Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G092950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RLN4
Pfam PF13966
Panther DB PTHR25952 PTHR25952:SF206
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G10000 : Ribonuclease H-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g06730.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G024450 - -
2 Sobic.001G440401 - -
3 Sobic.009G190100 expressed protein -
4 Sobic.002G117800 - -
5 Sobic.002G025900 expressed protein -
6 Sobic.003G348300 expressed protein -
7 Sobic.004G023800 verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G055700 splicing factor, arginine/serine-rich, putative, expressed K12896: splicing factor, arginine/serine-rich 7
9 Sobic.003G288700 expressed protein -
10 Sobic.010G149000 - -
11 Sobic.004G039000 expressed protein -
12 Sobic.001G202800 - -
13 Sobic.008G056000 nifU, putative, expressed -
14 Sobic.003G365450 - -
15 Sobic.008G060800 expressed protein -
16 Sobic.003G361150 - -
17 Sobic.008G133750 - -
18 Sobic.004G143550 - -
19 Sobic.008G157400 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
20 Sobic.007G134700 formin, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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