Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G116800.2
Synonym Sb08g017040
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PE79
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g35070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054365
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G147550 - -
2 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
3 Sobic.003G406850 - -
4 Sobic.003G404050 - -
5 Sobic.006G176900 - -
6 Sobic.008G156800 - -
7 Sobic.001G205950 - -
8 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -
9 Sobic.010G123650 - -
10 Sobic.004G207733 - -
11 Sobic.002G246100 - -
12 Sobic.007G004400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
13 Sobic.006G223601 - -
14 Sobic.003G335100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G436450 - -
16 Sobic.009G079400 EMB2261, putative, expressed -
17 Sobic.001G087850 - -
18 Sobic.001G016050 - -
19 Sobic.008G115200 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G249800 no apical meristem protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic008G116800--Sobic002G147550 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic008G116800--Sobic003G112100 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic008G116800--Sobic003G406850 Sobic003G404050 Sobic003G404050 Sobic008G116800--Sobic003G404050 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic008G116800--Sobic006G176900 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic008G116800--Sobic008G156800 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic008G116800--Sobic001G205950 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic008G116800--Sobic004G129400 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic008G116800--Sobic010G123650 Sobic002G147550--Sobic006G176900 Sobic002G147550--Sobic008G116800 Sobic002G147550--Sobic003G406850 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic002G147550--Sobic006G223601 Sobic002G147550--Sobic003G112100 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic002G147550--Sobic002G246100 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic002G147550--Sobic004G207733 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic002G147550--Sobic006G223101 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic002G147550--Sobic001G087850 Sobic003G112100--Sobic004G129400 Sobic003G112100--Sobic006G176900 Sobic003G112100--Sobic008G156800 Sobic003G112100--Sobic003G406850 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic003G112100--Sobic003G394701 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic003G112100--Sobic003G169550 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic003G112100--Sobic003G335100 Sobic003G112100--Sobic002G147550 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic003G112100--Sobic001G323101 Sobic003G406850--Sobic006G223601 Sobic003G406850--Sobic003G112100 Sobic003G406850--Sobic002G147550 Sobic003G406850--Sobic003G335100 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic003G406850--Sobic007G004400 Sobic003G406850--Sobic006G223101 Sobic003G406850--Sobic008G116800 Sobic003G406850--Sobic003G404050 Sobic003G406850--Sobic006G176900 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic003G404050--Sobic001G436450 Sobic003G404050--Sobic003G406850 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic003G404050--Sobic010G011100 Sobic003G404050--Sobic010G123650 Sobic003G404050--Sobic002G147550 Sobic002G042700 Sobic002G042700 Sobic003G404050--Sobic002G042700 Sobic003G404050--Sobic008G116800 Sobic001G249800 Sobic001G249800 Sobic003G404050--Sobic001G249800 Sobic003G404050--Sobic001G087850 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic006G176900--Sobic004G127733 Sobic006G176900--Sobic003G112100 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic006G176900--Sobic001G045900 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic006G176900--Sobic002G154450 Sobic006G176900--Sobic004G207733 Sobic006G176900--Sobic002G147550 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic006G176900--Sobic008G119600 Sobic006G176900--Sobic004G129400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic006G176900--Sobic007G127200 Sobic008G156800--Sobic003G112100 Sobic008G156800--Sobic004G129400 Sobic008G156800--Sobic001G205950 Sobic008G156800--Sobic003G169550 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic008G156800--Sobic007G054200 Sobic008G156800--Sobic003G394701 Sobic006G258100 Sobic006G258100 Sobic008G156800--Sobic006G258100 Sobic008G156800--Sobic001G323101 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic008G156800--Sobic007G046700 Sobic001G205950--Sobic008G156800 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic001G205950--Sobic010G176000 Sobic001G205950--Sobic008G116800 Sobic001G205950--Sobic003G112100 Sobic001G205950--Sobic004G129400 Sobic001G205950--Sobic003G394701 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic001G205950--Sobic003G238750 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic001G205950--Sobic010G053700 Sobic001G205950--Sobic007G046700 Sobic004G129400--Sobic003G112100 Sobic004G129400--Sobic003G394701 Sobic004G129400--Sobic003G169550 Sobic004G129400--Sobic008G156800 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic004G129400--Sobic004G274300 Sobic004G129400--Sobic006G176900 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic004G129400--Sobic001G255866 Sobic004G129400--Sobic007G046700 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G129400--Sobic004G133201 Sobic010G123650--Sobic001G087850 Sobic010G123650--Sobic004G207733 Sobic010G123650--Sobic003G404050 Sobic010G123650--Sobic002G147550 Sobic010G123650--Sobic003G112100 Sobic010G123650--Sobic001G436450 Sobic003G168700 Sobic003G168700 Sobic010G123650--Sobic003G168700 Sobic010G123650--Sobic006G176900 Sobic010G123650--Sobic001G045900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.