Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G427600.1
Synonym Sb02g043790
Functional annotation hypothetical protein
UniProt C5X6E2
Pfam PF00112
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0008234cysteine-type peptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g18390.1 : hypothetical protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G277550 - -
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19 Sobic.004G088800 OsFBX390 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G277000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G427600 Sobic002G427600 Sobic003G277550 Sobic003G277550 Sobic002G427600--Sobic003G277550 Sobic007G212250 Sobic007G212250 Sobic002G427600--Sobic007G212250 Sobic007G220033 Sobic007G220033 Sobic002G427600--Sobic007G220033 Sobic004G201000 Sobic004G201000 Sobic002G427600--Sobic004G201000 Sobic004G290850 Sobic004G290850 Sobic002G427600--Sobic004G290850 Sobic010G155401 Sobic010G155401 Sobic002G427600--Sobic010G155401 Sobic003G125751 Sobic003G125751 Sobic002G427600--Sobic003G125751 Sobic004G065950 Sobic004G065950 Sobic002G427600--Sobic004G065950 Sobic002G406000 Sobic002G406000 Sobic002G427600--Sobic002G406000 Sobic003G277550--Sobic002G427600 Sobic003G277550--Sobic007G212250 Sobic001G382332 Sobic001G382332 Sobic003G277550--Sobic001G382332 Sobic003G277550--Sobic002G406000 Sobic003G159300 Sobic003G159300 Sobic003G277550--Sobic003G159300 Sobic003G277550--Sobic007G220033 Sobic001G234733 Sobic001G234733 Sobic003G277550--Sobic001G234733 Sobic003G277550--Sobic004G290850 Sobic003G277550--Sobic003G125751 Sobic007G212250--Sobic002G427600 Sobic007G212250--Sobic003G277550 Sobic007G212250--Sobic007G220033 Sobic007G212250--Sobic004G201000 Sobic007G212250--Sobic002G406000 Sobic007G212250--Sobic010G155401 Sobic007G212250--Sobic003G125751 Sobic007G212250--Sobic004G290850 Sobic007G212250--Sobic001G382332 Sobic007G220033--Sobic002G427600 Sobic007G220033--Sobic004G201000 Sobic007G220033--Sobic010G155401 Sobic007G220033--Sobic003G125751 Sobic007G220033--Sobic004G065950 Sobic007G220033--Sobic004G290850 Sobic010G023650 Sobic010G023650 Sobic007G220033--Sobic010G023650 Sobic007G220033--Sobic003G277550 Sobic007G220033--Sobic007G212250 Sobic004G201000--Sobic010G155401 Sobic004G201000--Sobic004G065950 Sobic001G273875 Sobic001G273875 Sobic004G201000--Sobic001G273875 Sobic004G201000--Sobic003G125751 Sobic004G201000--Sobic004G290850 Sobic004G201000--Sobic002G427600 Sobic006G011450 Sobic006G011450 Sobic004G201000--Sobic006G011450 Sobic004G201000--Sobic007G220033 Sobic004G201000--Sobic010G023650 Sobic004G290850--Sobic004G201000 Sobic004G290850--Sobic010G155401 Sobic004G290850--Sobic004G065950 Sobic004G290850--Sobic003G125751 Sobic004G290850--Sobic001G273875 Sobic004G290850--Sobic002G427600 Sobic004G290850--Sobic006G011450 Sobic004G290850--Sobic007G220033 Sobic004G290850--Sobic010G023650 Sobic010G155401--Sobic004G201000 Sobic010G155401--Sobic004G065950 Sobic010G155401--Sobic001G273875 Sobic010G155401--Sobic003G125751 Sobic010G155401--Sobic004G290850 Sobic010G155401--Sobic002G427600 Sobic010G155401--Sobic006G011450 Sobic010G155401--Sobic007G220033 Sobic010G155401--Sobic010G023650 Sobic003G125751--Sobic004G201000 Sobic003G125751--Sobic010G155401 Sobic003G125751--Sobic004G065950 Sobic003G125751--Sobic004G290850 Sobic003G125751--Sobic001G273875 Sobic003G125751--Sobic002G427600 Sobic003G125751--Sobic007G220033 Sobic003G125751--Sobic006G011450 Sobic003G125751--Sobic010G023650 Sobic004G065950--Sobic004G201000 Sobic004G065950--Sobic010G155401 Sobic004G065950--Sobic001G273875 Sobic004G065950--Sobic003G125751 Sobic004G065950--Sobic004G290850 Sobic004G065950--Sobic002G427600 Sobic004G065950--Sobic006G011450 Sobic004G065950--Sobic007G220033 Sobic004G065950--Sobic010G023650 Sobic002G406000--Sobic003G277550 Sobic002G406000--Sobic002G427600 Sobic002G406000--Sobic007G212250 Sobic002G406000--Sobic001G382332 Sobic002G406000--Sobic007G220033 Sobic002G406000--Sobic003G159300 Sobic002G406000--Sobic004G201000 Sobic002G406000--Sobic003G125751 Sobic002G406000--Sobic010G155401
Octagon: transcription factors


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