Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G173100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PT36
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G173100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.K032400 - -
2 Sobic.K032350 - -
3 Sobic.009G095720 - -
4 Sobic.006G264400 co-chaperone GrpE protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G209650 - -
6 Sobic.006G029850 - -
7 Sobic.003G168600 cytochrome b6-f complex subunit 4, putative, expressed K02637: cytochrome b6-f complex subunit 4
8 Sobic.K032600 - -
9 Sobic.007G098050 - -
10 Sobic.004G206000 - -
11 Sobic.001G383350 - -
12 Sobic.002G126700 - -
13 Sobic.K031300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed -
14 Sobic.004G120150 - K02132: ATPeF1A, ATP5A1, F-type H+-transporting ATPase subunit alpha
15 Sobic.007G116150 - -
16 Sobic.010G143700 - -
17 Sobic.007G134300 - -
18 Sobic.004G272950 - -
19 Sobic.001G081450 - -
20 Sobic.002G118000 ATP synthase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G173100 Sobic005G173100 SobicK032400 SobicK032400 Sobic005G173100--SobicK032400 SobicK032350 SobicK032350 Sobic005G173100--SobicK032350 Sobic009G095720 Sobic009G095720 Sobic005G173100--Sobic009G095720 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic005G173100--Sobic006G264400 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic005G173100--Sobic009G209650 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic005G173100--Sobic006G029850 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic005G173100--Sobic003G168600 SobicK032600 SobicK032600 Sobic005G173100--SobicK032600 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic005G173100--Sobic007G098050 SobicK032400--SobicK032600 Sobic004G206000 Sobic004G206000 SobicK032400--Sobic004G206000 Sobic007G116150 Sobic007G116150 SobicK032400--Sobic007G116150 SobicK032400--SobicK032350 SobicK032400--Sobic009G209650 Sobic001G383350 Sobic001G383350 SobicK032400--Sobic001G383350 SobicK032400--Sobic006G029850 SobicK032400--Sobic009G095720 Sobic001G081450 Sobic001G081450 SobicK032400--Sobic001G081450 SobicK032350--SobicK032400 Sobic004G120150 Sobic004G120150 SobicK032350--Sobic004G120150 SobicK032350--Sobic009G209650 SobicK032350--Sobic006G029850 SobicK032350--SobicK032600 Sobic002G126700 Sobic002G126700 SobicK032350--Sobic002G126700 SobicK032350--Sobic006G264400 SobicK032350--Sobic001G383350 SobicK032350--Sobic009G095720 Sobic009G095720--Sobic006G264400 Sobic009G095720--Sobic003G168600 Sobic009G095720--Sobic007G098050 SobicK031300 SobicK031300 Sobic009G095720--SobicK031300 Sobic009G095720--SobicK032400 Sobic009G095720--SobicK032600 Sobic009G095720--SobicK032350 Sobic009G095720--Sobic004G206000 Sobic009G095720--Sobic005G173100 Sobic006G264400--Sobic009G095720 Sobic006G264400--Sobic007G098050 Sobic006G264400--SobicK032400 Sobic006G264400--SobicK032600 Sobic006G264400--Sobic003G168600 Sobic006G264400--Sobic004G206000 Sobic006G264400--SobicK032350 Sobic006G264400--Sobic005G173100 Sobic006G264400--SobicK031300 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic009G209650--Sobic004G130500 Sobic009G209650--SobicK032400 Sobic009G209650--Sobic003G168600 Sobic009G209650--SobicK032350 Sobic009G209650--Sobic007G116150 Sobic009G209650--SobicK031300 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic009G209650--Sobic010G143700 Sobic009G209650--Sobic002G126700 Sobic009G209650--SobicK032600 Sobic006G029850--Sobic001G383350 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G029850--Sobic004G115100 Sobic006G029850--SobicK032400 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic006G029850--Sobic007G200700 Sobic006G029850--SobicK032350 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic006G029850--Sobic001G261444 SobicK032200 SobicK032200 Sobic006G029850--SobicK032200 Sobic006G029850--Sobic004G120150 Sobic006G029850--SobicK032600 Sobic003G168600--SobicK031300 Sobic003G168600--Sobic009G095720 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic003G168600--Sobic004G272950 Sobic003G168600--Sobic009G209650 SobicK043600 SobicK043600 Sobic003G168600--SobicK043600 Sobic003G168600--Sobic006G264400 Sobic003G168600--SobicK032400 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic003G168600--Sobic004G223700 Sobic003G168600--Sobic005G173100 SobicK032600--SobicK032400 SobicK032600--Sobic004G206000 SobicK032600--Sobic007G116150 SobicK032600--Sobic001G081450 SobicK032600--SobicK032350 SobicK032600--Sobic001G383350 SobicK032600--Sobic007G098050 Sobic007G134300 Sobic007G134300 SobicK032600--Sobic007G134300 SobicK032600--Sobic009G209650 Sobic007G098050--Sobic006G264400 Sobic007G098050--Sobic009G095720 Sobic007G098050--SobicK032400 Sobic007G098050--SobicK032600 Sobic007G098050--Sobic004G206000 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic007G098050--Sobic009G145200 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic007G098050--Sobic002G112500 Sobic007G098050--Sobic001G081450 Sobic007G098050--Sobic006G029850
Octagon: transcription factors


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