Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G168700.1
Synonym Sb03g017580, ATP synthase delta chain, ATPD, chloroplastic
Functional annotation "oxidative phosphorylation, ATP production, stroma side of thylakoid membranes" (PubMedID : 8481382)
cytochrome b6, putative, expressed
UniProt Q09EK8 , C5XL99 , A1E9V4
Pfam PF00033
Panther DB PTHR19271 PTHR19271:SF8
NCBI CDD KOG4663; Cytochrome b
KEGG Orthology K02635; cytochrome b6
Gene Ontology GO:0016020; membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR ATCG00720 : photosynthetic electron transfer B
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g57942.1 : cytochrome b6, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT65903 , PNT73981 , KQK18190 , KQK08341 , PNT63458 , PNT67432 , PNT78215 , KQK12751
Barley HORVU2Hr1G062090.1 , HORVU2Hr1G048420.1 , AGP50784 , HORVU7Hr1G052180.1 , HORVU6Hr1G049420.1 , HORVU1Hr1G003510.1 , HORVU1Hr1G063040.1 , HORVU5Hr1G065020.1 , HORVU0Hr1G037920.1
Wheat -
Populus PNT08268 , PNT08262 , PNT12262 , PNT18803 , PNT12910 , PNT55360


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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11 Sobic.005G118500 expressed protein -
12 Sobic.007G046700 - -
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20 Sobic.006G176900 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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