Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G187701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RN64
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g36320.1 : RING-H2 finger protein ATL3B precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020774
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G436450 - -
2 Sobic.009G079400 EMB2261, putative, expressed -
3 Sobic.001G087850 - -
4 Sobic.006G176900 - -
5 Sobic.002G147550 - -
6 Sobic.004G207733 - -
7 Sobic.004G127733 - -
8 Sobic.003G244250 - -
9 Sobic.010G123650 - -
10 Sobic.002G246100 - -
11 Sobic.003G404050 - -
12 Sobic.004G260250 - -
13 Sobic.001G249800 no apical meristem protein, expressed -
14 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
15 Sobic.001G045900 polygalacturonase, putative, expressed -
16 Sobic.010G011100 - -
17 Sobic.008G116800 expressed protein -
18 Sobic.002G154450 - -
19 Sobic.002G042700 - -
20 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G187701 Sobic004G187701 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic004G187701--Sobic001G436450 Sobic009G079400 Sobic009G079400 Sobic004G187701--Sobic009G079400 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic004G187701--Sobic001G087850 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic004G187701--Sobic006G176900 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic004G187701--Sobic002G147550 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic004G187701--Sobic004G207733 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic004G187701--Sobic004G127733 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic004G187701--Sobic003G244250 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic004G187701--Sobic010G123650 Sobic003G404050 Sobic003G404050 Sobic001G436450--Sobic003G404050 Sobic001G249800 Sobic001G249800 Sobic001G436450--Sobic001G249800 Sobic001G436450--Sobic001G087850 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic001G436450--Sobic010G011100 Sobic001G436450--Sobic003G244250 Sobic001G436450--Sobic006G176900 Sobic001G436450--Sobic004G207733 Sobic001G436450--Sobic004G187701 Sobic001G436450--Sobic010G123650 Sobic009G079400--Sobic006G176900 Sobic009G079400--Sobic004G207733 Sobic009G079400--Sobic002G147550 Sobic009G079400--Sobic004G187701 Sobic009G079400--Sobic004G127733 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic009G079400--Sobic003G112100 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic009G079400--Sobic004G129400 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic009G079400--Sobic002G154450 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic009G079400--Sobic002G246100 Sobic001G087850--Sobic010G123650 Sobic001G087850--Sobic004G207733 Sobic001G087850--Sobic001G436450 Sobic001G087850--Sobic002G147550 Sobic001G087850--Sobic006G176900 Sobic001G087850--Sobic003G404050 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic001G087850--Sobic001G045900 Sobic001G087850--Sobic004G187701 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic001G087850--Sobic006G065000 Sobic006G176900--Sobic004G127733 Sobic006G176900--Sobic003G112100 Sobic006G176900--Sobic001G045900 Sobic006G176900--Sobic002G154450 Sobic006G176900--Sobic004G207733 Sobic006G176900--Sobic002G147550 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic006G176900--Sobic008G119600 Sobic006G176900--Sobic004G129400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic006G176900--Sobic007G127200 Sobic002G147550--Sobic006G176900 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic002G147550--Sobic008G116800 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic002G147550--Sobic003G406850 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic002G147550--Sobic006G223601 Sobic002G147550--Sobic003G112100 Sobic002G147550--Sobic002G246100 Sobic002G147550--Sobic004G207733 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic002G147550--Sobic006G223101 Sobic002G147550--Sobic001G087850 Sobic004G207733--Sobic001G087850 Sobic004G207733--Sobic001G045900 Sobic004G207733--Sobic006G176900 Sobic004G207733--Sobic004G127733 Sobic004G207733--Sobic010G123650 Sobic004G207733--Sobic002G147550 Sobic004G207733--Sobic003G112100 Sobic004G207733--Sobic002G154450 Sobic004G207733--Sobic001G436450 Sobic004G127733--Sobic006G176900 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic004G127733--Sobic006G035350 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic004G127733--Sobic007G103200 Sobic004G127733--Sobic007G127200 Sobic004G127733--Sobic001G045900 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic004G127733--Sobic008G093300 Sobic004G127733--Sobic002G154450 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic004G127733--Sobic010G052100 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic004G127733--Sobic010G247750 Sobic003G244250--Sobic002G246100 Sobic003G244250--Sobic001G436450 Sobic004G260250 Sobic004G260250 Sobic003G244250--Sobic004G260250 Sobic003G244250--Sobic009G079400 Sobic003G244250--Sobic004G187701 Sobic003G244250--Sobic002G147550 Sobic003G244250--Sobic006G176900 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic003G244250--Sobic003G416200 Sobic003G244250--Sobic004G207733 Sobic010G123650--Sobic001G087850 Sobic010G123650--Sobic004G207733 Sobic010G123650--Sobic003G404050 Sobic010G123650--Sobic002G147550 Sobic010G123650--Sobic003G112100 Sobic010G123650--Sobic001G436450 Sobic003G168700 Sobic003G168700 Sobic010G123650--Sobic003G168700 Sobic010G123650--Sobic006G176900 Sobic010G123650--Sobic001G045900
Octagon: transcription factors


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