Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G118000.1
Synonym
Functional annotation ATP synthase, putative, expressed
UniProt A0A1B6QAN1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g08910.1 : ATP synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024649 , Zm00025a057729 , Zm00025a057627 , Zm00025a057818 , Zm00025a057550
Brachypodium -
Barley BAV58156 , HORVU0Hr1G019950.2 , HORVU0Hr1G019950.1
Wheat TraesCS2B02G283000 , TraesCS5B02G388400 , TraesCS3B02G512400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G209650 - -
2 Sobic.003G168600 cytochrome b6-f complex subunit 4, putative, expressed K02637: cytochrome b6-f complex subunit 4
3 Sobic.005G194400 ribulose bisphosphate carboxylase large chain precursor, putative, expressed K01601: ribulose-bisphosphate carboxylase large chain
4 Sobic.007G103200 - -
5 Sobic.004G272950 - -
6 Sobic.005G173100 - -
7 Sobic.007G132650 - -
8 Sobic.003G296250 - -
9 Sobic.K032350 - -
10 Sobic.004G130500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
11 Sobic.004G120150 - K02132: ATPeF1A, ATP5A1, F-type H+-transporting ATPase subunit alpha
12 Sobic.001G045100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
13 Sobic.009G095720 - -
14 Sobic.003G029150 - -
15 Sobic.004G127350 - -
16 Sobic.009G094100 - -
17 Sobic.K031300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed -
18 Sobic.010G039150 - -
19 Sobic.001G032850 - -
20 Sobic.002G134800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G118000 Sobic002G118000 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic002G118000--Sobic009G209650 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic002G118000--Sobic003G168600 Sobic005G194400 Sobic005G194400 Sobic002G118000--Sobic005G194400 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic002G118000--Sobic007G103200 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic002G118000--Sobic004G272950 Sobic005G173100 Sobic005G173100 Sobic002G118000--Sobic005G173100 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic002G118000--Sobic007G132650 Sobic003G296250 Sobic003G296250 Sobic002G118000--Sobic003G296250 SobicK032350 SobicK032350 Sobic002G118000--SobicK032350 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic009G209650--Sobic004G130500 SobicK032400 SobicK032400 Sobic009G209650--SobicK032400 Sobic009G209650--Sobic003G168600 Sobic009G209650--SobicK032350 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic009G209650--Sobic007G116150 SobicK031300 SobicK031300 Sobic009G209650--SobicK031300 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic009G209650--Sobic010G143700 Sobic002G126700 Sobic002G126700 Sobic009G209650--Sobic002G126700 SobicK032600 SobicK032600 Sobic009G209650--SobicK032600 Sobic003G168600--SobicK031300 Sobic009G095720 Sobic009G095720 Sobic003G168600--Sobic009G095720 Sobic003G168600--Sobic004G272950 Sobic003G168600--Sobic009G209650 SobicK043600 SobicK043600 Sobic003G168600--SobicK043600 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic003G168600--Sobic006G264400 Sobic003G168600--SobicK032400 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic003G168600--Sobic004G223700 Sobic003G168600--Sobic005G173100 Sobic005G194400--Sobic002G118000 Sobic005G194400--Sobic003G168600 Sobic005G194400--Sobic009G209650 Sobic005G194400--Sobic005G173100 Sobic005G194400--SobicK032350 Sobic005G194400--Sobic007G103200 Sobic004G120150 Sobic004G120150 Sobic005G194400--Sobic004G120150 Sobic005G194400--SobicK031300 Sobic005G194400--Sobic009G095720 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic007G103200--Sobic009G094100 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic007G103200--Sobic004G127733 Sobic007G103200--Sobic004G130500 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic007G103200--Sobic006G035350 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic007G103200--Sobic010G247750 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic007G103200--Sobic004G127350 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic007G103200--Sobic010G052100 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic007G103200--Sobic007G127200 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic007G103200--Sobic001G045900 Sobic004G272950--Sobic004G223700 Sobic004G272950--Sobic003G168600 Sobic004G272950--Sobic009G209650 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic004G272950--Sobic001G081450 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic004G272950--Sobic003G172000 Sobic004G272950--Sobic007G116150 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic004G272950--Sobic002G121050 Sobic004G272950--SobicK031300 Sobic002G152100 Sobic002G152100 Sobic004G272950--Sobic002G152100 Sobic005G173100--SobicK032400 Sobic005G173100--SobicK032350 Sobic005G173100--Sobic009G095720 Sobic005G173100--Sobic006G264400 Sobic005G173100--Sobic009G209650 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic005G173100--Sobic006G029850 Sobic005G173100--Sobic003G168600 Sobic005G173100--SobicK032600 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic005G173100--Sobic007G098050 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic007G132650--Sobic003G260500 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic007G132650--Sobic004G274300 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic007G132650--Sobic003G187600 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic007G132650--Sobic009G079600 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic007G132650--Sobic006G107766 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic007G132650--Sobic004G134400 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic007G132650--Sobic001G323101 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic007G132650--Sobic010G039150 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic007G132650--Sobic006G149900 Sobic003G296250--Sobic002G118000 Sobic003G296250--Sobic007G132650 Sobic003G296250--Sobic010G039150 Sobic003G296250--Sobic003G168600 Sobic003G296250--Sobic004G272950 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic003G296250--Sobic001G401750 Sobic003G296250--Sobic004G127350 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic003G296250--Sobic003G072000 Sobic003G296250--Sobic009G095720 SobicK032350--SobicK032400 SobicK032350--Sobic004G120150 SobicK032350--Sobic009G209650 SobicK032350--Sobic006G029850 SobicK032350--SobicK032600 SobicK032350--Sobic002G126700 SobicK032350--Sobic006G264400 Sobic001G383350 Sobic001G383350 SobicK032350--Sobic001G383350 SobicK032350--Sobic009G095720
Octagon: transcription factors


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