Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G404050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W188
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G436450 - -
2 Sobic.003G406850 - -
3 Sobic.010G011100 - -
4 Sobic.010G123650 - -
5 Sobic.002G147550 - -
6 Sobic.002G042700 - -
7 Sobic.008G116800 expressed protein -
8 Sobic.001G249800 no apical meristem protein, expressed -
9 Sobic.001G087850 - -
10 Sobic.003G168700 "oxidative phosphorylation, ATP production, stroma side of thylakoid membranes"(PubMedID : 8481382)@cytochrome b6, putative, expressed K02635: cytochrome b6
11 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
12 Sobic.006G176900 - -
13 Sobic.004G187701 - -
14 Sobic.004G207733 - -
15 Sobic.005G118500 expressed protein -
16 Sobic.003G394701 - -
17 Sobic.001G016050 - -
18 Sobic.006G223601 - -
19 Sobic.007G004400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
20 Sobic.001G205950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G404050 Sobic003G404050 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic003G404050--Sobic001G436450 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic003G404050--Sobic003G406850 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic003G404050--Sobic010G011100 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic003G404050--Sobic010G123650 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic003G404050--Sobic002G147550 Sobic002G042700 Sobic002G042700 Sobic003G404050--Sobic002G042700 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic003G404050--Sobic008G116800 Sobic001G249800 Sobic001G249800 Sobic003G404050--Sobic001G249800 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic003G404050--Sobic001G087850 Sobic001G436450--Sobic003G404050 Sobic001G436450--Sobic001G249800 Sobic001G436450--Sobic001G087850 Sobic001G436450--Sobic010G011100 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic001G436450--Sobic003G244250 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic001G436450--Sobic006G176900 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic001G436450--Sobic004G207733 Sobic004G187701 Sobic004G187701 Sobic001G436450--Sobic004G187701 Sobic001G436450--Sobic010G123650 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic003G406850--Sobic006G223601 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic003G406850--Sobic003G112100 Sobic003G406850--Sobic002G147550 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic003G406850--Sobic003G335100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic003G406850--Sobic007G004400 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic003G406850--Sobic006G223101 Sobic003G406850--Sobic008G116800 Sobic003G406850--Sobic003G404050 Sobic003G406850--Sobic006G176900 Sobic010G011100--Sobic001G436450 Sobic009G030501 Sobic009G030501 Sobic010G011100--Sobic009G030501 Sobic010G011100--Sobic003G404050 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic010G011100--Sobic010G136700 Sobic001G016050 Sobic001G016050 Sobic010G011100--Sobic001G016050 Sobic010G011100--Sobic002G147550 Sobic010G011100--Sobic001G249800 Sobic010G011100--Sobic003G406850 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic010G011100--Sobic002G246100 Sobic010G123650--Sobic001G087850 Sobic010G123650--Sobic004G207733 Sobic010G123650--Sobic003G404050 Sobic010G123650--Sobic002G147550 Sobic010G123650--Sobic003G112100 Sobic010G123650--Sobic001G436450 Sobic003G168700 Sobic003G168700 Sobic010G123650--Sobic003G168700 Sobic010G123650--Sobic006G176900 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic010G123650--Sobic001G045900 Sobic002G147550--Sobic006G176900 Sobic002G147550--Sobic008G116800 Sobic002G147550--Sobic003G406850 Sobic002G147550--Sobic006G223601 Sobic002G147550--Sobic003G112100 Sobic002G147550--Sobic002G246100 Sobic002G147550--Sobic004G207733 Sobic002G147550--Sobic006G223101 Sobic002G147550--Sobic001G087850 Sobic002G042700--Sobic003G168700 Sobic004G120150 Sobic004G120150 Sobic002G042700--Sobic004G120150 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic002G042700--Sobic003G394701 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic002G042700--Sobic006G107766 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic002G042700--Sobic003G029150 Sobic002G042700--Sobic001G249800 Sobic002G042700--Sobic003G112100 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic002G042700--Sobic001G255866 Sobic002G042700--Sobic003G404050 Sobic008G116800--Sobic002G147550 Sobic008G116800--Sobic003G112100 Sobic008G116800--Sobic003G406850 Sobic008G116800--Sobic003G404050 Sobic008G116800--Sobic006G176900 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic008G116800--Sobic008G156800 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic008G116800--Sobic001G205950 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic008G116800--Sobic004G129400 Sobic008G116800--Sobic010G123650 Sobic001G249800--Sobic001G436450 Sobic001G249800--Sobic006G176900 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic001G249800--Sobic008G119600 Sobic001G249800--Sobic006G107766 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic001G249800--Sobic007G103200 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic001G249800--Sobic004G130500 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic001G249800--Sobic004G127733 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic001G249800--Sobic002G134800 Sobic001G249800--Sobic002G042700 Sobic001G087850--Sobic010G123650 Sobic001G087850--Sobic004G207733 Sobic001G087850--Sobic001G436450 Sobic001G087850--Sobic002G147550 Sobic001G087850--Sobic006G176900 Sobic001G087850--Sobic003G404050 Sobic001G087850--Sobic001G045900 Sobic001G087850--Sobic004G187701 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic001G087850--Sobic006G065000
Octagon: transcription factors


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