Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G134700.1,Sobic.007G134700.2
Synonym Sb07g021060
Functional annotation formin, putative, expressed
UniProt C5YL63 , A0A1Z5R9Q8
Pfam PF02181
Panther DB PTHR23213 PTHR23213:SF177
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G05470 : Actin-binding FH2 (formin homology 2) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g33430.1 : formin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005974
Brachypodium KQJ98372
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G037800 - -
2 Sobic.010G149000 - -
3 Sobic.003G254850 - -
4 Sobic.008G056000 nifU, putative, expressed -
5 Sobic.010G052100 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
6 Sobic.003G251000 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
7 Sobic.001G202800 - -
8 Sobic.009G011050 - -
9 Sobic.006G239200 expressed protein -
10 Sobic.002G154450 - -
11 Sobic.005G176300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
12 Sobic.010G225175 - -
13 Sobic.001G440401 - -
14 Sobic.001G208133 - -
15 Sobic.006G038050 - -
16 Sobic.003G311300 GRF zinc finger family protein, expressed -
17 Sobic.009G188200 - -
18 Sobic.002G168750 - -
19 Sobic.004G072600 - -
20 Sobic.003G031300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic007G134700--Sobic006G037800 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic007G134700--Sobic010G149000 Sobic003G254850 Sobic003G254850 Sobic007G134700--Sobic003G254850 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic007G134700--Sobic008G056000 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic007G134700--Sobic010G052100 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic007G134700--Sobic003G251000 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic007G134700--Sobic001G202800 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic007G134700--Sobic009G011050 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic007G134700--Sobic006G239200 Sobic006G037800--Sobic010G149000 Sobic006G037800--Sobic007G134700 Sobic006G037800--Sobic010G052100 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic006G037800--Sobic002G154450 Sobic006G037800--Sobic003G251000 Sobic006G037800--Sobic006G239200 Sobic006G037800--Sobic001G202800 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic006G037800--Sobic005G176300 Sobic006G037800--Sobic009G011050 Sobic010G149000--Sobic006G037800 Sobic010G149000--Sobic007G134700 Sobic010G149000--Sobic002G154450 Sobic010G149000--Sobic010G052100 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic010G149000--Sobic003G024450 Sobic010G149000--Sobic008G056000 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic010G149000--Sobic010G225175 Sobic010G149000--Sobic001G202800 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic010G149000--Sobic004G143550 Sobic003G254850--Sobic007G134700 Sobic003G254850--Sobic001G202800 Sobic003G254850--Sobic009G011050 Sobic003G254850--Sobic006G037800 Sobic003G254850--Sobic010G225175 Sobic003G254850--Sobic008G056000 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic003G254850--Sobic004G039000 Sobic003G254850--Sobic010G149000 Sobic009G188200 Sobic009G188200 Sobic003G254850--Sobic009G188200 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic008G056000--Sobic001G440401 Sobic008G056000--Sobic007G134700 Sobic008G056000--Sobic010G149000 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic008G056000--Sobic003G288700 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic008G056000--Sobic002G025900 Sobic008G056000--Sobic003G251000 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic008G056000--Sobic002G168750 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic008G056000--Sobic006G065000 Sobic008G056000--Sobic006G037800 Sobic010G052100--Sobic010G225175 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic010G052100--Sobic001G045900 Sobic010G052100--Sobic002G154450 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic010G052100--Sobic007G127200 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic010G052100--Sobic004G127350 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic010G052100--Sobic009G094100 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic010G052100--Sobic007G103200 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic010G052100--Sobic010G247750 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic010G052100--Sobic004G127733 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic003G251000--Sobic006G149900 Sobic003G251000--Sobic002G154450 Sobic003G251000--Sobic010G052100 Sobic003G251000--Sobic009G094100 Sobic003G251000--Sobic004G127350 Sobic003G251000--Sobic005G176300 Sobic003G251000--Sobic006G037800 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic003G251000--Sobic004G072600 Sobic003G251000--Sobic007G103200 Sobic001G202800--Sobic009G011050 Sobic001G202800--Sobic006G239200 Sobic002G142400 Sobic002G142400 Sobic001G202800--Sobic002G142400 Sobic001G202800--Sobic006G037800 Sobic001G202800--Sobic010G149000 Sobic001G202800--Sobic007G134700 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic001G202800--Sobic002G117800 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic001G202800--Sobic001G208133 Sobic001G202800--Sobic003G024450 Sobic009G011050--Sobic006G239200 Sobic009G011050--Sobic001G202800 Sobic009G011050--Sobic001G208133 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic009G011050--Sobic003G311300 Sobic009G011050--Sobic006G037800 Sobic009G011050--Sobic002G142400 Sobic009G011050--Sobic007G134700 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic009G011050--Sobic008G060800 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic009G011050--Sobic006G038050 Sobic006G239200--Sobic003G311300 Sobic006G239200--Sobic009G011050 Sobic006G239200--Sobic001G208133 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic006G239200--Sobic003G031300 Sobic006G239200--Sobic001G202800 Sobic006G239200--Sobic002G142400 Sobic006G239200--Sobic006G037800 Sobic006G239200--Sobic007G134700 Sobic006G239200--Sobic006G038050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.