Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G042700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q958
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G168700 "oxidative phosphorylation, ATP production, stroma side of thylakoid membranes"(PubMedID : 8481382)@cytochrome b6, putative, expressed K02635: cytochrome b6
2 Sobic.004G120150 - K02132: ATPeF1A, ATP5A1, F-type H+-transporting ATPase subunit alpha
3 Sobic.003G394701 - -
4 Sobic.006G107766 - -
5 Sobic.003G029150 - -
6 Sobic.001G249800 no apical meristem protein, expressed -
7 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.001G255866 - -
9 Sobic.003G404050 - -
10 Sobic.001G436450 - -
11 Sobic.006G176900 - -
12 Sobic.009G097400 - -
13 Sobic.K032350 - -
14 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -
15 Sobic.004G127733 - -
16 Sobic.007G046700 - -
17 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
18 Sobic.007G132650 - -
19 Sobic.005G118500 expressed protein -
20 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4


Gene co-expression network
sample Sobic002G042700 Sobic002G042700 Sobic003G168700 Sobic003G168700 Sobic002G042700--Sobic003G168700 Sobic004G120150 Sobic004G120150 Sobic002G042700--Sobic004G120150 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic002G042700--Sobic003G394701 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic002G042700--Sobic006G107766 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic002G042700--Sobic003G029150 Sobic001G249800 Sobic001G249800 Sobic002G042700--Sobic001G249800 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic002G042700--Sobic003G112100 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic002G042700--Sobic001G255866 Sobic003G404050 Sobic003G404050 Sobic002G042700--Sobic003G404050 Sobic003G168700--Sobic002G042700 Sobic003G168700--Sobic003G112100 Sobic003G168700--Sobic003G394701 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic003G168700--Sobic010G123650 Sobic003G168700--Sobic003G404050 Sobic004G215650 Sobic004G215650 Sobic003G168700--Sobic004G215650 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic003G168700--Sobic008G156800 Sobic003G168700--Sobic003G029150 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic003G168700--Sobic004G129400 SobicK032350 SobicK032350 Sobic004G120150--SobicK032350 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic004G120150--Sobic006G029850 Sobic004G120150--Sobic002G042700 Sobic001G506200 Sobic001G506200 Sobic004G120150--Sobic001G506200 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic004G120150--Sobic001G383350 SobicK032200 SobicK032200 Sobic004G120150--SobicK032200 Sobic004G120150--Sobic006G107766 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic004G120150--Sobic002G134800 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic004G120150--Sobic009G209650 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic003G394701--Sobic007G046700 Sobic003G394701--Sobic001G255866 Sobic003G394701--Sobic006G107766 Sobic003G394701--Sobic004G129400 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic009G257000 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic003G394701--Sobic004G133201 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic003G394701--Sobic004G274300 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic003G394701--Sobic003G169550 Sobic003G394701--Sobic003G112100 Sobic006G107766--Sobic003G394701 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic006G107766--Sobic006G035350 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic006G107766--Sobic003G260500 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic006G107766--Sobic008G119600 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic006G107766--Sobic003G187600 Sobic006G107766--Sobic004G274300 Sobic006G107766--Sobic004G133201 Sobic006G107766--Sobic001G255866 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G107766--Sobic004G115100 Sobic003G029150--Sobic003G187600 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic003G029150--Sobic001G045900 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic003G029150--Sobic004G127733 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic003G029150--Sobic006G176900 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic003G029150--Sobic007G103200 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic003G029150--Sobic007G132650 Sobic003G029150--Sobic008G119600 Sobic003G029150--Sobic006G107766 Sobic001G045100 Sobic001G045100 Sobic003G029150--Sobic001G045100 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic001G249800--Sobic001G436450 Sobic001G249800--Sobic006G176900 Sobic001G249800--Sobic008G119600 Sobic001G249800--Sobic006G107766 Sobic001G249800--Sobic007G103200 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic001G249800--Sobic004G130500 Sobic001G249800--Sobic004G127733 Sobic001G249800--Sobic002G134800 Sobic001G249800--Sobic002G042700 Sobic003G112100--Sobic004G129400 Sobic003G112100--Sobic006G176900 Sobic003G112100--Sobic008G156800 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic003G112100--Sobic003G406850 Sobic003G112100--Sobic003G394701 Sobic003G112100--Sobic003G169550 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic003G112100--Sobic003G335100 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic003G112100--Sobic002G147550 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic003G112100--Sobic001G323101 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic001G255866--Sobic007G090433 Sobic001G255866--Sobic009G257000 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic001G255866--Sobic001G420150 Sobic001G255866--Sobic003G394701 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic001G255866--Sobic001G423200 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic001G255866--Sobic007G116300 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic001G255866--Sobic001G093400 Sobic001G255866--Sobic006G107766 Sobic001G255866--Sobic004G133201 Sobic003G404050--Sobic001G436450 Sobic003G404050--Sobic003G406850 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic003G404050--Sobic010G011100 Sobic003G404050--Sobic010G123650 Sobic003G404050--Sobic002G147550 Sobic003G404050--Sobic002G042700 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic003G404050--Sobic008G116800 Sobic003G404050--Sobic001G249800 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic003G404050--Sobic001G087850
Octagon: transcription factors


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