Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G116150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RAF6 , C6JS00
Pfam -
Panther DB PTHR31973 PTHR31973:SF27
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G143700 - -
2 Sobic.003G268100 - -
3 Sobic.K032400 - -
4 Sobic.K032600 - -
5 Sobic.010G098800 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed K03884: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
6 Sobic.001G081450 - -
7 Sobic.009G209650 - -
8 Sobic.004G223700 - -
9 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -
10 Sobic.004G206000 - -
11 Sobic.004G130500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
12 Sobic.K031900 - -
13 Sobic.004G272950 - -
14 Sobic.K031400 ATP synthase protein YMF19, putative, expressed K02109: ATPF0B, F-type H+-transporting ATPase subunit b
15 Sobic.002G112500 - -
16 Sobic.007G134300 - -
17 Sobic.001G383350 - -
18 Sobic.010G219200 - -
19 Sobic.008G100201 - -
20 Sobic.K032350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic007G116150--Sobic010G143700 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic007G116150--Sobic003G268100 SobicK032400 SobicK032400 Sobic007G116150--SobicK032400 SobicK032600 SobicK032600 Sobic007G116150--SobicK032600 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic007G116150--Sobic010G098800 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic007G116150--Sobic001G081450 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic007G116150--Sobic009G209650 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic007G116150--Sobic004G223700 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic007G116150--Sobic003G173200 Sobic010G143700--Sobic003G268100 Sobic010G143700--Sobic007G116150 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic010G143700--Sobic004G130500 SobicK031900 SobicK031900 Sobic010G143700--SobicK031900 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic010G143700--Sobic008G100201 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic010G143700--Sobic006G035350 Sobic010G143700--SobicK032400 Sobic010G143700--Sobic009G209650 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic010G143700--Sobic004G115100 Sobic003G268100--Sobic010G143700 Sobic003G268100--Sobic007G116150 Sobic003G268100--Sobic003G173200 SobicK031400 SobicK031400 Sobic003G268100--SobicK031400 Sobic003G268100--SobicK031900 Sobic003G268100--Sobic004G130500 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic003G268100--Sobic009G094100 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic003G268100--Sobic010G247750 Sobic003G268100--Sobic006G035350 SobicK032400--SobicK032600 Sobic004G206000 Sobic004G206000 SobicK032400--Sobic004G206000 SobicK032400--Sobic007G116150 SobicK032350 SobicK032350 SobicK032400--SobicK032350 SobicK032400--Sobic009G209650 Sobic001G383350 Sobic001G383350 SobicK032400--Sobic001G383350 Sobic006G029850 Sobic006G029850 SobicK032400--Sobic006G029850 Sobic009G095720 Sobic009G095720 SobicK032400--Sobic009G095720 SobicK032400--Sobic001G081450 SobicK032600--SobicK032400 SobicK032600--Sobic004G206000 SobicK032600--Sobic007G116150 SobicK032600--Sobic001G081450 SobicK032600--SobicK032350 SobicK032600--Sobic001G383350 Sobic007G098050 Sobic007G098050 SobicK032600--Sobic007G098050 Sobic007G134300 Sobic007G134300 SobicK032600--Sobic007G134300 SobicK032600--Sobic009G209650 Sobic010G098800--Sobic004G223700 Sobic010G098800--Sobic007G116150 Sobic010G098800--Sobic001G081450 Sobic010G098800--Sobic003G173200 Sobic010G098800--Sobic004G206000 Sobic010G098800--SobicK032600 Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic010G098800--Sobic009G148400 Sobic010G098800--SobicK032400 Sobic010G098800--Sobic003G268100 Sobic001G081450--Sobic004G223700 Sobic001G081450--Sobic007G116150 Sobic001G081450--SobicK032600 Sobic001G081450--Sobic004G206000 Sobic001G081450--SobicK032400 Sobic001G081450--Sobic010G098800 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic001G081450--Sobic002G112500 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic001G081450--Sobic004G272950 Sobic001G081450--Sobic009G148400 Sobic009G209650--Sobic004G130500 Sobic009G209650--SobicK032400 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic009G209650--Sobic003G168600 Sobic009G209650--SobicK032350 Sobic009G209650--Sobic007G116150 SobicK031300 SobicK031300 Sobic009G209650--SobicK031300 Sobic009G209650--Sobic010G143700 Sobic002G126700 Sobic002G126700 Sobic009G209650--Sobic002G126700 Sobic009G209650--SobicK032600 Sobic004G223700--Sobic010G098800 Sobic004G223700--Sobic001G081450 Sobic004G223700--Sobic004G272950 Sobic004G223700--Sobic007G116150 Sobic004G223700--Sobic004G206000 Sobic004G223700--SobicK032600 Sobic004G223700--SobicK032400 Sobic004G223700--Sobic003G168600 Sobic004G223700--SobicK031300 Sobic003G173200--Sobic003G268100 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic003G173200--Sobic009G215100 Sobic003G173200--SobicK031400 Sobic003G173200--Sobic007G116150 Sobic003G173200--Sobic010G098800 Sobic003G173200--Sobic010G143700 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic003G173200--Sobic006G053550 Sobic003G173200--Sobic004G223700 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic003G173200--Sobic002G073000
Octagon: transcription factors


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