Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G311300.2
Synonym Sb03g035940
Functional annotation GRF zinc finger family protein, expressed
UniProt A0A1W0VZR5
Pfam PF06839
Panther DB PTHR33248 PTHR33248:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g31360.1 : GRF zinc finger family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G208133 - -
2 Sobic.006G239200 expressed protein -
3 Sobic.004G079400 FAR1 family protein, expressed -
4 Sobic.003G031300 - -
5 Sobic.006G038050 - -
6 Sobic.009G011050 - -
7 Sobic.004G061100 - -
8 Sobic.001G202800 - -
9 Sobic.003G030100 pentatricopeptide, putative, expressed -
10 Sobic.006G037800 - -
11 Sobic.002G142400 - -
12 Sobic.007G134700 formin, putative, expressed -
13 Sobic.004G352750 - -
14 Sobic.010G149000 - -
15 Sobic.010G227600 - -
16 Sobic.005G109101 - -
17 Sobic.001G175200 expressed protein -
18 Sobic.002G117800 - -
19 Sobic.002G400700 - -
20 Sobic.006G261650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic003G311300--Sobic001G208133 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic003G311300--Sobic006G239200 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic003G311300--Sobic004G079400 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic003G311300--Sobic003G031300 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic003G311300--Sobic006G038050 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic003G311300--Sobic009G011050 Sobic004G061100 Sobic004G061100 Sobic003G311300--Sobic004G061100 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic003G311300--Sobic001G202800 Sobic003G030100 Sobic003G030100 Sobic003G311300--Sobic003G030100 Sobic001G208133--Sobic003G311300 Sobic001G208133--Sobic006G239200 Sobic001G208133--Sobic009G011050 Sobic001G208133--Sobic003G031300 Sobic001G208133--Sobic006G038050 Sobic001G208133--Sobic001G202800 Sobic001G208133--Sobic004G079400 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic001G208133--Sobic007G134700 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic001G208133--Sobic004G039000 Sobic006G239200--Sobic003G311300 Sobic006G239200--Sobic009G011050 Sobic006G239200--Sobic001G208133 Sobic006G239200--Sobic003G031300 Sobic006G239200--Sobic001G202800 Sobic002G142400 Sobic002G142400 Sobic006G239200--Sobic002G142400 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic006G239200--Sobic006G037800 Sobic006G239200--Sobic007G134700 Sobic006G239200--Sobic006G038050 Sobic004G079400--Sobic003G311300 Sobic004G079400--Sobic004G061100 Sobic004G079400--Sobic003G031300 Sobic004G079400--Sobic003G030100 Sobic004G079400--Sobic001G208133 Sobic004G079400--Sobic006G239200 Sobic010G227600 Sobic010G227600 Sobic004G079400--Sobic010G227600 Sobic001G175200 Sobic001G175200 Sobic004G079400--Sobic001G175200 Sobic004G233100 Sobic004G233100 Sobic004G079400--Sobic004G233100 Sobic003G031300--Sobic003G311300 Sobic003G031300--Sobic006G239200 Sobic003G031300--Sobic001G208133 Sobic003G031300--Sobic004G079400 Sobic003G059450 Sobic003G059450 Sobic003G031300--Sobic003G059450 Sobic004G352750 Sobic004G352750 Sobic003G031300--Sobic004G352750 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic003G031300--Sobic002G334700 Sobic002G400700 Sobic002G400700 Sobic003G031300--Sobic002G400700 Sobic003G031300--Sobic009G011050 Sobic006G038050--Sobic003G311300 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic006G038050--Sobic010G149000 Sobic006G038050--Sobic006G037800 Sobic006G038050--Sobic001G208133 Sobic002G149500 Sobic002G149500 Sobic006G038050--Sobic002G149500 Sobic006G038050--Sobic006G239200 Sobic006G038050--Sobic009G011050 Sobic006G038050--Sobic007G134700 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic006G038050--Sobic003G383000 Sobic009G011050--Sobic006G239200 Sobic009G011050--Sobic001G202800 Sobic009G011050--Sobic001G208133 Sobic009G011050--Sobic003G311300 Sobic009G011050--Sobic006G037800 Sobic009G011050--Sobic002G142400 Sobic009G011050--Sobic007G134700 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic009G011050--Sobic008G060800 Sobic009G011050--Sobic006G038050 Sobic004G061100--Sobic001G175200 Sobic004G061100--Sobic004G079400 Sobic001G509901 Sobic001G509901 Sobic004G061100--Sobic001G509901 Sobic004G061100--Sobic003G311300 Sobic004G061100--Sobic004G233100 Sobic006G224600 Sobic006G224600 Sobic004G061100--Sobic006G224600 Sobic004G061100--Sobic006G038050 Sobic004G061100--Sobic006G239200 Sobic003G340200 Sobic003G340200 Sobic004G061100--Sobic003G340200 Sobic001G202800--Sobic009G011050 Sobic001G202800--Sobic006G239200 Sobic001G202800--Sobic002G142400 Sobic001G202800--Sobic006G037800 Sobic001G202800--Sobic010G149000 Sobic001G202800--Sobic007G134700 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic001G202800--Sobic002G117800 Sobic001G202800--Sobic001G208133 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic001G202800--Sobic003G024450 Sobic003G030100--Sobic010G227600 Sobic003G030100--Sobic004G079400 Sobic003G030100--Sobic003G311300 Sobic003G030100--Sobic004G233100 Sobic003G030100--Sobic001G208133 Sobic003G030100--Sobic006G038050 Sobic003G030100--Sobic004G352750 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic003G030100--Sobic001G519500 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic003G030100--Sobic007G043050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.