Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K031300.1
Synonym
Functional annotation NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed
UniProt A0A120GUW1
Pfam PF00499
Panther DB PTHR33269 PTHR33269:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008137; NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR ATMG00270 : NADH dehydrogenase 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g34014.1 : NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G042680.1 , BAV58153 , HORVU3Hr1G044970.1 , HORVU7Hr1G044360.1 , HORVU0Hr1G037060.1 , HORVU1Hr1G009350.1 , HORVU3Hr1G040850.1
Wheat TraesCS2D02G247500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G168600 cytochrome b6-f complex subunit 4, putative, expressed K02637: cytochrome b6-f complex subunit 4
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18 Sobic.007G116150 - -
19 Sobic.001G401750 - -
20 Sobic.002G121050 - -


Gene co-expression network
sample SobicK031300 SobicK031300 Sobic003G168600 Sobic003G168600 SobicK031300--Sobic003G168600 Sobic009G095720 Sobic009G095720 SobicK031300--Sobic009G095720 Sobic009G209650 Sobic009G209650 SobicK031300--Sobic009G209650 Sobic002G126700 Sobic002G126700 SobicK031300--Sobic002G126700 SobicK043600 SobicK043600 SobicK031300--SobicK043600 Sobic006G264400 Sobic006G264400 SobicK031300--Sobic006G264400 SobicK032400 SobicK032400 SobicK031300--SobicK032400 Sobic004G272950 Sobic004G272950 SobicK031300--Sobic004G272950 SobicK032600 SobicK032600 SobicK031300--SobicK032600 Sobic003G168600--SobicK031300 Sobic003G168600--Sobic009G095720 Sobic003G168600--Sobic004G272950 Sobic003G168600--Sobic009G209650 Sobic003G168600--SobicK043600 Sobic003G168600--Sobic006G264400 Sobic003G168600--SobicK032400 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic003G168600--Sobic004G223700 Sobic005G173100 Sobic005G173100 Sobic003G168600--Sobic005G173100 Sobic009G095720--Sobic006G264400 Sobic009G095720--Sobic003G168600 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic009G095720--Sobic007G098050 Sobic009G095720--SobicK031300 Sobic009G095720--SobicK032400 Sobic009G095720--SobicK032600 SobicK032350 SobicK032350 Sobic009G095720--SobicK032350 Sobic004G206000 Sobic004G206000 Sobic009G095720--Sobic004G206000 Sobic009G095720--Sobic005G173100 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic009G209650--Sobic004G130500 Sobic009G209650--SobicK032400 Sobic009G209650--Sobic003G168600 Sobic009G209650--SobicK032350 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic009G209650--Sobic007G116150 Sobic009G209650--SobicK031300 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic009G209650--Sobic010G143700 Sobic009G209650--Sobic002G126700 Sobic009G209650--SobicK032600 Sobic002G126700--Sobic009G209650 Sobic002G126700--SobicK031300 Sobic002G126700--SobicK032350 Sobic002G126700--SobicK032400 Sobic002G126700--SobicK032600 Sobic002G126700--Sobic009G095720 Sobic007G134300 Sobic007G134300 Sobic002G126700--Sobic007G134300 Sobic002G126700--Sobic004G206000 Sobic002G126700--Sobic003G168600 SobicK043600--Sobic003G168600 SobicK043600--SobicK031300 SobicK043600--Sobic004G272950 Sobic003G172000 Sobic003G172000 SobicK043600--Sobic003G172000 Sobic002G121050 Sobic002G121050 SobicK043600--Sobic002G121050 Sobic002G112200 Sobic002G112200 SobicK043600--Sobic002G112200 SobicK043600--Sobic009G095720 SobicK043600--Sobic009G209650 Sobic001G401750 Sobic001G401750 SobicK043600--Sobic001G401750 Sobic006G264400--Sobic009G095720 Sobic006G264400--Sobic007G098050 Sobic006G264400--SobicK032400 Sobic006G264400--SobicK032600 Sobic006G264400--Sobic003G168600 Sobic006G264400--Sobic004G206000 Sobic006G264400--SobicK032350 Sobic006G264400--Sobic005G173100 Sobic006G264400--SobicK031300 SobicK032400--SobicK032600 SobicK032400--Sobic004G206000 SobicK032400--Sobic007G116150 SobicK032400--SobicK032350 SobicK032400--Sobic009G209650 Sobic001G383350 Sobic001G383350 SobicK032400--Sobic001G383350 Sobic006G029850 Sobic006G029850 SobicK032400--Sobic006G029850 SobicK032400--Sobic009G095720 Sobic001G081450 Sobic001G081450 SobicK032400--Sobic001G081450 Sobic004G272950--Sobic004G223700 Sobic004G272950--Sobic003G168600 Sobic004G272950--Sobic009G209650 Sobic004G272950--Sobic001G081450 Sobic004G272950--Sobic003G172000 Sobic004G272950--Sobic007G116150 Sobic004G272950--Sobic002G121050 Sobic004G272950--SobicK031300 Sobic002G152100 Sobic002G152100 Sobic004G272950--Sobic002G152100 SobicK032600--SobicK032400 SobicK032600--Sobic004G206000 SobicK032600--Sobic007G116150 SobicK032600--Sobic001G081450 SobicK032600--SobicK032350 SobicK032600--Sobic001G383350 SobicK032600--Sobic007G098050 SobicK032600--Sobic007G134300 SobicK032600--Sobic009G209650
Octagon: transcription factors


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