Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G137000.2,Sobic.003G137000.3
Synonym
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt C5XHY9
Pfam -
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF115
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G04790 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g43220.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056490
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G165401 - -
2 Sobic.002G124832 - -
3 Sobic.002G069300 DNA binding protein, putative, expressed -
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10 Sobic.002G202050 - -
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13 Sobic.002G202050 - -
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16 Sobic.003G155700 transcription initiation factor IID, 18kD subunit family protein, expressed K03127: transcription initiation factor TFIID subunit 13
17 Sobic.005G133750 - -
18 Sobic.004G178550 - -
19 Sobic.010G011500 - -
20 Sobic.003G111700 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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