Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G147550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W3Z7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G176900 - -
2 Sobic.008G116800 expressed protein -
3 Sobic.003G406850 - -
4 Sobic.006G223601 - -
5 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
6 Sobic.002G246100 - -
7 Sobic.004G207733 - -
8 Sobic.006G223101 - -
9 Sobic.001G087850 - -
10 Sobic.007G004400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
11 Sobic.009G079400 EMB2261, putative, expressed -
12 Sobic.003G404050 - -
13 Sobic.010G123650 - -
14 Sobic.003G335100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G011100 - -
16 Sobic.001G436450 - -
17 Sobic.002G154450 - -
18 Sobic.008G115200 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G187701 - -
20 Sobic.001G045900 polygalacturonase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic002G147550--Sobic006G176900 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic002G147550--Sobic008G116800 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic002G147550--Sobic003G406850 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic002G147550--Sobic006G223601 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic002G147550--Sobic003G112100 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic002G147550--Sobic002G246100 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic002G147550--Sobic004G207733 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic002G147550--Sobic006G223101 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic002G147550--Sobic001G087850 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic006G176900--Sobic004G127733 Sobic006G176900--Sobic003G112100 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic006G176900--Sobic001G045900 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic006G176900--Sobic002G154450 Sobic006G176900--Sobic004G207733 Sobic006G176900--Sobic002G147550 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic006G176900--Sobic008G119600 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic006G176900--Sobic004G129400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic006G176900--Sobic007G127200 Sobic008G116800--Sobic002G147550 Sobic008G116800--Sobic003G112100 Sobic008G116800--Sobic003G406850 Sobic003G404050 Sobic003G404050 Sobic008G116800--Sobic003G404050 Sobic008G116800--Sobic006G176900 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic008G116800--Sobic008G156800 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic008G116800--Sobic001G205950 Sobic008G116800--Sobic004G129400 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic008G116800--Sobic010G123650 Sobic003G406850--Sobic006G223601 Sobic003G406850--Sobic003G112100 Sobic003G406850--Sobic002G147550 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic003G406850--Sobic003G335100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic003G406850--Sobic007G004400 Sobic003G406850--Sobic006G223101 Sobic003G406850--Sobic008G116800 Sobic003G406850--Sobic003G404050 Sobic003G406850--Sobic006G176900 Sobic006G223601--Sobic006G223101 Sobic006G223601--Sobic003G335100 Sobic006G223601--Sobic003G406850 Sobic006G223601--Sobic002G147550 Sobic006G223601--Sobic003G112100 Sobic006G223601--Sobic007G004400 Sobic006G223601--Sobic006G176900 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic006G223601--Sobic008G115200 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic006G223601--Sobic006G149900 Sobic003G112100--Sobic004G129400 Sobic003G112100--Sobic006G176900 Sobic003G112100--Sobic008G156800 Sobic003G112100--Sobic003G406850 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic003G112100--Sobic003G394701 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic003G112100--Sobic003G169550 Sobic003G112100--Sobic003G335100 Sobic003G112100--Sobic002G147550 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic003G112100--Sobic001G323101 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic002G246100--Sobic003G244250 Sobic002G246100--Sobic002G147550 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic002G246100--Sobic001G436450 Sobic002G246100--Sobic006G176900 Sobic009G079400 Sobic009G079400 Sobic002G246100--Sobic009G079400 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic002G246100--Sobic010G011100 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic002G246100--Sobic001G016050 Sobic004G260250 Sobic004G260250 Sobic002G246100--Sobic004G260250 Sobic007G190600 Sobic007G190600 Sobic002G246100--Sobic007G190600 Sobic004G207733--Sobic001G087850 Sobic004G207733--Sobic001G045900 Sobic004G207733--Sobic006G176900 Sobic004G207733--Sobic004G127733 Sobic004G207733--Sobic010G123650 Sobic004G207733--Sobic002G147550 Sobic004G207733--Sobic003G112100 Sobic004G207733--Sobic002G154450 Sobic004G207733--Sobic001G436450 Sobic006G223101--Sobic006G223601 Sobic006G223101--Sobic003G335100 Sobic006G223101--Sobic007G004400 Sobic006G223101--Sobic003G406850 Sobic006G223101--Sobic008G115200 Sobic006G223101--Sobic002G147550 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic006G223101--Sobic001G229850 Sobic006G223101--Sobic003G112100 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic006G223101--Sobic001G431600 Sobic001G087850--Sobic010G123650 Sobic001G087850--Sobic004G207733 Sobic001G087850--Sobic001G436450 Sobic001G087850--Sobic002G147550 Sobic001G087850--Sobic006G176900 Sobic001G087850--Sobic003G404050 Sobic001G087850--Sobic001G045900 Sobic004G187701 Sobic004G187701 Sobic001G087850--Sobic004G187701 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic001G087850--Sobic006G065000
Octagon: transcription factors


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