Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G023800.1
Synonym AtRLP22, Sb04g002110, RLP22
Functional annotation verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed
UniProt C5XT61
Pfam PF00560 PF13855
Panther DB PTHR27004 PTHR27004:SF37
NCBI CDD KOG0472; Leucine-rich repeat protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G32660 : receptor like protein 22
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g04070.1 : verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.008G133750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic004G023800--Sobic003G024450 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic004G023800--Sobic004G143550 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic004G023800--Sobic003G288700 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic004G023800--Sobic006G065000 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic004G023800--Sobic008G053800 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic004G023800--Sobic001G440401 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic004G023800--Sobic004G092950 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic004G023800--Sobic009G184450 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic004G023800--Sobic010G149000 Sobic003G024450--Sobic004G143550 Sobic003G024450--Sobic004G023800 Sobic003G024450--Sobic010G149000 Sobic003G024450--Sobic004G092950 Sobic003G388201 Sobic003G388201 Sobic003G024450--Sobic003G388201 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic003G024450--Sobic001G202800 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic003G024450--Sobic002G117800 Sobic003G365450 Sobic003G365450 Sobic003G024450--Sobic003G365450 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic003G024450--Sobic008G060800 Sobic004G143550--Sobic003G024450 Sobic004G143550--Sobic004G023800 Sobic004G143550--Sobic003G388201 Sobic004G143550--Sobic010G149000 Sobic004G194600 Sobic004G194600 Sobic004G143550--Sobic004G194600 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic004G143550--Sobic004G207733 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic004G143550--Sobic001G045900 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic004G143550--Sobic002G147550 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic004G143550--Sobic010G225175 Sobic003G288700--Sobic001G440401 Sobic008G167900 Sobic008G167900 Sobic003G288700--Sobic008G167900 Sobic003G288700--Sobic009G184450 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic003G288700--Sobic008G056000 Sobic003G288700--Sobic004G023800 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic003G288700--Sobic001G072100 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic003G288700--Sobic002G168750 Sobic003G288700--Sobic006G065000 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic003G288700--Sobic002G025900 Sobic006G065000--Sobic009G184450 Sobic006G065000--Sobic004G023800 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic006G065000--Sobic001G087850 Sobic006G065000--Sobic003G288700 Sobic006G065000--Sobic008G056000 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic006G065000--Sobic001G504300 Sobic006G064900 Sobic006G064900 Sobic006G065000--Sobic006G064900 Sobic006G065000--Sobic001G440401 Sobic006G065000--Sobic004G207733 Sobic008G053800--Sobic004G023800 Sobic003G198850 Sobic003G198850 Sobic008G053800--Sobic003G198850 Sobic008G053800--Sobic003G288700 Sobic008G053800--Sobic008G056000 Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic008G053800--Sobic003G340500 Sobic008G053800--Sobic001G440401 Sobic008G053800--Sobic006G065000 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic008G053800--Sobic002G246100 Sobic008G053800--Sobic003G024450 Sobic001G440401--Sobic003G288700 Sobic001G440401--Sobic008G056000 Sobic001G440401--Sobic008G167900 Sobic001G440401--Sobic002G168750 Sobic001G440401--Sobic010G149000 Sobic001G440401--Sobic002G025900 Sobic001G440401--Sobic004G092950 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic001G440401--Sobic007G134700 Sobic001G440401--Sobic004G023800 Sobic004G092950--Sobic003G024450 Sobic004G092950--Sobic001G440401 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic004G092950--Sobic009G190100 Sobic004G092950--Sobic002G117800 Sobic004G092950--Sobic002G025900 Sobic003G348300 Sobic003G348300 Sobic004G092950--Sobic003G348300 Sobic004G092950--Sobic004G023800 Sobic009G055700 Sobic009G055700 Sobic004G092950--Sobic009G055700 Sobic004G092950--Sobic003G288700 Sobic009G184450--Sobic008G167900 Sobic009G184450--Sobic003G288700 Sobic009G184450--Sobic006G065000 Sobic009G184450--Sobic004G023800 Sobic009G184450--Sobic001G087850 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic009G184450--Sobic001G258700 Sobic009G184450--Sobic006G064900 Sobic009G184450--Sobic001G440401 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic009G184450--Sobic010G123650 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic010G149000--Sobic006G037800 Sobic010G149000--Sobic007G134700 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic010G149000--Sobic002G154450 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic010G149000--Sobic010G052100 Sobic010G149000--Sobic003G024450 Sobic010G149000--Sobic008G056000 Sobic010G149000--Sobic010G225175 Sobic010G149000--Sobic001G202800 Sobic010G149000--Sobic004G143550
Octagon: transcription factors


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