Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K032600.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt Q09EJ3
Pfam -
Panther DB PTHR36010
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR ATMG00180 : cytochrome C biogenesis 452
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU0Hr1G010690.1 , HORVU7Hr1G067010.1 , HORVU6Hr1G037070.1 , HORVU1Hr1G025070.1
Wheat TraesCS2A02G330700 , TraesCS6B02G357400 , TraesCS5D02G003300 , TraesCS1B02G188800 , TraesCS1D02G128300 , TraesCS2A02G509000 , TraesCS4D02G146500 , TraesCS1A02G145400 , TraesCS2A02G330700 , TraesCS3A02G218900 , TraesCS3A02G218900 , TraesCS3D02G103300 , TraesCS1B02G352800 , TraesCS7B02G047700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.K032400 - -
2 Sobic.004G206000 - -
3 Sobic.007G116150 - -
4 Sobic.001G081450 - -
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6 Sobic.001G383350 - -
7 Sobic.007G098050 - -
8 Sobic.007G134300 - -
9 Sobic.009G209650 - -
10 Sobic.006G264400 co-chaperone GrpE protein, putative, expressed -
11 Sobic.009G095720 - -
12 Sobic.004G223700 - -
13 Sobic.006G029850 - -
14 Sobic.010G098800 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed K03884: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
15 Sobic.010G143700 - -
16 Sobic.002G126700 - -
17 Sobic.002G112500 - -
18 Sobic.K031300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed -
19 Sobic.005G173100 - -
20 Sobic.003G168600 cytochrome b6-f complex subunit 4, putative, expressed K02637: cytochrome b6-f complex subunit 4


Gene co-expression network
sample SobicK032600 SobicK032600 SobicK032400 SobicK032400 SobicK032600--SobicK032400 Sobic004G206000 Sobic004G206000 SobicK032600--Sobic004G206000 Sobic007G116150 Sobic007G116150 SobicK032600--Sobic007G116150 Sobic001G081450 Sobic001G081450 SobicK032600--Sobic001G081450 SobicK032350 SobicK032350 SobicK032600--SobicK032350 Sobic001G383350 Sobic001G383350 SobicK032600--Sobic001G383350 Sobic007G098050 Sobic007G098050 SobicK032600--Sobic007G098050 Sobic007G134300 Sobic007G134300 SobicK032600--Sobic007G134300 Sobic009G209650 Sobic009G209650 SobicK032600--Sobic009G209650 SobicK032400--SobicK032600 SobicK032400--Sobic004G206000 SobicK032400--Sobic007G116150 SobicK032400--SobicK032350 SobicK032400--Sobic009G209650 SobicK032400--Sobic001G383350 Sobic006G029850 Sobic006G029850 SobicK032400--Sobic006G029850 Sobic009G095720 Sobic009G095720 SobicK032400--Sobic009G095720 SobicK032400--Sobic001G081450 Sobic004G206000--SobicK032600 Sobic004G206000--SobicK032400 Sobic004G206000--Sobic001G081450 Sobic004G206000--Sobic007G098050 Sobic004G206000--Sobic007G116150 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic004G206000--Sobic004G223700 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic004G206000--Sobic010G098800 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic004G206000--Sobic006G264400 Sobic004G206000--Sobic007G134300 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic007G116150--Sobic010G143700 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic007G116150--Sobic003G268100 Sobic007G116150--SobicK032400 Sobic007G116150--SobicK032600 Sobic007G116150--Sobic010G098800 Sobic007G116150--Sobic001G081450 Sobic007G116150--Sobic009G209650 Sobic007G116150--Sobic004G223700 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic007G116150--Sobic003G173200 Sobic001G081450--Sobic004G223700 Sobic001G081450--Sobic007G116150 Sobic001G081450--SobicK032600 Sobic001G081450--Sobic004G206000 Sobic001G081450--SobicK032400 Sobic001G081450--Sobic010G098800 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic001G081450--Sobic002G112500 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic001G081450--Sobic004G272950 Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic001G081450--Sobic009G148400 SobicK032350--SobicK032400 Sobic004G120150 Sobic004G120150 SobicK032350--Sobic004G120150 SobicK032350--Sobic009G209650 SobicK032350--Sobic006G029850 SobicK032350--SobicK032600 Sobic002G126700 Sobic002G126700 SobicK032350--Sobic002G126700 SobicK032350--Sobic006G264400 SobicK032350--Sobic001G383350 SobicK032350--Sobic009G095720 Sobic001G383350--Sobic006G029850 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic001G383350--Sobic007G200700 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic001G383350--Sobic004G115100 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic001G383350--Sobic001G261444 Sobic001G383350--SobicK032400 SobicK032200 SobicK032200 Sobic001G383350--SobicK032200 Sobic001G383350--SobicK032600 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic001G383350--Sobic008G100201 Sobic001G383350--Sobic002G112500 Sobic007G098050--Sobic006G264400 Sobic007G098050--Sobic009G095720 Sobic007G098050--SobicK032400 Sobic007G098050--SobicK032600 Sobic007G098050--Sobic004G206000 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic007G098050--Sobic009G145200 Sobic007G098050--Sobic002G112500 Sobic007G098050--Sobic001G081450 Sobic007G098050--Sobic006G029850 Sobic007G134300--SobicK032600 Sobic007G134300--SobicK032400 Sobic007G134300--Sobic004G206000 Sobic007G134300--Sobic007G116150 Sobic007G134300--Sobic009G209650 Sobic007G134300--SobicK032350 Sobic007G134300--Sobic002G126700 SobicK031300 SobicK031300 Sobic007G134300--SobicK031300 Sobic007G134300--Sobic001G081450 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic009G209650--Sobic004G130500 Sobic009G209650--SobicK032400 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic009G209650--Sobic003G168600 Sobic009G209650--SobicK032350 Sobic009G209650--Sobic007G116150 Sobic009G209650--SobicK031300 Sobic009G209650--Sobic010G143700 Sobic009G209650--Sobic002G126700 Sobic009G209650--SobicK032600
Octagon: transcription factors


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