Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G127200.1
Synonym Sb07g020375
Functional annotation ECT protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PHI0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology K07877; Ras-related protein Rab-2A
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G48110 : evolutionarily conserved C-terminal region 7
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g22630.2 : ECT protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G247750 - -
2 Sobic.004G127733 - -
3 Sobic.004G134400 - -
4 Sobic.010G052100 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
5 Sobic.001G045900 polygalacturonase, putative, expressed -
6 Sobic.009G079600 - -
7 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
8 Sobic.008G093300 - -
9 Sobic.003G260500 - -
10 Sobic.002G154450 - -
11 Sobic.007G103200 - -
12 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G225175 - -
14 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
15 Sobic.004G127350 - -
16 Sobic.006G176900 - -
17 Sobic.007G132650 - -
18 Sobic.006G149900 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G094100 - -
20 Sobic.003G029150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic007G127200--Sobic010G247750 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic007G127200--Sobic004G127733 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic007G127200--Sobic004G134400 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic007G127200--Sobic010G052100 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic007G127200--Sobic001G045900 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic007G127200--Sobic009G079600 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic007G127200--Sobic006G035350 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic007G127200--Sobic008G093300 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic007G127200--Sobic003G260500 Sobic010G247750--Sobic007G127200 Sobic010G247750--Sobic003G260500 Sobic010G247750--Sobic006G035350 Sobic010G247750--Sobic008G093300 Sobic010G247750--Sobic004G134400 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic010G247750--Sobic007G103200 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic010G247750--Sobic010G143700 Sobic010G247750--Sobic010G052100 Sobic010G247750--Sobic009G079600 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic004G127733--Sobic006G176900 Sobic004G127733--Sobic006G035350 Sobic004G127733--Sobic007G103200 Sobic004G127733--Sobic007G127200 Sobic004G127733--Sobic001G045900 Sobic004G127733--Sobic008G093300 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic004G127733--Sobic002G154450 Sobic004G127733--Sobic010G052100 Sobic004G127733--Sobic010G247750 Sobic004G134400--Sobic009G079600 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic004G134400--Sobic004G274300 Sobic004G134400--Sobic007G127200 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic004G134400--Sobic003G187600 Sobic004G134400--Sobic010G247750 Sobic004G134400--Sobic003G260500 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic004G134400--Sobic001G323101 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G134400--Sobic004G133201 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic004G134400--Sobic007G132650 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic010G052100--Sobic010G225175 Sobic010G052100--Sobic001G045900 Sobic010G052100--Sobic002G154450 Sobic010G052100--Sobic007G127200 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic010G052100--Sobic004G127350 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic010G052100--Sobic009G094100 Sobic010G052100--Sobic007G103200 Sobic010G052100--Sobic010G247750 Sobic010G052100--Sobic004G127733 Sobic001G045900--Sobic004G127733 Sobic001G045900--Sobic010G052100 Sobic001G045900--Sobic007G127200 Sobic001G045900--Sobic010G225175 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic001G045900--Sobic004G207733 Sobic001G045900--Sobic006G176900 Sobic001G045100 Sobic001G045100 Sobic001G045900--Sobic001G045100 Sobic001G045900--Sobic007G103200 Sobic001G045900--Sobic002G154450 Sobic009G079600--Sobic004G134400 Sobic009G079600--Sobic004G274300 Sobic009G079600--Sobic003G187600 Sobic009G079600--Sobic001G323101 Sobic009G079600--Sobic007G127200 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic009G079600--Sobic010G039150 Sobic009G079600--Sobic007G132650 Sobic009G079600--Sobic003G260500 Sobic009G079600--Sobic010G247750 Sobic006G035350--Sobic008G093300 Sobic006G035350--Sobic010G247750 Sobic006G035350--Sobic004G127733 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic006G035350--Sobic008G100201 Sobic006G035350--Sobic003G260500 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G035350--Sobic004G115100 Sobic006G035350--Sobic010G143700 Sobic006G035350--Sobic007G103200 Sobic006G035350--Sobic007G127200 Sobic008G093300--Sobic006G035350 Sobic008G093300--Sobic010G247750 Sobic008G093300--Sobic007G127200 Sobic008G093300--Sobic004G127733 Sobic008G093300--Sobic003G260500 Sobic008G093300--Sobic008G100201 Sobic008G093300--Sobic007G103200 Sobic008G093300--Sobic010G143700 Sobic008G093300--Sobic004G134400 Sobic003G260500--Sobic010G247750 Sobic003G260500--Sobic007G132650 Sobic003G260500--Sobic006G035350 Sobic003G260500--Sobic004G274300 Sobic003G260500--Sobic008G100201 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic003G260500--Sobic006G107766 Sobic003G260500--Sobic007G127200 Sobic003G260500--Sobic010G143700 Sobic003G260500--Sobic003G187600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.