Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G176900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PML3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G127733 - -
2 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
3 Sobic.001G045900 polygalacturonase, putative, expressed -
4 Sobic.002G154450 - -
5 Sobic.004G207733 - -
6 Sobic.002G147550 - -
7 Sobic.008G119600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -
9 Sobic.007G127200 ECT protein, putative, expressed K07877: Ras-related protein Rab-2A
10 Sobic.006G107766 - -
11 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
12 Sobic.003G029150 - -
13 Sobic.006G149900 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
14 Sobic.008G115200 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G103200 - -
16 Sobic.007G004400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
17 Sobic.003G169550 - -
18 Sobic.003G394701 - -
19 Sobic.008G093300 - -
20 Sobic.001G249800 no apical meristem protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic006G176900--Sobic004G127733 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic006G176900--Sobic003G112100 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic006G176900--Sobic001G045900 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic006G176900--Sobic002G154450 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic006G176900--Sobic004G207733 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic006G176900--Sobic002G147550 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic006G176900--Sobic008G119600 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic006G176900--Sobic004G129400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic006G176900--Sobic007G127200 Sobic004G127733--Sobic006G176900 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic004G127733--Sobic006G035350 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic004G127733--Sobic007G103200 Sobic004G127733--Sobic007G127200 Sobic004G127733--Sobic001G045900 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic004G127733--Sobic008G093300 Sobic004G127733--Sobic002G154450 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic004G127733--Sobic010G052100 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic004G127733--Sobic010G247750 Sobic003G112100--Sobic004G129400 Sobic003G112100--Sobic006G176900 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic003G112100--Sobic008G156800 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic003G112100--Sobic003G406850 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic003G112100--Sobic003G394701 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic003G112100--Sobic003G169550 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic003G112100--Sobic003G335100 Sobic003G112100--Sobic002G147550 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic003G112100--Sobic001G323101 Sobic001G045900--Sobic004G127733 Sobic001G045900--Sobic010G052100 Sobic001G045900--Sobic007G127200 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic001G045900--Sobic010G225175 Sobic001G045900--Sobic004G207733 Sobic001G045900--Sobic006G176900 Sobic001G045100 Sobic001G045100 Sobic001G045900--Sobic001G045100 Sobic001G045900--Sobic007G103200 Sobic001G045900--Sobic002G154450 Sobic002G154450--Sobic010G052100 Sobic002G154450--Sobic004G127733 Sobic002G154450--Sobic007G127200 Sobic002G154450--Sobic006G176900 Sobic002G154450--Sobic001G045900 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic002G154450--Sobic003G251000 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic002G154450--Sobic006G149900 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic002G154450--Sobic010G149000 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic002G154450--Sobic005G154600 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic004G207733--Sobic001G087850 Sobic004G207733--Sobic001G045900 Sobic004G207733--Sobic006G176900 Sobic004G207733--Sobic004G127733 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic004G207733--Sobic010G123650 Sobic004G207733--Sobic002G147550 Sobic004G207733--Sobic003G112100 Sobic004G207733--Sobic002G154450 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic004G207733--Sobic001G436450 Sobic002G147550--Sobic006G176900 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic002G147550--Sobic008G116800 Sobic002G147550--Sobic003G406850 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic002G147550--Sobic006G223601 Sobic002G147550--Sobic003G112100 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic002G147550--Sobic002G246100 Sobic002G147550--Sobic004G207733 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic002G147550--Sobic006G223101 Sobic002G147550--Sobic001G087850 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic008G119600--Sobic007G004400 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic008G119600--Sobic006G107766 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic008G119600--Sobic010G136700 Sobic008G119600--Sobic006G176900 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic008G119600--Sobic003G187600 Sobic008G119600--Sobic006G035350 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic008G119600--Sobic008G115200 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic008G119600--Sobic003G029150 Sobic010G132400 Sobic010G132400 Sobic008G119600--Sobic010G132400 Sobic004G129400--Sobic003G112100 Sobic004G129400--Sobic003G394701 Sobic004G129400--Sobic003G169550 Sobic004G129400--Sobic008G156800 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic004G129400--Sobic004G274300 Sobic004G129400--Sobic006G176900 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic004G129400--Sobic001G255866 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic004G129400--Sobic007G046700 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G129400--Sobic004G133201 Sobic007G127200--Sobic010G247750 Sobic007G127200--Sobic004G127733 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic007G127200--Sobic004G134400 Sobic007G127200--Sobic010G052100 Sobic007G127200--Sobic001G045900 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic007G127200--Sobic009G079600 Sobic007G127200--Sobic006G035350 Sobic007G127200--Sobic008G093300 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic007G127200--Sobic003G260500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.