Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G207733.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RNE8
Pfam -
Panther DB PTHR22880 PTHR22880:SF134
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G27260 : global transcription factor group E8
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g25860.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G087850 - -
2 Sobic.001G045900 polygalacturonase, putative, expressed -
3 Sobic.006G176900 - -
4 Sobic.004G127733 - -
5 Sobic.010G123650 - -
6 Sobic.002G147550 - -
7 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.002G154450 - -
9 Sobic.001G436450 - -
10 Sobic.001G045100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
11 Sobic.009G079400 EMB2261, putative, expressed -
12 Sobic.003G029150 - -
13 Sobic.010G052100 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
14 Sobic.007G103200 - -
15 Sobic.004G260250 - -
16 Sobic.007G127200 ECT protein, putative, expressed K07877: Ras-related protein Rab-2A
17 Sobic.010G149000 - -
18 Sobic.004G143550 - -
19 Sobic.004G187701 - -
20 Sobic.006G223601 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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