Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G100201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R5W7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G115100 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
2 Sobic.007G200700 pyridoxamine 5\'-phosphate oxidase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
4 Sobic.K031900 - -
5 Sobic.010G143700 - -
6 Sobic.003G260500 - -
7 Sobic.001G383350 - -
8 Sobic.006G029850 - -
9 Sobic.001G261444 - -
10 Sobic.010G247750 - -
11 Sobic.006G107766 - -
12 Sobic.008G093300 - -
13 Sobic.003G268100 - -
14 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
16 Sobic.001G224500 - -
17 Sobic.007G116150 - -
18 Sobic.002G214000 protein Kinase, putative, expressed -
19 Sobic.004G134400 - -
20 Sobic.010G219200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic008G100201--Sobic004G115100 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic008G100201--Sobic007G200700 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic008G100201--Sobic006G035350 SobicK031900 SobicK031900 Sobic008G100201--SobicK031900 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic008G100201--Sobic010G143700 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic008G100201--Sobic003G260500 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic008G100201--Sobic001G383350 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic008G100201--Sobic006G029850 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic008G100201--Sobic001G261444 Sobic004G115100--Sobic008G100201 Sobic004G115100--Sobic007G200700 Sobic004G115100--Sobic001G383350 Sobic004G115100--Sobic006G029850 Sobic004G115100--Sobic001G261444 Sobic004G115100--SobicK031900 Sobic004G115100--Sobic006G035350 Sobic004G115100--Sobic010G143700 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic004G115100--Sobic006G107766 Sobic007G200700--Sobic004G115100 Sobic007G200700--Sobic001G383350 Sobic007G200700--Sobic001G261444 Sobic007G200700--Sobic008G100201 Sobic007G200700--Sobic006G029850 Sobic007G200700--SobicK031900 SobicK032200 SobicK032200 Sobic007G200700--SobicK032200 Sobic007G200700--Sobic010G143700 Sobic007G200700--Sobic006G035350 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic006G035350--Sobic008G093300 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic006G035350--Sobic010G247750 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic006G035350--Sobic004G127733 Sobic006G035350--Sobic008G100201 Sobic006G035350--Sobic003G260500 Sobic006G035350--Sobic004G115100 Sobic006G035350--Sobic010G143700 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic006G035350--Sobic007G103200 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic006G035350--Sobic007G127200 SobicK031900--Sobic008G100201 SobicK031900--Sobic010G143700 Sobic003G268100 Sobic003G268100 SobicK031900--Sobic003G268100 SobicK031900--Sobic004G115100 SobicK031900--Sobic007G200700 Sobic007G116150 Sobic007G116150 SobicK031900--Sobic007G116150 SobicK031400 SobicK031400 SobicK031900--SobicK031400 SobicK031900--Sobic006G035350 SobicK031900--Sobic001G383350 Sobic010G143700--Sobic003G268100 Sobic010G143700--Sobic007G116150 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic010G143700--Sobic004G130500 Sobic010G143700--SobicK031900 Sobic010G143700--Sobic008G100201 Sobic010G143700--Sobic006G035350 SobicK032400 SobicK032400 Sobic010G143700--SobicK032400 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic010G143700--Sobic009G209650 Sobic010G143700--Sobic004G115100 Sobic003G260500--Sobic010G247750 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic003G260500--Sobic007G132650 Sobic003G260500--Sobic006G035350 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic003G260500--Sobic004G274300 Sobic003G260500--Sobic008G100201 Sobic003G260500--Sobic006G107766 Sobic003G260500--Sobic007G127200 Sobic003G260500--Sobic010G143700 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic003G260500--Sobic003G187600 Sobic001G383350--Sobic006G029850 Sobic001G383350--Sobic007G200700 Sobic001G383350--Sobic004G115100 Sobic001G383350--Sobic001G261444 Sobic001G383350--SobicK032400 Sobic001G383350--SobicK032200 SobicK032600 SobicK032600 Sobic001G383350--SobicK032600 Sobic001G383350--Sobic008G100201 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic001G383350--Sobic002G112500 Sobic006G029850--Sobic001G383350 Sobic006G029850--Sobic004G115100 Sobic006G029850--SobicK032400 Sobic006G029850--Sobic007G200700 SobicK032350 SobicK032350 Sobic006G029850--SobicK032350 Sobic006G029850--Sobic001G261444 Sobic006G029850--SobicK032200 Sobic004G120150 Sobic004G120150 Sobic006G029850--Sobic004G120150 Sobic006G029850--SobicK032600 Sobic001G261444--SobicK032200 Sobic001G261444--Sobic007G200700 Sobic001G261444--Sobic001G383350 Sobic001G261444--Sobic004G115100 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic001G261444--Sobic001G475950 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G261444--Sobic003G161900 Sobic001G261444--Sobic006G029850 Sobic010G201332 Sobic010G201332 Sobic001G261444--Sobic010G201332 Sobic001G261444--Sobic008G100201
Octagon: transcription factors


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