Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G133201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RMQ5 , C6JRT9
Pfam PF14291
Panther DB PTHR11697
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G19260 : TTF-type zinc finger protein with HAT dimerisation domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g07950.1 : NB-ARC domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G107766 - -
3 Sobic.008G115200 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G169550 - -
5 Sobic.003G394701 - -
6 Sobic.007G046700 - -
7 Sobic.004G134400 - -
8 Sobic.001G255866 - -
9 Sobic.007G090433 - -
10 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -
11 Sobic.004G276600 expressed protein -
12 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
13 Sobic.009G079600 - -
14 Sobic.009G257000 - -
15 Sobic.003G260500 - -
16 Sobic.001G420150 - -
17 Sobic.001G093400 - -
18 Sobic.004G127766 - -
19 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
20 Sobic.002G142950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic004G133201--Sobic004G274300 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic004G133201--Sobic006G107766 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic004G133201--Sobic008G115200 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic004G133201--Sobic003G169550 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic004G133201--Sobic003G394701 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic004G133201--Sobic007G046700 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic004G133201--Sobic004G134400 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic004G133201--Sobic001G255866 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic004G133201--Sobic007G090433 Sobic004G274300--Sobic004G134400 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic004G274300--Sobic009G079600 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic004G274300--Sobic003G187600 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic004G274300--Sobic003G260500 Sobic004G274300--Sobic004G133201 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic004G274300--Sobic007G132650 Sobic004G274300--Sobic006G107766 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic004G274300--Sobic007G127200 Sobic004G274300--Sobic003G394701 Sobic006G107766--Sobic003G394701 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic006G107766--Sobic006G035350 Sobic006G107766--Sobic003G260500 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic006G107766--Sobic008G119600 Sobic006G107766--Sobic003G187600 Sobic006G107766--Sobic004G274300 Sobic006G107766--Sobic004G133201 Sobic006G107766--Sobic001G255866 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G107766--Sobic004G115100 Sobic008G115200--Sobic004G133201 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G115200--Sobic007G004400 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic008G115200--Sobic010G136700 Sobic008G115200--Sobic006G107766 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic008G115200--Sobic006G176900 Sobic008G115200--Sobic008G119600 Sobic008G115200--Sobic003G394701 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic008G115200--Sobic006G223101 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic008G115200--Sobic002G074900 Sobic003G169550--Sobic004G133201 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic003G169550--Sobic004G129400 Sobic003G169550--Sobic003G394701 Sobic003G169550--Sobic004G274300 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic003G169550--Sobic003G112100 Sobic003G169550--Sobic007G046700 Sobic003G169550--Sobic004G134400 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic003G169550--Sobic001G323101 Sobic003G169550--Sobic009G079600 Sobic003G394701--Sobic007G046700 Sobic003G394701--Sobic001G255866 Sobic003G394701--Sobic006G107766 Sobic003G394701--Sobic004G129400 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic004G133201 Sobic003G394701--Sobic004G274300 Sobic003G394701--Sobic003G169550 Sobic003G394701--Sobic003G112100 Sobic007G046700--Sobic003G394701 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic007G046700--Sobic007G054200 Sobic007G046700--Sobic003G187600 Sobic007G046700--Sobic004G133201 Sobic007G046700--Sobic009G257000 Sobic007G046700--Sobic006G107766 Sobic005G118500 Sobic005G118500 Sobic007G046700--Sobic005G118500 Sobic007G046700--Sobic004G129400 Sobic007G046700--Sobic004G274300 Sobic004G134400--Sobic009G079600 Sobic004G134400--Sobic004G274300 Sobic004G134400--Sobic007G127200 Sobic004G134400--Sobic003G187600 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic004G134400--Sobic010G247750 Sobic004G134400--Sobic003G260500 Sobic004G134400--Sobic001G323101 Sobic004G134400--Sobic004G133201 Sobic004G134400--Sobic007G132650 Sobic001G255866--Sobic007G090433 Sobic001G255866--Sobic009G257000 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic001G255866--Sobic001G420150 Sobic001G255866--Sobic003G394701 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic001G255866--Sobic001G423200 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic001G255866--Sobic007G116300 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic001G255866--Sobic001G093400 Sobic001G255866--Sobic006G107766 Sobic001G255866--Sobic004G133201 Sobic007G090433--Sobic001G255866 Sobic007G090433--Sobic007G116300 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic007G090433--Sobic004G276600 Sobic007G090433--Sobic009G257000 Sobic007G090433--Sobic001G420150 Sobic007G090433--Sobic001G093400 Sobic007G090433--Sobic003G394701 Sobic007G090433--Sobic001G423200 Sobic007G090433--Sobic004G133201
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.