Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G029150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VVK7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
2 Sobic.001G045900 polygalacturonase, putative, expressed -
3 Sobic.004G127733 - -
4 Sobic.006G176900 - -
5 Sobic.007G103200 - -
6 Sobic.007G132650 - -
7 Sobic.008G119600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.006G107766 - -
9 Sobic.001G045100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
10 Sobic.007G127200 ECT protein, putative, expressed K07877: Ras-related protein Rab-2A
11 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
12 Sobic.001G323101 - -
13 Sobic.002G042700 - -
14 Sobic.003G260500 - -
15 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
16 Sobic.009G079600 - -
17 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G207733 - -
19 Sobic.003G394701 - -
20 Sobic.003G335100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic003G029150--Sobic003G187600 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic003G029150--Sobic001G045900 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic003G029150--Sobic004G127733 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic003G029150--Sobic006G176900 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic003G029150--Sobic007G103200 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic003G029150--Sobic007G132650 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic003G029150--Sobic008G119600 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic003G029150--Sobic006G107766 Sobic001G045100 Sobic001G045100 Sobic003G029150--Sobic001G045100 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic003G187600--Sobic004G274300 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic003G187600--Sobic009G079600 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic003G187600--Sobic004G134400 Sobic003G187600--Sobic007G132650 Sobic003G187600--Sobic006G107766 Sobic003G187600--Sobic003G029150 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic003G187600--Sobic003G260500 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic003G187600--Sobic007G046700 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic003G187600--Sobic007G127200 Sobic001G045900--Sobic004G127733 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic001G045900--Sobic010G052100 Sobic001G045900--Sobic007G127200 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic001G045900--Sobic010G225175 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic001G045900--Sobic004G207733 Sobic001G045900--Sobic006G176900 Sobic001G045900--Sobic001G045100 Sobic001G045900--Sobic007G103200 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic001G045900--Sobic002G154450 Sobic004G127733--Sobic006G176900 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic004G127733--Sobic006G035350 Sobic004G127733--Sobic007G103200 Sobic004G127733--Sobic007G127200 Sobic004G127733--Sobic001G045900 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic004G127733--Sobic008G093300 Sobic004G127733--Sobic002G154450 Sobic004G127733--Sobic010G052100 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic004G127733--Sobic010G247750 Sobic006G176900--Sobic004G127733 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic006G176900--Sobic003G112100 Sobic006G176900--Sobic001G045900 Sobic006G176900--Sobic002G154450 Sobic006G176900--Sobic004G207733 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic006G176900--Sobic002G147550 Sobic006G176900--Sobic008G119600 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic006G176900--Sobic004G129400 Sobic006G176900--Sobic007G127200 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic007G103200--Sobic009G094100 Sobic007G103200--Sobic004G127733 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic007G103200--Sobic004G130500 Sobic007G103200--Sobic006G035350 Sobic007G103200--Sobic010G247750 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic007G103200--Sobic004G127350 Sobic007G103200--Sobic010G052100 Sobic007G103200--Sobic007G127200 Sobic007G103200--Sobic001G045900 Sobic007G132650--Sobic003G260500 Sobic007G132650--Sobic004G274300 Sobic007G132650--Sobic003G187600 Sobic007G132650--Sobic009G079600 Sobic007G132650--Sobic006G107766 Sobic007G132650--Sobic004G134400 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic007G132650--Sobic001G323101 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic007G132650--Sobic010G039150 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic007G132650--Sobic006G149900 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G119600--Sobic007G004400 Sobic008G119600--Sobic006G107766 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic008G119600--Sobic010G136700 Sobic008G119600--Sobic006G176900 Sobic008G119600--Sobic003G187600 Sobic008G119600--Sobic006G035350 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic008G119600--Sobic008G115200 Sobic008G119600--Sobic003G029150 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic008G119600--Sobic010G132400 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic006G107766--Sobic003G394701 Sobic006G107766--Sobic006G035350 Sobic006G107766--Sobic003G260500 Sobic006G107766--Sobic008G119600 Sobic006G107766--Sobic003G187600 Sobic006G107766--Sobic004G274300 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic006G107766--Sobic004G133201 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic006G107766--Sobic001G255866 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G107766--Sobic004G115100 Sobic001G045100--Sobic001G045900 Sobic001G045100--Sobic003G029150 Sobic001G045100--Sobic001G323101 Sobic001G045100--Sobic007G127200 Sobic001G045100--Sobic006G176900 Sobic001G045100--Sobic003G112100 Sobic001G045100--Sobic004G127733 Sobic001G045100--Sobic007G132650 Sobic001G045100--Sobic007G103200
Octagon: transcription factors


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