Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G065000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PKL6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G184450 - -
2 Sobic.004G023800 verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G087850 - -
4 Sobic.003G288700 expressed protein -
5 Sobic.008G056000 nifU, putative, expressed -
6 Sobic.001G504300 - -
7 Sobic.006G064900 - -
8 Sobic.001G440401 - -
9 Sobic.004G207733 - -
10 Sobic.010G123650 - -
11 Sobic.008G167900 - -
12 Sobic.002G147550 - -
13 Sobic.004G143550 - -
14 Sobic.003G024450 - -
15 Sobic.010G149000 - -
16 Sobic.006G223601 - -
17 Sobic.010G244800 expressed protein -
18 Sobic.002G025900 expressed protein -
19 Sobic.010G174000 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase protein, putative, expressed K05933: aminocyclopropanecarboxylate oxidase
20 Sobic.001G045900 polygalacturonase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic006G065000--Sobic009G184450 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic006G065000--Sobic004G023800 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic006G065000--Sobic001G087850 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic006G065000--Sobic003G288700 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic006G065000--Sobic008G056000 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic006G065000--Sobic001G504300 Sobic006G064900 Sobic006G064900 Sobic006G065000--Sobic006G064900 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic006G065000--Sobic001G440401 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic006G065000--Sobic004G207733 Sobic008G167900 Sobic008G167900 Sobic009G184450--Sobic008G167900 Sobic009G184450--Sobic003G288700 Sobic009G184450--Sobic006G065000 Sobic009G184450--Sobic004G023800 Sobic009G184450--Sobic001G087850 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic009G184450--Sobic001G258700 Sobic009G184450--Sobic006G064900 Sobic009G184450--Sobic001G440401 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic009G184450--Sobic010G123650 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic004G023800--Sobic003G024450 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic004G023800--Sobic004G143550 Sobic004G023800--Sobic003G288700 Sobic004G023800--Sobic006G065000 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic004G023800--Sobic008G053800 Sobic004G023800--Sobic001G440401 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic004G023800--Sobic004G092950 Sobic004G023800--Sobic009G184450 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic004G023800--Sobic010G149000 Sobic001G087850--Sobic010G123650 Sobic001G087850--Sobic004G207733 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic001G087850--Sobic001G436450 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic001G087850--Sobic002G147550 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic001G087850--Sobic006G176900 Sobic003G404050 Sobic003G404050 Sobic001G087850--Sobic003G404050 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic001G087850--Sobic001G045900 Sobic004G187701 Sobic004G187701 Sobic001G087850--Sobic004G187701 Sobic001G087850--Sobic006G065000 Sobic003G288700--Sobic001G440401 Sobic003G288700--Sobic008G167900 Sobic003G288700--Sobic009G184450 Sobic003G288700--Sobic008G056000 Sobic003G288700--Sobic004G023800 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic003G288700--Sobic001G072100 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic003G288700--Sobic002G168750 Sobic003G288700--Sobic006G065000 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic003G288700--Sobic002G025900 Sobic008G056000--Sobic001G440401 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic008G056000--Sobic007G134700 Sobic008G056000--Sobic010G149000 Sobic008G056000--Sobic003G288700 Sobic008G056000--Sobic002G025900 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic008G056000--Sobic003G251000 Sobic008G056000--Sobic002G168750 Sobic008G056000--Sobic006G065000 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic008G056000--Sobic006G037800 Sobic003G414200 Sobic003G414200 Sobic001G504300--Sobic003G414200 Sobic004G215650 Sobic004G215650 Sobic001G504300--Sobic004G215650 Sobic001G504300--Sobic006G064900 Sobic001G504300--Sobic001G087850 Sobic001G504300--Sobic010G123650 Sobic001G504300--Sobic006G065000 Sobic004G194600 Sobic004G194600 Sobic001G504300--Sobic004G194600 Sobic004G140900 Sobic004G140900 Sobic001G504300--Sobic004G140900 Sobic001G504300--Sobic004G207733 Sobic006G064900--Sobic001G504300 Sobic006G064900--Sobic002G025900 Sobic006G064900--Sobic006G065000 Sobic006G064900--Sobic008G056000 Sobic006G064900--Sobic009G184450 Sobic006G064900--Sobic003G288700 Sobic006G064900--Sobic001G440401 Sobic006G064900--Sobic008G167900 Sobic006G064900--Sobic001G087850 Sobic001G440401--Sobic003G288700 Sobic001G440401--Sobic008G056000 Sobic001G440401--Sobic008G167900 Sobic001G440401--Sobic002G168750 Sobic001G440401--Sobic010G149000 Sobic001G440401--Sobic002G025900 Sobic001G440401--Sobic004G092950 Sobic001G440401--Sobic007G134700 Sobic001G440401--Sobic004G023800 Sobic004G207733--Sobic001G087850 Sobic004G207733--Sobic001G045900 Sobic004G207733--Sobic006G176900 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic004G207733--Sobic004G127733 Sobic004G207733--Sobic010G123650 Sobic004G207733--Sobic002G147550 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic004G207733--Sobic003G112100 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic004G207733--Sobic002G154450 Sobic004G207733--Sobic001G436450
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.