Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G112100.1
Synonym Sb03g009420, EXPA17, ATHEXPALPHA1.13, ATEXPA17, ATEXP17
Functional annotation expansin precursor, putative, expressed
UniProt C5XFQ8
Pfam PF03330 PF01357
Panther DB PTHR31867 PTHR31867:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G01630 : expansin A17
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g14660.1 : expansin precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023911 , Zm00025a027043 , Zm00025a043994 , Zm00025a008818 , Zm00025a024073 , Zm00025a019850 , Zm00025a019851 , Zm00025a019852 , Zm00025a019849 , Zm00025a016421 , Zm00025a053441
Brachypodium KQJ96855 , KQK05753 , KQK03594 , KQK03595 , KQK12421
Barley HORVU3Hr1G076670.2 , HORVU1Hr1G069830.2 , HORVU1Hr1G069830.1 , HORVU1Hr1G069830.7 , HORVU1Hr1G069830.6 , HORVU1Hr1G069830.4 , HORVU3Hr1G034030.4 , HORVU3Hr1G076640.2 , HORVU3Hr1G076640.3 , HORVU3Hr1G076640.1 , HORVU3Hr1G076640.4 , HORVU5Hr1G113580.5 , HORVU5Hr1G113580.4 , HORVU2Hr1G093690.1 , HORVU2Hr1G093690.2 , HORVU3Hr1G076670.1 , HORVU5Hr1G113580.6 , HORVU5Hr1G113580.3 , HORVU5Hr1G113580.2 , HORVU3Hr1G034030.3 , HORVU3Hr1G034030.2 , HORVU3Hr1G034030.1
Wheat TraesCS3B02G348000 , TraesCS3D02G313200 , TraesCS2A02G393700 , TraesCS3D02G313400 , TraesCS5D02G494800 , TraesCS5A02G481200 , TraesCS1D02G299700 , TraesCS1A02G300200 , TraesCS1A02G300200 , TraesCS2B02G411700 , TraesCS3A02G317900 , TraesCS1B02G310300 , TraesCS3D02G175800 , TraesCS7B02G293800 , TraesCS6B02G336500 , TraesCS7D02G387400 , TraesCS7D02G387400 , TraesCS5B02G494400 , TraesCS3A02G165900 , TraesCS3D02G176000 , TraesCS3B02G200100 , TraesCS3D02G313300 , TraesCS3A02G165600 , TraesCS3B02G199900 , TraesCS2D02G391600
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic003G112100--Sobic004G129400 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic003G112100--Sobic006G176900 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic003G112100--Sobic008G156800 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic003G112100--Sobic003G406850 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic003G112100--Sobic003G394701 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic003G112100--Sobic003G169550 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic003G112100--Sobic003G335100 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic003G112100--Sobic002G147550 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic003G112100--Sobic001G323101 Sobic004G129400--Sobic003G112100 Sobic004G129400--Sobic003G394701 Sobic004G129400--Sobic003G169550 Sobic004G129400--Sobic008G156800 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic004G129400--Sobic004G274300 Sobic004G129400--Sobic006G176900 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic004G129400--Sobic001G255866 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic004G129400--Sobic007G046700 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G129400--Sobic004G133201 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic006G176900--Sobic004G127733 Sobic006G176900--Sobic003G112100 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic006G176900--Sobic001G045900 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic006G176900--Sobic002G154450 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic006G176900--Sobic004G207733 Sobic006G176900--Sobic002G147550 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic006G176900--Sobic008G119600 Sobic006G176900--Sobic004G129400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic006G176900--Sobic007G127200 Sobic008G156800--Sobic003G112100 Sobic008G156800--Sobic004G129400 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic008G156800--Sobic001G205950 Sobic008G156800--Sobic003G169550 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic008G156800--Sobic007G054200 Sobic008G156800--Sobic003G394701 Sobic006G258100 Sobic006G258100 Sobic008G156800--Sobic006G258100 Sobic008G156800--Sobic001G323101 Sobic008G156800--Sobic007G046700 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic003G406850--Sobic006G223601 Sobic003G406850--Sobic003G112100 Sobic003G406850--Sobic002G147550 Sobic003G406850--Sobic003G335100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic003G406850--Sobic007G004400 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic003G406850--Sobic006G223101 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic003G406850--Sobic008G116800 Sobic003G404050 Sobic003G404050 Sobic003G406850--Sobic003G404050 Sobic003G406850--Sobic006G176900 Sobic003G394701--Sobic007G046700 Sobic003G394701--Sobic001G255866 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic003G394701--Sobic006G107766 Sobic003G394701--Sobic004G129400 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic004G133201 Sobic003G394701--Sobic004G274300 Sobic003G394701--Sobic003G169550 Sobic003G394701--Sobic003G112100 Sobic003G169550--Sobic004G133201 Sobic003G169550--Sobic004G129400 Sobic003G169550--Sobic003G394701 Sobic003G169550--Sobic004G274300 Sobic003G169550--Sobic003G112100 Sobic003G169550--Sobic007G046700 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic003G169550--Sobic004G134400 Sobic003G169550--Sobic001G323101 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic003G169550--Sobic009G079600 Sobic003G335100--Sobic007G004400 Sobic003G335100--Sobic006G223601 Sobic003G335100--Sobic006G223101 Sobic003G335100--Sobic003G406850 Sobic003G335100--Sobic003G112100 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic003G335100--Sobic002G074900 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic003G335100--Sobic008G115200 Sobic003G335100--Sobic006G176900 Sobic003G335100--Sobic008G119600 Sobic002G147550--Sobic006G176900 Sobic002G147550--Sobic008G116800 Sobic002G147550--Sobic003G406850 Sobic002G147550--Sobic006G223601 Sobic002G147550--Sobic003G112100 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic002G147550--Sobic002G246100 Sobic002G147550--Sobic004G207733 Sobic002G147550--Sobic006G223101 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic002G147550--Sobic001G087850 Sobic001G323101--Sobic009G079600 Sobic001G323101--Sobic004G134400 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic001G323101--Sobic003G187600 Sobic001G323101--Sobic004G274300 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic001G323101--Sobic007G132650 Sobic001G323101--Sobic003G112100 Sobic001G323101--Sobic004G129400 Sobic001G323101--Sobic003G169550 Sobic001G323101--Sobic007G127200
Octagon: transcription factors


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