200--Sobic010G263051 Sobic010G227600--Sobic004G233100 Sobic010G227600--Sobic003G030100 Sobic010G227600--Sobic009G206900 Sobic010G227600--Sobic004G079400 Sobic006G090450 Sobic006G090450 Sobic010G227600--Sobic006G090450 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic010G227600--Sobic001G519500 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic010G227600--Sobic007G043050 Sobic001G372400 Sobic001G372400 Sobic010G227600--Sobic001G372400 Sobic001G257600 Sobic001G257600 Sobic010G227600--Sobic001G257600 Sobic005G107250--Sobic002G142550 Sobic005G107250--Sobic010G165925 Sobic005G107250--Sobic010G180300 Sobic005G107250--Sobic001G115200 Sobic005G107250--Sobic005G019650 Sobic005G107250--Sobic001G369701 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic005G107250--Sobic007G003250 Sobic005G107250--Sobic006G185150 Sobic005G107250--Sobic006G024101 Sobic005G019650--Sobic006G185150 Sobic005G019650--Sobic006G024101 Sobic005G019650--Sobic010G180300 Sobic005G019650--Sobic005G107250 Sobic005G019650--Sobic003G294550 Sobic005G019650--Sobic001G115200 Sobic005G019650--Sobic010G263051 Sobic008G135401 Sobic008G135401 Sobic005G019650--Sobic008G135401 Sobic004G300400 Sobic004G300400 Sobic005G019650--Sobic004G300400 Sobic010G180300--Sobic005G019650 Sobic010G180300--Sobic005G107250 Sobic010G180300--Sobic006G024101 Sobic010G180300--Sobic006G185150 Sobic010G180300--Sobic001G115200 Sobic010G180300--Sobic003G294550 Sobic010G180300--Sobic008G135401 Sobic010G180300--Sobic002G142550 Sobic010G180300--Sobic010G263051 Sobic002G142550--Sobic005G107250 Sobic002G142550--Sobic010G165925 Sobic002G142550--Sobic001G369701 Sobic002G142550--Sobic007G003250 Sobic002G142550--Sobic010G180300 Sobic002G142550--Sobic001G115200 Sobic002G142550--Sobic005G019650 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic002G142550--Sobic003G025500 Sobic010G236950 Sobic010G236950 Sobic002G142550--Sobic010G236950 Sobic006G185150--Sobic005G019650 Sobic006G185150--Sobic006G024101 Sobic006G185150--Sobic003G294550 Sobic006G185150--Sobic010G180300 Sobic006G185150--Sobic004G300400 Sobic006G185150--Sobic001G115200 Sobic006G185150--Sobic010G263051 Sobic006G185150--Sobic005G107250 Sobic006G185150--Sobic008G135401
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.