Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G115200.3,Sobic.008G115200.1,Sobic.008G115200.2
Synonym Sb08g016880
Functional annotation OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5YPA3
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF126
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G44220 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g02280.1 : OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016067
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G115200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.007G046700 - -
20 Sobic.007G132650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic008G115200--Sobic004G133201 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G115200--Sobic007G004400 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic008G115200--Sobic010G136700 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic008G115200--Sobic006G107766 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic008G115200--Sobic006G176900 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic008G115200--Sobic008G119600 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic008G115200--Sobic003G394701 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic008G115200--Sobic006G223101 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic008G115200--Sobic002G074900 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic004G133201--Sobic004G274300 Sobic004G133201--Sobic006G107766 Sobic004G133201--Sobic008G115200 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic004G133201--Sobic003G169550 Sobic004G133201--Sobic003G394701 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic004G133201--Sobic007G046700 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic004G133201--Sobic004G134400 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic004G133201--Sobic001G255866 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic004G133201--Sobic007G090433 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic007G004400--Sobic003G335100 Sobic007G004400--Sobic008G119600 Sobic007G004400--Sobic008G115200 Sobic007G004400--Sobic006G223101 Sobic007G004400--Sobic002G074900 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic007G004400--Sobic003G406850 Sobic007G004400--Sobic006G176900 Sobic007G004400--Sobic010G136700 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic007G004400--Sobic006G223601 Sobic010G136700--Sobic008G119600 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic010G136700--Sobic001G016050 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic010G136700--Sobic010G132400 Sobic010G136700--Sobic008G115200 Sobic010G136700--Sobic006G107766 Sobic010G136700--Sobic007G004400 Sobic010G136700--Sobic007G090433 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic010G136700--Sobic005G090800 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic010G136700--Sobic002G212900 Sobic006G107766--Sobic003G394701 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic006G107766--Sobic006G035350 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic006G107766--Sobic003G260500 Sobic006G107766--Sobic008G119600 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic006G107766--Sobic003G187600 Sobic006G107766--Sobic004G274300 Sobic006G107766--Sobic004G133201 Sobic006G107766--Sobic001G255866 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G107766--Sobic004G115100 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic006G176900--Sobic004G127733 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic006G176900--Sobic003G112100 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic006G176900--Sobic001G045900 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic006G176900--Sobic002G154450 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic006G176900--Sobic004G207733 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic006G176900--Sobic002G147550 Sobic006G176900--Sobic008G119600 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic006G176900--Sobic004G129400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic006G176900--Sobic007G127200 Sobic008G119600--Sobic007G004400 Sobic008G119600--Sobic006G107766 Sobic008G119600--Sobic010G136700 Sobic008G119600--Sobic006G176900 Sobic008G119600--Sobic003G187600 Sobic008G119600--Sobic006G035350 Sobic008G119600--Sobic008G115200 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic008G119600--Sobic003G029150 Sobic008G119600--Sobic010G132400 Sobic003G394701--Sobic007G046700 Sobic003G394701--Sobic001G255866 Sobic003G394701--Sobic006G107766 Sobic003G394701--Sobic004G129400 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic004G133201 Sobic003G394701--Sobic004G274300 Sobic003G394701--Sobic003G169550 Sobic003G394701--Sobic003G112100 Sobic006G223101--Sobic006G223601 Sobic006G223101--Sobic003G335100 Sobic006G223101--Sobic007G004400 Sobic006G223101--Sobic003G406850 Sobic006G223101--Sobic008G115200 Sobic006G223101--Sobic002G147550 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic006G223101--Sobic001G229850 Sobic006G223101--Sobic003G112100 Sobic001G431600 Sobic001G431600 Sobic006G223101--Sobic001G431600 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic007G004400 Sobic002G074900--Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic008G115200 Sobic002G074900--Sobic003G335100 Sobic002G074900--Sobic008G119600 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic002G074900--Sobic001G340100 Sobic002G074900--Sobic004G133201 Sobic002G074900--Sobic003G169550
Octagon: transcription factors


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