Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G254850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VYW1
Pfam PF02365
Panther DB PTHR31989 PTHR31989:SF52
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G12260 : NAC 007
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g48446.1 : no apical meristem protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G134700 formin, putative, expressed -
2 Sobic.001G202800 - -
3 Sobic.009G011050 - -
4 Sobic.006G037800 - -
5 Sobic.010G225175 - -
6 Sobic.008G056000 nifU, putative, expressed -
7 Sobic.004G039000 expressed protein -
8 Sobic.010G149000 - -
9 Sobic.009G188200 - -
10 Sobic.010G052100 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
11 Sobic.006G239200 expressed protein -
12 Sobic.003G251000 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
13 Sobic.008G060800 expressed protein -
14 Sobic.002G142400 - -
15 Sobic.004G127350 - -
16 Sobic.001G208133 - -
17 Sobic.003G436100 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G154450 - -
19 Sobic.006G265500 - -
20 Sobic.002G025900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G254850 Sobic003G254850 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic003G254850--Sobic007G134700 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic003G254850--Sobic001G202800 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic003G254850--Sobic009G011050 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic003G254850--Sobic006G037800 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic003G254850--Sobic010G225175 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic003G254850--Sobic008G056000 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic003G254850--Sobic004G039000 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic003G254850--Sobic010G149000 Sobic009G188200 Sobic009G188200 Sobic003G254850--Sobic009G188200 Sobic007G134700--Sobic006G037800 Sobic007G134700--Sobic010G149000 Sobic007G134700--Sobic003G254850 Sobic007G134700--Sobic008G056000 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic007G134700--Sobic010G052100 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic007G134700--Sobic003G251000 Sobic007G134700--Sobic001G202800 Sobic007G134700--Sobic009G011050 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic007G134700--Sobic006G239200 Sobic001G202800--Sobic009G011050 Sobic001G202800--Sobic006G239200 Sobic002G142400 Sobic002G142400 Sobic001G202800--Sobic002G142400 Sobic001G202800--Sobic006G037800 Sobic001G202800--Sobic010G149000 Sobic001G202800--Sobic007G134700 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic001G202800--Sobic002G117800 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic001G202800--Sobic001G208133 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic001G202800--Sobic003G024450 Sobic009G011050--Sobic006G239200 Sobic009G011050--Sobic001G202800 Sobic009G011050--Sobic001G208133 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic009G011050--Sobic003G311300 Sobic009G011050--Sobic006G037800 Sobic009G011050--Sobic002G142400 Sobic009G011050--Sobic007G134700 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic009G011050--Sobic008G060800 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic009G011050--Sobic006G038050 Sobic006G037800--Sobic010G149000 Sobic006G037800--Sobic007G134700 Sobic006G037800--Sobic010G052100 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic006G037800--Sobic002G154450 Sobic006G037800--Sobic003G251000 Sobic006G037800--Sobic006G239200 Sobic006G037800--Sobic001G202800 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic006G037800--Sobic005G176300 Sobic006G037800--Sobic009G011050 Sobic010G225175--Sobic010G052100 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic010G225175--Sobic001G045900 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic010G225175--Sobic007G127200 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic010G225175--Sobic004G127350 Sobic010G225175--Sobic002G154450 Sobic010G225175--Sobic010G149000 Sobic010G225175--Sobic006G037800 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic010G225175--Sobic010G247750 Sobic001G045100 Sobic001G045100 Sobic010G225175--Sobic001G045100 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic008G056000--Sobic001G440401 Sobic008G056000--Sobic007G134700 Sobic008G056000--Sobic010G149000 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic008G056000--Sobic003G288700 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic008G056000--Sobic002G025900 Sobic008G056000--Sobic003G251000 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic008G056000--Sobic002G168750 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic008G056000--Sobic006G065000 Sobic008G056000--Sobic006G037800 Sobic004G039000--Sobic001G208133 Sobic004G039000--Sobic001G202800 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic004G039000--Sobic004G092950 Sobic004G039000--Sobic002G117800 Sobic002G428301 Sobic002G428301 Sobic004G039000--Sobic002G428301 Sobic004G039000--Sobic003G254850 Sobic004G039000--Sobic009G011050 Sobic004G039000--Sobic006G239200 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic004G039000--Sobic002G325000 Sobic010G149000--Sobic006G037800 Sobic010G149000--Sobic007G134700 Sobic010G149000--Sobic002G154450 Sobic010G149000--Sobic010G052100 Sobic010G149000--Sobic003G024450 Sobic010G149000--Sobic008G056000 Sobic010G149000--Sobic010G225175 Sobic010G149000--Sobic001G202800 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic010G149000--Sobic004G143550 Sobic003G436100 Sobic003G436100 Sobic009G188200--Sobic003G436100 Sobic003G059450 Sobic003G059450 Sobic009G188200--Sobic003G059450 Sobic009G097500 Sobic009G097500 Sobic009G188200--Sobic009G097500 Sobic007G179266 Sobic007G179266 Sobic009G188200--Sobic007G179266 Sobic009G188200--Sobic005G176300 Sobic006G200650 Sobic006G200650 Sobic009G188200--Sobic006G200650 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic009G188200--Sobic002G334700 Sobic009G188200--Sobic004G127350 Sobic009G188200--Sobic010G052100
Octagon: transcription factors


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