Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G117800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QAM4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G202800 - -
2 Sobic.004G092950 - -
3 Sobic.002G290900 no apical meristem protein, putative, expressed -
4 Sobic.010G023132 - -
5 Sobic.003G024450 - -
6 Sobic.009G011050 - -
7 Sobic.004G039000 expressed protein -
8 Sobic.008G060800 expressed protein -
9 Sobic.001G208133 - -
10 Sobic.008G133750 - -
11 Sobic.006G038050 - -
12 Sobic.010G149000 - -
13 Sobic.003G388201 - -
14 Sobic.003G311300 GRF zinc finger family protein, expressed -
15 Sobic.006G239200 expressed protein -
16 Sobic.004G143550 - -
17 Sobic.K004201 - -
18 Sobic.002G142400 - -
19 Sobic.005G198150 - -
20 Sobic.009G190100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic002G117800--Sobic001G202800 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic002G117800--Sobic004G092950 Sobic002G290900 Sobic002G290900 Sobic002G117800--Sobic002G290900 Sobic010G023132 Sobic010G023132 Sobic002G117800--Sobic010G023132 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic002G117800--Sobic003G024450 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic002G117800--Sobic009G011050 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic002G117800--Sobic004G039000 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic002G117800--Sobic008G060800 Sobic001G208133 Sobic001G208133 Sobic002G117800--Sobic001G208133 Sobic001G202800--Sobic009G011050 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic001G202800--Sobic006G239200 Sobic002G142400 Sobic002G142400 Sobic001G202800--Sobic002G142400 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic001G202800--Sobic006G037800 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic001G202800--Sobic010G149000 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic001G202800--Sobic007G134700 Sobic001G202800--Sobic002G117800 Sobic001G202800--Sobic001G208133 Sobic001G202800--Sobic003G024450 Sobic004G092950--Sobic003G024450 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic004G092950--Sobic001G440401 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic004G092950--Sobic009G190100 Sobic004G092950--Sobic002G117800 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic004G092950--Sobic002G025900 Sobic003G348300 Sobic003G348300 Sobic004G092950--Sobic003G348300 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic004G092950--Sobic004G023800 Sobic009G055700 Sobic009G055700 Sobic004G092950--Sobic009G055700 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic004G092950--Sobic003G288700 Sobic002G290900--Sobic002G117800 Sobic002G290900--Sobic003G024450 Sobic002G290900--Sobic004G092950 Sobic002G290900--Sobic004G023800 Sobic002G290900--Sobic008G060800 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic002G290900--Sobic004G143550 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic002G290900--Sobic006G065000 Sobic002G290900--Sobic010G023132 Sobic003G388201 Sobic003G388201 Sobic002G290900--Sobic003G388201 Sobic010G023132--Sobic002G117800 Sobic009G087360 Sobic009G087360 Sobic010G023132--Sobic009G087360 Sobic010G023132--Sobic004G039000 Sobic008G133750 Sobic008G133750 Sobic010G023132--Sobic008G133750 Sobic010G023132--Sobic004G092950 Sobic010G023132--Sobic009G190100 Sobic010G023132--Sobic001G202800 Sobic006G192150 Sobic006G192150 Sobic010G023132--Sobic006G192150 Sobic010G023132--Sobic003G024450 Sobic003G024450--Sobic004G143550 Sobic003G024450--Sobic004G023800 Sobic003G024450--Sobic010G149000 Sobic003G024450--Sobic004G092950 Sobic003G024450--Sobic003G388201 Sobic003G024450--Sobic001G202800 Sobic003G024450--Sobic002G117800 Sobic003G365450 Sobic003G365450 Sobic003G024450--Sobic003G365450 Sobic003G024450--Sobic008G060800 Sobic009G011050--Sobic006G239200 Sobic009G011050--Sobic001G202800 Sobic009G011050--Sobic001G208133 Sobic003G311300 Sobic003G311300 Sobic009G011050--Sobic003G311300 Sobic009G011050--Sobic006G037800 Sobic009G011050--Sobic002G142400 Sobic009G011050--Sobic007G134700 Sobic009G011050--Sobic008G060800 Sobic006G038050 Sobic006G038050 Sobic009G011050--Sobic006G038050 Sobic004G039000--Sobic001G208133 Sobic004G039000--Sobic001G202800 Sobic004G039000--Sobic004G092950 Sobic004G039000--Sobic002G117800 Sobic002G428301 Sobic002G428301 Sobic004G039000--Sobic002G428301 Sobic003G254850 Sobic003G254850 Sobic004G039000--Sobic003G254850 Sobic004G039000--Sobic009G011050 Sobic004G039000--Sobic006G239200 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic004G039000--Sobic002G325000 Sobic008G060800--Sobic009G011050 Sobic008G060800--Sobic004G143550 Sobic008G060800--Sobic003G024450 Sobic008G060800--Sobic001G202800 Sobic008G060800--Sobic002G117800 Sobic008G060800--Sobic010G149000 Sobic008G060800--Sobic003G388201 Sobic008G060800--Sobic004G092950 Sobic008G060800--Sobic004G023800 Sobic001G208133--Sobic003G311300 Sobic001G208133--Sobic006G239200 Sobic001G208133--Sobic009G011050 Sobic003G031300 Sobic003G031300 Sobic001G208133--Sobic003G031300 Sobic001G208133--Sobic006G038050 Sobic001G208133--Sobic001G202800 Sobic004G079400 Sobic004G079400 Sobic001G208133--Sobic004G079400 Sobic001G208133--Sobic007G134700 Sobic001G208133--Sobic004G039000
Octagon: transcription factors


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