Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G156800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PDZ1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.008G156800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
2 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -
3 Sobic.001G205950 - -
4 Sobic.003G169550 - -
5 Sobic.007G054200 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G394701 - -
7 Sobic.006G258100 - -
8 Sobic.001G323101 - -
9 Sobic.007G046700 - -
10 Sobic.003G406850 - -
11 Sobic.003G123950 - -
12 Sobic.008G116800 expressed protein -
13 Sobic.003G168700 "oxidative phosphorylation, ATP production, stroma side of thylakoid membranes"(PubMedID : 8481382)@cytochrome b6, putative, expressed K02635: cytochrome b6
14 Sobic.009G058900 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
15 Sobic.003G335100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G053700 expressed protein -
17 Sobic.006G176900 - -
18 Sobic.003G069400 - -
19 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G133201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic008G156800--Sobic003G112100 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic008G156800--Sobic004G129400 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic008G156800--Sobic001G205950 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic008G156800--Sobic003G169550 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic008G156800--Sobic007G054200 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic008G156800--Sobic003G394701 Sobic006G258100 Sobic006G258100 Sobic008G156800--Sobic006G258100 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic008G156800--Sobic001G323101 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic008G156800--Sobic007G046700 Sobic003G112100--Sobic004G129400 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic003G112100--Sobic006G176900 Sobic003G112100--Sobic008G156800 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic003G112100--Sobic003G406850 Sobic003G112100--Sobic003G394701 Sobic003G112100--Sobic003G169550 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic003G112100--Sobic003G335100 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic003G112100--Sobic002G147550 Sobic003G112100--Sobic001G323101 Sobic004G129400--Sobic003G112100 Sobic004G129400--Sobic003G394701 Sobic004G129400--Sobic003G169550 Sobic004G129400--Sobic008G156800 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic004G129400--Sobic004G274300 Sobic004G129400--Sobic006G176900 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic004G129400--Sobic001G255866 Sobic004G129400--Sobic007G046700 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G129400--Sobic004G133201 Sobic001G205950--Sobic008G156800 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic001G205950--Sobic010G176000 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic001G205950--Sobic008G116800 Sobic001G205950--Sobic003G112100 Sobic001G205950--Sobic004G129400 Sobic001G205950--Sobic003G394701 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic001G205950--Sobic003G238750 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic001G205950--Sobic010G053700 Sobic001G205950--Sobic007G046700 Sobic003G169550--Sobic004G133201 Sobic003G169550--Sobic004G129400 Sobic003G169550--Sobic003G394701 Sobic003G169550--Sobic004G274300 Sobic003G169550--Sobic003G112100 Sobic003G169550--Sobic007G046700 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic003G169550--Sobic004G134400 Sobic003G169550--Sobic001G323101 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic003G169550--Sobic009G079600 Sobic007G054200--Sobic007G046700 Sobic007G054200--Sobic003G394701 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic007G054200--Sobic009G058900 Sobic007G054200--Sobic003G169550 Sobic007G054200--Sobic001G323101 Sobic007G054200--Sobic008G156800 Sobic007G054200--Sobic004G133201 Sobic007G054200--Sobic004G274300 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic007G054200--Sobic003G187600 Sobic003G394701--Sobic007G046700 Sobic003G394701--Sobic001G255866 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic003G394701--Sobic006G107766 Sobic003G394701--Sobic004G129400 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic004G133201 Sobic003G394701--Sobic004G274300 Sobic003G394701--Sobic003G169550 Sobic003G394701--Sobic003G112100 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic006G258100--Sobic003G069400 Sobic006G258100--Sobic003G169550 Sobic006G258100--Sobic008G156800 Sobic006G258100--Sobic007G054200 Sobic006G258100--Sobic003G335100 Sobic006G258100--Sobic003G112100 Sobic006G258100--Sobic009G058900 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic006G258100--Sobic002G074900 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic006G258100--Sobic001G229850 Sobic001G323101--Sobic009G079600 Sobic001G323101--Sobic004G134400 Sobic001G323101--Sobic003G187600 Sobic001G323101--Sobic004G274300 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic001G323101--Sobic007G132650 Sobic001G323101--Sobic003G112100 Sobic001G323101--Sobic004G129400 Sobic001G323101--Sobic003G169550 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic001G323101--Sobic007G127200 Sobic007G046700--Sobic003G394701 Sobic007G046700--Sobic007G054200 Sobic007G046700--Sobic003G187600 Sobic007G046700--Sobic004G133201 Sobic007G046700--Sobic009G257000 Sobic007G046700--Sobic006G107766 Sobic005G118500 Sobic005G118500 Sobic007G046700--Sobic005G118500 Sobic007G046700--Sobic004G129400 Sobic007G046700--Sobic004G274300
Octagon: transcription factors


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