Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G029450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VRB4
Pfam -
Panther DB PTHR11064 PTHR11064:SF37
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G47640 : nuclear factor Y, subunit B2
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G396600 glycosyltransferase, putative, expressed K08238: xyloglucan 6-xylosyltransferase
2 Sobic.005G153100 - -
3 Sobic.001G312200 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
4 Sobic.002G399700 pectinesterase, putative, expressed -
5 Sobic.002G058000 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
6 Sobic.001G505400 expressed protein -
7 Sobic.004G315900 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
8 Sobic.008G188300 - -
9 Sobic.005G147400 - -
10 Sobic.002G031200 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
11 Sobic.007G040400 - -
12 Sobic.010G120100 expansin precursor, putative, expressed -
13 Sobic.009G202700 zinc finger family protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G196400 DEF6 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
15 Sobic.005G080700 - -
16 Sobic.005G154000 thioredoxin reductase 2, putative, expressed K00384: trxB, thioredoxin reductase (NADPH)
17 Sobic.005G080800 - -
18 Sobic.005G223300 DEFL16 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
19 Sobic.007G041000 expressed protein -
20 Sobic.005G131100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G029450 Sobic010G029450 Sobic001G396600 Sobic001G396600 Sobic010G029450--Sobic001G396600 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic010G029450--Sobic005G153100 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic010G029450--Sobic001G312200 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic010G029450--Sobic002G399700 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic010G029450--Sobic002G058000 Sobic001G505400 Sobic001G505400 Sobic010G029450--Sobic001G505400 Sobic004G315900 Sobic004G315900 Sobic010G029450--Sobic004G315900 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic010G029450--Sobic008G188300 Sobic005G147400 Sobic005G147400 Sobic010G029450--Sobic005G147400 Sobic001G396600--Sobic010G029450 Sobic005G131100 Sobic005G131100 Sobic001G396600--Sobic005G131100 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic001G396600--Sobic008G122300 Sobic001G341200 Sobic001G341200 Sobic001G396600--Sobic001G341200 Sobic005G077700 Sobic005G077700 Sobic001G396600--Sobic005G077700 Sobic001G396600--Sobic001G312200 Sobic005G080700 Sobic005G080700 Sobic001G396600--Sobic005G080700 Sobic004G090600 Sobic004G090600 Sobic001G396600--Sobic004G090600 Sobic004G048500 Sobic004G048500 Sobic001G396600--Sobic004G048500 Sobic005G153100--Sobic002G399700 Sobic005G153100--Sobic001G312200 Sobic005G153100--Sobic002G058000 Sobic005G153100--Sobic004G315900 Sobic002G031200 Sobic002G031200 Sobic005G153100--Sobic002G031200 Sobic010G120100 Sobic010G120100 Sobic005G153100--Sobic010G120100 Sobic005G153100--Sobic001G505400 Sobic005G223300 Sobic005G223300 Sobic005G153100--Sobic005G223300 Sobic005G153100--Sobic005G147400 Sobic001G312200--Sobic005G153100 Sobic001G312200--Sobic002G399700 Sobic001G345600 Sobic001G345600 Sobic001G312200--Sobic001G345600 Sobic001G312200--Sobic005G131100 Sobic001G312200--Sobic008G122300 Sobic001G312200--Sobic002G058000 Sobic001G312200--Sobic001G505400 Sobic001G312200--Sobic005G080700 Sobic001G312200--Sobic002G031200 Sobic002G399700--Sobic005G153100 Sobic002G399700--Sobic002G058000 Sobic002G399700--Sobic004G315900 Sobic005G080800 Sobic005G080800 Sobic002G399700--Sobic005G080800 Sobic005G154000 Sobic005G154000 Sobic002G399700--Sobic005G154000 Sobic002G399700--Sobic002G031200 Sobic002G399700--Sobic010G120100 Sobic005G130900 Sobic005G130900 Sobic002G399700--Sobic005G130900 Sobic002G399700--Sobic005G223300 Sobic002G058000--Sobic004G315900 Sobic002G058000--Sobic002G031200 Sobic002G058000--Sobic010G120100 Sobic002G058000--Sobic002G399700 Sobic002G058000--Sobic005G080800 Sobic002G058000--Sobic005G223300 Sobic002G058000--Sobic005G130900 Sobic002G058000--Sobic005G153100 Sobic002G058000--Sobic005G154000 Sobic001G505400--Sobic005G080700 Sobic005G196400 Sobic005G196400 Sobic001G505400--Sobic005G196400 Sobic001G505400--Sobic005G147400 Sobic001G505400--Sobic005G223300 Sobic007G040400 Sobic007G040400 Sobic001G505400--Sobic007G040400 Sobic001G505400--Sobic004G048500 Sobic005G189700 Sobic005G189700 Sobic001G505400--Sobic005G189700 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic001G505400--Sobic001G209701 Sobic004G315900--Sobic002G058000 Sobic004G315900--Sobic002G031200 Sobic004G315900--Sobic010G120100 Sobic004G315900--Sobic002G399700 Sobic004G315900--Sobic005G080800 Sobic004G315900--Sobic005G223300 Sobic004G315900--Sobic005G130900 Sobic004G315900--Sobic005G189700 Sobic004G315900--Sobic005G154000 Sobic004G316400 Sobic004G316400 Sobic008G188300--Sobic004G316400 Sobic008G188300--Sobic005G153100 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic008G188300--Sobic010G129300 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic008G188300--Sobic002G058100 Sobic008G188300--Sobic005G154000 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic008G188300--Sobic005G027200 Sobic008G188300--Sobic002G399700 Sobic008G188300--Sobic001G312200 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic008G188300--Sobic002G095000 Sobic005G147400--Sobic007G040400 Sobic005G147400--Sobic005G196400 Sobic005G147400--Sobic001G505400 Sobic005G147400--Sobic005G223300 Sobic005G147400--Sobic005G080700 Sobic005G147400--Sobic010G120100 Sobic005G147400--Sobic002G031200 Sobic005G147400--Sobic005G189700 Sobic008G120200 Sobic008G120200 Sobic005G147400--Sobic008G120200
Octagon: transcription factors


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