Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G093300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PD16
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
2 Sobic.010G247750 - -
3 Sobic.007G127200 ECT protein, putative, expressed K07877: Ras-related protein Rab-2A
4 Sobic.004G127733 - -
5 Sobic.003G260500 - -
6 Sobic.008G100201 - -
7 Sobic.007G103200 - -
8 Sobic.010G143700 - -
9 Sobic.004G134400 - -
10 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G115100 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
12 Sobic.002G154450 - -
13 Sobic.003G268100 - -
14 Sobic.006G107766 - -
15 Sobic.009G079600 - -
16 Sobic.006G176900 - -
17 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
18 Sobic.K031900 - -
19 Sobic.010G052100 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
20 Sobic.005G154600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic008G093300--Sobic006G035350 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic008G093300--Sobic010G247750 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic008G093300--Sobic007G127200 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic008G093300--Sobic004G127733 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic008G093300--Sobic003G260500 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic008G093300--Sobic008G100201 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic008G093300--Sobic007G103200 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic008G093300--Sobic010G143700 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic008G093300--Sobic004G134400 Sobic006G035350--Sobic008G093300 Sobic006G035350--Sobic010G247750 Sobic006G035350--Sobic004G127733 Sobic006G035350--Sobic008G100201 Sobic006G035350--Sobic003G260500 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G035350--Sobic004G115100 Sobic006G035350--Sobic010G143700 Sobic006G035350--Sobic007G103200 Sobic006G035350--Sobic007G127200 Sobic010G247750--Sobic007G127200 Sobic010G247750--Sobic003G260500 Sobic010G247750--Sobic006G035350 Sobic010G247750--Sobic008G093300 Sobic010G247750--Sobic004G134400 Sobic010G247750--Sobic007G103200 Sobic010G247750--Sobic010G143700 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic010G247750--Sobic010G052100 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic010G247750--Sobic009G079600 Sobic007G127200--Sobic010G247750 Sobic007G127200--Sobic004G127733 Sobic007G127200--Sobic004G134400 Sobic007G127200--Sobic010G052100 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic007G127200--Sobic001G045900 Sobic007G127200--Sobic009G079600 Sobic007G127200--Sobic006G035350 Sobic007G127200--Sobic008G093300 Sobic007G127200--Sobic003G260500 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic004G127733--Sobic006G176900 Sobic004G127733--Sobic006G035350 Sobic004G127733--Sobic007G103200 Sobic004G127733--Sobic007G127200 Sobic004G127733--Sobic001G045900 Sobic004G127733--Sobic008G093300 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic004G127733--Sobic002G154450 Sobic004G127733--Sobic010G052100 Sobic004G127733--Sobic010G247750 Sobic003G260500--Sobic010G247750 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic003G260500--Sobic007G132650 Sobic003G260500--Sobic006G035350 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic003G260500--Sobic004G274300 Sobic003G260500--Sobic008G100201 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic003G260500--Sobic006G107766 Sobic003G260500--Sobic007G127200 Sobic003G260500--Sobic010G143700 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic003G260500--Sobic003G187600 Sobic008G100201--Sobic004G115100 Sobic007G200700 Sobic007G200700 Sobic008G100201--Sobic007G200700 Sobic008G100201--Sobic006G035350 SobicK031900 SobicK031900 Sobic008G100201--SobicK031900 Sobic008G100201--Sobic010G143700 Sobic008G100201--Sobic003G260500 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic008G100201--Sobic001G383350 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic008G100201--Sobic006G029850 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic008G100201--Sobic001G261444 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic007G103200--Sobic009G094100 Sobic007G103200--Sobic004G127733 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic007G103200--Sobic004G130500 Sobic007G103200--Sobic006G035350 Sobic007G103200--Sobic010G247750 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic007G103200--Sobic004G127350 Sobic007G103200--Sobic010G052100 Sobic007G103200--Sobic007G127200 Sobic007G103200--Sobic001G045900 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic010G143700--Sobic003G268100 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic010G143700--Sobic007G116150 Sobic010G143700--Sobic004G130500 Sobic010G143700--SobicK031900 Sobic010G143700--Sobic008G100201 Sobic010G143700--Sobic006G035350 SobicK032400 SobicK032400 Sobic010G143700--SobicK032400 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic010G143700--Sobic009G209650 Sobic010G143700--Sobic004G115100 Sobic004G134400--Sobic009G079600 Sobic004G134400--Sobic004G274300 Sobic004G134400--Sobic007G127200 Sobic004G134400--Sobic003G187600 Sobic004G134400--Sobic010G247750 Sobic004G134400--Sobic003G260500 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic004G134400--Sobic001G323101 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G134400--Sobic004G133201 Sobic004G134400--Sobic007G132650
Octagon: transcription factors


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