Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G154600.1
Synonym Sb03g013500
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q3C3
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF33
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45480 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g23440.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G328850 - -
2 Sobic.008G153801 - -
3 Sobic.009G062150 - -
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9 Sobic.008G177700 strictosidine synthase, putative, expressed -
10 Sobic.004G254200 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase
11 Sobic.003G408700 expressed protein -
12 Sobic.010G141700 FAR1 family protein, expressed -
13 Sobic.001G185700 expressed protein -
14 Sobic.002G099500 expressed protein -
15 Sobic.003G384650 - -
16 Sobic.003G405400 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.007G146800 late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G034650 - -
19 Sobic.001G539100 - -
20 Sobic.005G017632 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G154600 Sobic003G154600 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic003G154600--Sobic001G328850 Sobic008G153801 Sobic008G153801 Sobic003G154600--Sobic008G153801 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic003G154600--Sobic009G062150 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic003G154600--Sobic006G204850 Sobic001G507933 Sobic001G507933 Sobic003G154600--Sobic001G507933 Sobic003G242500 Sobic003G242500 Sobic003G154600--Sobic003G242500 Sobic002G039301 Sobic002G039301 Sobic003G154600--Sobic002G039301 Sobic003G426750 Sobic003G426750 Sobic003G154600--Sobic003G426750 Sobic008G177700 Sobic008G177700 Sobic003G154600--Sobic008G177700 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic001G328850--Sobic005G120466 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic001G328850--Sobic001G185700 Sobic004G171350 Sobic004G171350 Sobic001G328850--Sobic004G171350 Sobic009G219601 Sobic009G219601 Sobic001G328850--Sobic009G219601 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic001G328850--Sobic004G123801 Sobic001G328850--Sobic006G204850 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic001G328850--Sobic007G181801 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic001G328850--Sobic003G384650 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic001G328850--Sobic003G178101 Sobic008G153801--Sobic006G204850 Sobic008G153801--Sobic003G426750 Sobic005G017632 Sobic005G017632 Sobic008G153801--Sobic005G017632 Sobic008G153801--Sobic009G062150 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic008G153801--Sobic001G018700 Sobic009G062150--Sobic008G153801 Sobic009G062150--Sobic006G204850 Sobic009G062150--Sobic003G426750 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic009G062150--Sobic009G067700 Sobic009G062150--Sobic005G017632 Sobic009G062150--Sobic001G018700 Sobic006G204850--Sobic008G153801 Sobic006G204850--Sobic005G017632 Sobic006G204850--Sobic001G018700 Sobic004G254200 Sobic004G254200 Sobic001G507933--Sobic004G254200 Sobic003G408700 Sobic003G408700 Sobic001G507933--Sobic003G408700 Sobic010G141700 Sobic010G141700 Sobic001G507933--Sobic010G141700 Sobic001G507933--Sobic008G177700 Sobic001G507933--Sobic003G242500 Sobic002G430601 Sobic002G430601 Sobic001G507933--Sobic002G430601 Sobic001G507933--Sobic001G018700 Sobic003G242500--Sobic008G177700 Sobic003G242500--Sobic001G507933 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic003G242500--Sobic001G030800 Sobic003G242500--Sobic001G018700 Sobic002G039301--Sobic001G507933 Sobic002G039301--Sobic004G254200 Sobic002G039301--Sobic003G408700 Sobic002G039301--Sobic010G141700 Sobic002G039301--Sobic008G177700 Sobic002G039301--Sobic003G242500 Sobic001G236950 Sobic001G236950 Sobic002G039301--Sobic001G236950 Sobic007G146800 Sobic007G146800 Sobic002G039301--Sobic007G146800 Sobic002G397001 Sobic002G397001 Sobic002G039301--Sobic002G397001 Sobic003G426750--Sobic008G153801 Sobic003G426750--Sobic006G204850 Sobic003G426750--Sobic009G062150 Sobic003G426750--Sobic005G017632 Sobic002G400050 Sobic002G400050 Sobic003G426750--Sobic002G400050 Sobic001G196950 Sobic001G196950 Sobic003G426750--Sobic001G196950 Sobic004G098650 Sobic004G098650 Sobic003G426750--Sobic004G098650 Sobic003G426750--Sobic001G018700 Sobic008G177700--Sobic003G242500 Sobic008G177700--Sobic001G507933 Sobic008G177700--Sobic004G254200 Sobic008G177700--Sobic003G408700 Sobic008G177700--Sobic010G141700 Sobic008G177700--Sobic001G030800 Sobic008G177700--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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