Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G375000.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W787
Pfam PF01070
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g42440.3 : hydroxyacid oxidase 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G432750 - -
2 Sobic.010G226201 - -
3 Sobic.003G071800 - -
4 Sobic.002G347750 - -
5 Sobic.002G114200 GAGA-binding protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G071850 - -
7 Sobic.009G019400 - -
8 Sobic.002G191450 - -
9 Sobic.001G064400 expressed protein -
10 Sobic.002G202050 - -
11 Sobic.002G202050 - -
12 Sobic.002G202050 - -
13 Sobic.002G202050 - -
14 Sobic.006G247200 AMP-binding enzyme, putative, expressed -
15 Sobic.006G049633 - -
16 Sobic.002G344800 - -
17 Sobic.003G229900 - -
18 Sobic.010G143666 - -
19 Sobic.002G014100 OsFBX212 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G382200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G375000 Sobic002G375000 Sobic001G432750 Sobic001G432750 Sobic002G375000--Sobic001G432750 Sobic010G226201 Sobic010G226201 Sobic002G375000--Sobic010G226201 Sobic003G071800 Sobic003G071800 Sobic002G375000--Sobic003G071800 Sobic002G347750 Sobic002G347750 Sobic002G375000--Sobic002G347750 Sobic002G114200 Sobic002G114200 Sobic002G375000--Sobic002G114200 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic002G375000--Sobic004G071850 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic002G375000--Sobic009G019400 Sobic002G191450 Sobic002G191450 Sobic002G375000--Sobic002G191450 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic002G375000--Sobic001G064400 Sobic001G432750--Sobic002G375000 Sobic001G432750--Sobic003G071800 Sobic001G432750--Sobic010G226201 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic001G432750--Sobic003G229900 Sobic001G432750--Sobic002G114200 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic001G432750--Sobic006G049633 Sobic001G432750--Sobic009G019400 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic001G432750--Sobic003G281000 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic001G432750--Sobic004G296750 Sobic010G226201--Sobic002G375000 Sobic010G226201--Sobic001G432750 Sobic010G226201--Sobic003G071800 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic010G226201--Sobic003G137000 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic010G226201--Sobic003G165401 Sobic010G192200 Sobic010G192200 Sobic010G226201--Sobic010G192200 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic010G226201--Sobic002G124832 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic010G226201--Sobic008G140500 Sobic004G055901 Sobic004G055901 Sobic010G226201--Sobic004G055901 Sobic010G168100 Sobic010G168100 Sobic003G071800--Sobic010G168100 Sobic006G161200 Sobic006G161200 Sobic003G071800--Sobic006G161200 Sobic003G438100 Sobic003G438100 Sobic003G071800--Sobic003G438100 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic003G071800--Sobic003G253650 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic003G071800--Sobic008G030801 Sobic003G071800--Sobic001G432750 Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic003G071800--Sobic008G061900 Sobic003G071800--Sobic003G229900 Sobic003G071800--Sobic006G049633 Sobic002G347750--Sobic002G375000 Sobic002G347750--Sobic004G071850 Sobic004G000500 Sobic004G000500 Sobic002G347750--Sobic004G000500 Sobic003G331200 Sobic003G331200 Sobic002G347750--Sobic003G331200 Sobic002G347750--Sobic001G432750 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic002G347750--Sobic006G037500 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic002G347750--Sobic009G193600 Sobic006G118850 Sobic006G118850 Sobic002G347750--Sobic006G118850 Sobic001G311400 Sobic001G311400 Sobic002G347750--Sobic001G311400 Sobic002G114200--Sobic009G019400 Sobic002G114200--Sobic002G191450 Sobic002G114200--Sobic001G064400 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic002G114200--Sobic010G143666 Sobic002G114200--Sobic003G229900 Sobic002G114200--Sobic006G049633 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic002G114200--Sobic002G202050 Sobic003G260050 Sobic003G260050 Sobic004G071850--Sobic003G260050 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic004G071850--Sobic003G111700 Sobic010G194801 Sobic010G194801 Sobic004G071850--Sobic010G194801 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic004G071850--Sobic003G019500 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic004G071850--Sobic002G015950 Sobic009G043900 Sobic009G043900 Sobic004G071850--Sobic009G043900 Sobic004G071850--Sobic006G037500 Sobic004G071850--Sobic009G193600 Sobic004G071850--Sobic002G202050 Sobic009G019400--Sobic002G114200 Sobic009G019400--Sobic010G143666 Sobic009G019400--Sobic003G281000 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic009G019400--Sobic002G069300 Sobic009G019400--Sobic006G049633 Sobic009G019400--Sobic003G229900 Sobic008G069100 Sobic008G069100 Sobic009G019400--Sobic008G069100 Sobic009G019400--Sobic002G202050 Sobic002G191450--Sobic001G064400 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic002G191450--Sobic009G043800 Sobic002G191450--Sobic002G114200 Sobic002G191450--Sobic006G037500 Sobic004G221800 Sobic004G221800 Sobic002G191450--Sobic004G221800 Sobic002G191450--Sobic009G019400 Sobic002G191450--Sobic003G229900 Sobic007G007100 Sobic007G007100 Sobic002G191450--Sobic007G007100 Sobic002G191450--Sobic006G049633 Sobic001G064400--Sobic002G191450 Sobic001G064400--Sobic009G043800 Sobic001G064400--Sobic002G114200 Sobic001G064400--Sobic006G037500 Sobic001G064400--Sobic004G221800 Sobic001G064400--Sobic009G019400 Sobic001G064400--Sobic003G229900 Sobic001G064400--Sobic007G007100 Sobic001G064400--Sobic006G049633
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.