Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G322600.1
Synonym
Functional annotation coiled-coil domain-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q6J8
Pfam PF04502
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G29430 : Family of unknown function (DUF572)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g40610.1 : coiled-coil domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G172966 - K05582: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K
2 Sobic.001G475950 - -
3 Sobic.003G056200 - -
4 Sobic.K032200 ATP synthase protein MI25, putative, expressed -
5 Sobic.007G200700 pyridoxamine 5\'-phosphate oxidase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G134800 - -
7 Sobic.001G400601 - -
8 Sobic.009G097400 - -
9 Sobic.001G383350 - -
10 Sobic.004G126050 - -
11 Sobic.010G219200 - -
12 Sobic.004G115100 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
13 Sobic.010G136700 - -
14 Sobic.006G107766 - -
15 Sobic.001G249800 no apical meristem protein, expressed -
16 Sobic.001G261444 - -
17 Sobic.006G029850 - -
18 Sobic.004G183701 - -
19 Sobic.008G100201 - -
20 Sobic.K032350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G322600 Sobic003G322600 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic003G322600--Sobic003G172966 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic003G322600--Sobic001G475950 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic003G322600--Sobic003G056200 SobicK032200 SobicK032200 Sobic003G322600--SobicK032200 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic003G322600--Sobic007G200700 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic003G322600--Sobic002G134800 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic003G322600--Sobic001G400601 Sobic009G097400 Sobic009G097400 Sobic003G322600--Sobic009G097400 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic003G322600--Sobic001G383350 Sobic003G172966--Sobic003G056200 Sobic003G172966--SobicK032200 Sobic004G126050 Sobic004G126050 Sobic003G172966--Sobic004G126050 Sobic003G172966--Sobic001G475950 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic003G172966--Sobic006G107700 Sobic003G172966--Sobic009G097400 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic003G172966--Sobic001G261444 Sobic003G172966--Sobic007G200700 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic003G172966--Sobic004G115100 Sobic001G475950--SobicK032200 Sobic001G475950--Sobic003G056200 Sobic001G475950--Sobic003G172966 Sobic001G475950--Sobic001G261444 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic001G475950--Sobic002G358450 Sobic010G201332 Sobic010G201332 Sobic001G475950--Sobic010G201332 Sobic001G475950--Sobic004G126050 Sobic001G475950--Sobic006G107700 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic001G475950--Sobic002G401533 Sobic003G056200--Sobic003G172966 Sobic003G056200--Sobic001G475950 Sobic003G056200--Sobic006G107700 Sobic003G056200--SobicK032200 Sobic003G056200--Sobic004G126050 Sobic003G056200--Sobic002G401533 Sobic003G056200--Sobic001G261444 Sobic003G056200--Sobic002G358450 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic003G056200--Sobic003G161900 SobicK032200--Sobic001G475950 SobicK032200--Sobic001G261444 SobicK032200--Sobic010G201332 SobicK032200--Sobic003G172966 SobicK032200--Sobic004G126050 SobicK032200--Sobic003G056200 SobicK032200--Sobic001G383350 Sobic001G506200 Sobic001G506200 SobicK032200--Sobic001G506200 Sobic006G029850 Sobic006G029850 SobicK032200--Sobic006G029850 Sobic007G200700--Sobic004G115100 Sobic007G200700--Sobic001G383350 Sobic007G200700--Sobic001G261444 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic007G200700--Sobic008G100201 Sobic007G200700--Sobic006G029850 SobicK031900 SobicK031900 Sobic007G200700--SobicK031900 Sobic007G200700--SobicK032200 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic007G200700--Sobic010G143700 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic007G200700--Sobic006G035350 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic002G134800--Sobic006G107766 SobicK032350 SobicK032350 Sobic002G134800--SobicK032350 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic002G134800--Sobic009G209650 Sobic002G126700 Sobic002G126700 Sobic002G134800--Sobic002G126700 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic002G134800--Sobic004G183701 Sobic002G134800--Sobic006G029850 SobicK032400 SobicK032400 Sobic002G134800--SobicK032400 Sobic002G134800--Sobic001G383350 Sobic004G120150 Sobic004G120150 Sobic002G134800--Sobic004G120150 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic001G400601--Sobic001G340100 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic001G400601--Sobic002G067900 Sobic001G400601--Sobic003G322600 Sobic004G223800 Sobic004G223800 Sobic001G400601--Sobic004G223800 Sobic001G400601--Sobic002G134800 Sobic001G400601--Sobic006G107766 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G400601--Sobic009G257000 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic001G400601--Sobic003G394701 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic001G400601--Sobic007G004400 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic009G097400--Sobic003G416200 Sobic009G097400--Sobic003G172966 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic009G097400--Sobic009G204501 Sobic009G097400--Sobic003G056200 Sobic009G097400--Sobic004G126050 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic009G097400--Sobic001G255866 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic009G097400--Sobic001G436450 Sobic009G097400--Sobic003G322600 Sobic009G097400--SobicK032200 Sobic001G383350--Sobic006G029850 Sobic001G383350--Sobic007G200700 Sobic001G383350--Sobic004G115100 Sobic001G383350--Sobic001G261444 Sobic001G383350--SobicK032400 Sobic001G383350--SobicK032200 SobicK032600 SobicK032600 Sobic001G383350--SobicK032600 Sobic001G383350--Sobic008G100201 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic001G383350--Sobic002G112500
Octagon: transcription factors


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