Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G136700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YIY7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G119600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
2 Sobic.001G016050 - -
3 Sobic.010G132400 Os6bglu24 - beta-glucosidase homologue, similar to G. max isohydroxyurate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
4 Sobic.008G115200 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G107766 - -
6 Sobic.007G004400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
7 Sobic.007G090433 - -
8 Sobic.005G090800 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G212900 expressed protein -
10 Sobic.010G011100 - -
11 Sobic.002G134800 - -
12 Sobic.001G249800 no apical meristem protein, expressed -
13 Sobic.001G255866 - -
14 Sobic.006G176900 - -
15 Sobic.004G133201 - -
16 Sobic.003G322600 coiled-coil domain-containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
18 Sobic.003G260500 - -
19 Sobic.004G276600 expressed protein -
20 Sobic.003G394701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic010G136700--Sobic008G119600 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic010G136700--Sobic001G016050 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic010G136700--Sobic010G132400 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic010G136700--Sobic008G115200 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic010G136700--Sobic006G107766 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic010G136700--Sobic007G004400 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic010G136700--Sobic007G090433 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic010G136700--Sobic005G090800 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic010G136700--Sobic002G212900 Sobic008G119600--Sobic007G004400 Sobic008G119600--Sobic006G107766 Sobic008G119600--Sobic010G136700 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic008G119600--Sobic006G176900 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic008G119600--Sobic003G187600 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic008G119600--Sobic006G035350 Sobic008G119600--Sobic008G115200 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic008G119600--Sobic003G029150 Sobic008G119600--Sobic010G132400 Sobic001G016050--Sobic010G136700 Sobic001G016050--Sobic005G090800 Sobic001G016050--Sobic007G090433 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic001G016050--Sobic010G011100 Sobic001G016050--Sobic008G115200 Sobic001G016050--Sobic010G132400 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic001G016050--Sobic004G276600 Sobic001G016050--Sobic008G119600 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic001G016050--Sobic001G255866 Sobic010G132400--Sobic010G136700 Sobic010G132400--Sobic008G119600 Sobic010G132400--Sobic006G035350 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic010G132400--Sobic005G154600 Sobic010G132400--Sobic006G176900 Sobic010G132400--Sobic004G276600 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic010G132400--Sobic004G127733 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic010G132400--Sobic002G154450 Sobic010G132400--Sobic008G115200 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic008G115200--Sobic004G133201 Sobic008G115200--Sobic007G004400 Sobic008G115200--Sobic010G136700 Sobic008G115200--Sobic006G107766 Sobic008G115200--Sobic006G176900 Sobic008G115200--Sobic008G119600 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic008G115200--Sobic003G394701 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic008G115200--Sobic006G223101 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic008G115200--Sobic002G074900 Sobic006G107766--Sobic003G394701 Sobic006G107766--Sobic006G035350 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic006G107766--Sobic003G260500 Sobic006G107766--Sobic008G119600 Sobic006G107766--Sobic003G187600 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic006G107766--Sobic004G274300 Sobic006G107766--Sobic004G133201 Sobic006G107766--Sobic001G255866 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G107766--Sobic004G115100 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic007G004400--Sobic003G335100 Sobic007G004400--Sobic008G119600 Sobic007G004400--Sobic008G115200 Sobic007G004400--Sobic006G223101 Sobic007G004400--Sobic002G074900 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic007G004400--Sobic003G406850 Sobic007G004400--Sobic006G176900 Sobic007G004400--Sobic010G136700 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic007G004400--Sobic006G223601 Sobic007G090433--Sobic001G255866 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic007G090433--Sobic007G116300 Sobic007G090433--Sobic004G276600 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic007G090433--Sobic009G257000 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic007G090433--Sobic001G420150 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic007G090433--Sobic001G093400 Sobic007G090433--Sobic003G394701 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic007G090433--Sobic001G423200 Sobic007G090433--Sobic004G133201 Sobic001G226401 Sobic001G226401 Sobic005G090800--Sobic001G226401 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic005G090800--Sobic002G067900 Sobic005G090800--Sobic001G016050 Sobic005G090800--Sobic010G136700 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic005G090800--Sobic010G235100 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic005G090800--Sobic001G250750 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic005G090800--Sobic003G232600 Sobic005G090800--Sobic008G115200 Sobic005G090800--Sobic002G074900 Sobic004G103200 Sobic004G103200 Sobic002G212900--Sobic004G103200 Sobic002G212900--Sobic010G136700 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic002G212900--Sobic001G499350 Sobic002G212900--Sobic010G132400 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic002G212900--Sobic010G219200 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic002G212900--Sobic003G368550 Sobic009G247200 Sobic009G247200 Sobic002G212900--Sobic009G247200 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic002G212900--Sobic003G085533 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic002G212900--Sobic004G310350
Octagon: transcription factors


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