Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G015950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VVF0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G59220 : highly ABA-induced PP2C gene 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g42260.1 : protein phosphatase 2C, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G190300 - -
2 Sobic.001G396600 glycosyltransferase, putative, expressed K08238: xyloglucan 6-xylosyltransferase
3 Sobic.010G121800 expansin precursor, putative, expressed -
4 Sobic.008G143200 - -
5 Sobic.002G332000 CRP8 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
6 Sobic.001G200800 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
7 Sobic.008G123350 - -
8 Sobic.002G103000 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -
9 Sobic.010G029450 - -
10 Sobic.001G341200 mps one binder kinase activator-like 1A, putative, expressed K06685: MOB1, MOB kinase activator 1
11 Sobic.001G209701 - -
12 Sobic.001G209701 - -
13 Sobic.001G209701 - -
14 Sobic.001G209701 - -
15 Sobic.001G209701 - -
16 Sobic.001G209701 - -
17 Sobic.001G209701 - -
18 Sobic.001G209701 - -
19 Sobic.001G209701 - -
20 Sobic.001G209701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G015950 Sobic003G015950 Sobic005G190300 Sobic005G190300 Sobic003G015950--Sobic005G190300 Sobic001G396600 Sobic001G396600 Sobic003G015950--Sobic001G396600 Sobic010G121800 Sobic010G121800 Sobic003G015950--Sobic010G121800 Sobic008G143200 Sobic008G143200 Sobic003G015950--Sobic008G143200 Sobic002G332000 Sobic002G332000 Sobic003G015950--Sobic002G332000 Sobic001G200800 Sobic001G200800 Sobic003G015950--Sobic001G200800 Sobic008G123350 Sobic008G123350 Sobic003G015950--Sobic008G123350 Sobic002G103000 Sobic002G103000 Sobic003G015950--Sobic002G103000 Sobic010G029450 Sobic010G029450 Sobic003G015950--Sobic010G029450 Sobic005G190300--Sobic008G123350 Sobic005G190300--Sobic010G121800 Sobic005G190300--Sobic002G332000 Sobic005G190300--Sobic001G200800 Sobic005G190300--Sobic008G143200 Sobic005G190300--Sobic002G103000 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic005G190300--Sobic008G122300 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic005G190300--Sobic001G209701 Sobic001G396600--Sobic010G029450 Sobic005G131100 Sobic005G131100 Sobic001G396600--Sobic005G131100 Sobic001G396600--Sobic008G122300 Sobic001G341200 Sobic001G341200 Sobic001G396600--Sobic001G341200 Sobic005G077700 Sobic005G077700 Sobic001G396600--Sobic005G077700 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic001G396600--Sobic001G312200 Sobic005G080700 Sobic005G080700 Sobic001G396600--Sobic005G080700 Sobic004G090600 Sobic004G090600 Sobic001G396600--Sobic004G090600 Sobic004G048500 Sobic004G048500 Sobic001G396600--Sobic004G048500 Sobic010G121800--Sobic008G143200 Sobic010G121800--Sobic002G332000 Sobic010G121800--Sobic002G103000 Sobic010G121800--Sobic001G200800 Sobic010G121800--Sobic001G209701 Sobic008G143200--Sobic010G121800 Sobic008G143200--Sobic002G103000 Sobic008G143200--Sobic002G332000 Sobic008G143200--Sobic001G209701 Sobic002G332000--Sobic010G121800 Sobic002G332000--Sobic008G143200 Sobic002G332000--Sobic008G122300 Sobic002G332000--Sobic005G131100 Sobic002G332000--Sobic002G103000 Sobic002G332000--Sobic001G200800 Sobic002G332000--Sobic001G209701 Sobic001G200800--Sobic002G103000 Sobic001G200800--Sobic008G143200 Sobic001G200800--Sobic010G121800 Sobic001G200800--Sobic002G332000 Sobic001G200800--Sobic001G209701 Sobic008G123350--Sobic005G190300 Sobic008G123350--Sobic010G121800 Sobic008G123350--Sobic001G200800 Sobic008G123350--Sobic002G332000 Sobic008G123350--Sobic008G143200 Sobic008G123350--Sobic002G103000 Sobic007G040400 Sobic007G040400 Sobic008G123350--Sobic007G040400 Sobic005G147400 Sobic005G147400 Sobic008G123350--Sobic005G147400 Sobic005G196400 Sobic005G196400 Sobic008G123350--Sobic005G196400 Sobic002G103000--Sobic008G143200 Sobic002G103000--Sobic001G200800 Sobic002G103000--Sobic001G209701 Sobic010G029450--Sobic001G396600 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic010G029450--Sobic005G153100 Sobic010G029450--Sobic001G312200 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic010G029450--Sobic002G399700 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic010G029450--Sobic002G058000 Sobic001G505400 Sobic001G505400 Sobic010G029450--Sobic001G505400 Sobic004G315900 Sobic004G315900 Sobic010G029450--Sobic004G315900 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic010G029450--Sobic008G188300 Sobic010G029450--Sobic005G147400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.