Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G129400.1
Synonym Sb04g011210
Functional annotation pectinesterase, putative, expressed
UniProt A0A194YPA5
Pfam PF04043 PF01095
Panther DB PTHR31707 PTHR31707:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004857; enzyme inhibitor activity GO:0005618cell wall


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G49220 : Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g18650.1 : pectinesterase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019737 , Zm00025a005792 , Zm00025a049134 , Zm00025a030727
Brachypodium KQK03643 , KQJ98516
Barley HORVU3Hr1G077630.5 , HORVU3Hr1G077630.1 , HORVU3Hr1G077630.2 , HORVU3Hr1G077630.3 , HORVU6Hr1G084030.4 , HORVU6Hr1G084030.1 , HORVU6Hr1G084030.3 , HORVU6Hr1G084030.2 , HORVU2Hr1G018710.4 , HORVU2Hr1G018710.1 , HORVU2Hr1G018710.3
Wheat TraesCS6B02G383700 , TraesCS2A02G109600 , TraesCS3D02G318800 , TraesCS2D02G109800 , TraesCS2B02G127600 , TraesCS3B02G354300 , TraesCS3A02G325500
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic004G129400--Sobic003G112100 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic004G129400--Sobic003G394701 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic004G129400--Sobic003G169550 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic004G129400--Sobic008G156800 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic004G129400--Sobic004G274300 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic004G129400--Sobic006G176900 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic004G129400--Sobic001G255866 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic004G129400--Sobic007G046700 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G129400--Sobic004G133201 Sobic003G112100--Sobic004G129400 Sobic003G112100--Sobic006G176900 Sobic003G112100--Sobic008G156800 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic003G112100--Sobic003G406850 Sobic003G112100--Sobic003G394701 Sobic003G112100--Sobic003G169550 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic003G112100--Sobic003G335100 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic003G112100--Sobic002G147550 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic003G112100--Sobic001G323101 Sobic003G394701--Sobic007G046700 Sobic003G394701--Sobic001G255866 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic003G394701--Sobic006G107766 Sobic003G394701--Sobic004G129400 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic004G133201 Sobic003G394701--Sobic004G274300 Sobic003G394701--Sobic003G169550 Sobic003G394701--Sobic003G112100 Sobic003G169550--Sobic004G133201 Sobic003G169550--Sobic004G129400 Sobic003G169550--Sobic003G394701 Sobic003G169550--Sobic004G274300 Sobic003G169550--Sobic003G112100 Sobic003G169550--Sobic007G046700 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic003G169550--Sobic004G134400 Sobic003G169550--Sobic001G323101 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic003G169550--Sobic009G079600 Sobic008G156800--Sobic003G112100 Sobic008G156800--Sobic004G129400 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic008G156800--Sobic001G205950 Sobic008G156800--Sobic003G169550 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic008G156800--Sobic007G054200 Sobic008G156800--Sobic003G394701 Sobic006G258100 Sobic006G258100 Sobic008G156800--Sobic006G258100 Sobic008G156800--Sobic001G323101 Sobic008G156800--Sobic007G046700 Sobic004G274300--Sobic004G134400 Sobic004G274300--Sobic009G079600 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic004G274300--Sobic003G187600 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic004G274300--Sobic003G260500 Sobic004G274300--Sobic004G133201 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic004G274300--Sobic007G132650 Sobic004G274300--Sobic006G107766 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic004G274300--Sobic007G127200 Sobic004G274300--Sobic003G394701 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic006G176900--Sobic004G127733 Sobic006G176900--Sobic003G112100 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic006G176900--Sobic001G045900 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic006G176900--Sobic002G154450 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic006G176900--Sobic004G207733 Sobic006G176900--Sobic002G147550 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic006G176900--Sobic008G119600 Sobic006G176900--Sobic004G129400 Sobic006G176900--Sobic007G127200 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic001G255866--Sobic007G090433 Sobic001G255866--Sobic009G257000 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic001G255866--Sobic001G420150 Sobic001G255866--Sobic003G394701 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic001G255866--Sobic001G423200 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic001G255866--Sobic007G116300 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic001G255866--Sobic001G093400 Sobic001G255866--Sobic006G107766 Sobic001G255866--Sobic004G133201 Sobic007G046700--Sobic003G394701 Sobic007G046700--Sobic007G054200 Sobic007G046700--Sobic003G187600 Sobic007G046700--Sobic004G133201 Sobic007G046700--Sobic009G257000 Sobic007G046700--Sobic006G107766 Sobic005G118500 Sobic005G118500 Sobic007G046700--Sobic005G118500 Sobic007G046700--Sobic004G129400 Sobic007G046700--Sobic004G274300 Sobic004G133201--Sobic004G274300 Sobic004G133201--Sobic006G107766 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic004G133201--Sobic008G115200 Sobic004G133201--Sobic003G169550 Sobic004G133201--Sobic003G394701 Sobic004G133201--Sobic007G046700 Sobic004G133201--Sobic004G134400 Sobic004G133201--Sobic001G255866 Sobic004G133201--Sobic007G090433
Octagon: transcription factors


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