Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G087850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S4X2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G123650 - -
2 Sobic.004G207733 - -
3 Sobic.001G436450 - -
4 Sobic.002G147550 - -
5 Sobic.006G176900 - -
6 Sobic.003G404050 - -
7 Sobic.001G045900 polygalacturonase, putative, expressed -
8 Sobic.004G187701 - -
9 Sobic.006G065000 - -
10 Sobic.004G127733 - -
11 Sobic.001G504300 - -
12 Sobic.009G079400 EMB2261, putative, expressed -
13 Sobic.001G249800 no apical meristem protein, expressed -
14 Sobic.009G184450 - -
15 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
16 Sobic.003G244250 - -
17 Sobic.004G260250 - -
18 Sobic.003G029150 - -
19 Sobic.001G045100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.002G246100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic001G087850--Sobic010G123650 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic001G087850--Sobic004G207733 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic001G087850--Sobic001G436450 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic001G087850--Sobic002G147550 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic001G087850--Sobic006G176900 Sobic003G404050 Sobic003G404050 Sobic001G087850--Sobic003G404050 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic001G087850--Sobic001G045900 Sobic004G187701 Sobic004G187701 Sobic001G087850--Sobic004G187701 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic001G087850--Sobic006G065000 Sobic010G123650--Sobic001G087850 Sobic010G123650--Sobic004G207733 Sobic010G123650--Sobic003G404050 Sobic010G123650--Sobic002G147550 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic010G123650--Sobic003G112100 Sobic010G123650--Sobic001G436450 Sobic003G168700 Sobic003G168700 Sobic010G123650--Sobic003G168700 Sobic010G123650--Sobic006G176900 Sobic010G123650--Sobic001G045900 Sobic004G207733--Sobic001G087850 Sobic004G207733--Sobic001G045900 Sobic004G207733--Sobic006G176900 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic004G207733--Sobic004G127733 Sobic004G207733--Sobic010G123650 Sobic004G207733--Sobic002G147550 Sobic004G207733--Sobic003G112100 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic004G207733--Sobic002G154450 Sobic004G207733--Sobic001G436450 Sobic001G436450--Sobic003G404050 Sobic001G249800 Sobic001G249800 Sobic001G436450--Sobic001G249800 Sobic001G436450--Sobic001G087850 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic001G436450--Sobic010G011100 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic001G436450--Sobic003G244250 Sobic001G436450--Sobic006G176900 Sobic001G436450--Sobic004G207733 Sobic001G436450--Sobic004G187701 Sobic001G436450--Sobic010G123650 Sobic002G147550--Sobic006G176900 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic002G147550--Sobic008G116800 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic002G147550--Sobic003G406850 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic002G147550--Sobic006G223601 Sobic002G147550--Sobic003G112100 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic002G147550--Sobic002G246100 Sobic002G147550--Sobic004G207733 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic002G147550--Sobic006G223101 Sobic002G147550--Sobic001G087850 Sobic006G176900--Sobic004G127733 Sobic006G176900--Sobic003G112100 Sobic006G176900--Sobic001G045900 Sobic006G176900--Sobic002G154450 Sobic006G176900--Sobic004G207733 Sobic006G176900--Sobic002G147550 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic006G176900--Sobic008G119600 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic006G176900--Sobic004G129400 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic006G176900--Sobic007G127200 Sobic003G404050--Sobic001G436450 Sobic003G404050--Sobic003G406850 Sobic003G404050--Sobic010G011100 Sobic003G404050--Sobic010G123650 Sobic003G404050--Sobic002G147550 Sobic002G042700 Sobic002G042700 Sobic003G404050--Sobic002G042700 Sobic003G404050--Sobic008G116800 Sobic003G404050--Sobic001G249800 Sobic003G404050--Sobic001G087850 Sobic001G045900--Sobic004G127733 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic001G045900--Sobic010G052100 Sobic001G045900--Sobic007G127200 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic001G045900--Sobic010G225175 Sobic001G045900--Sobic004G207733 Sobic001G045900--Sobic006G176900 Sobic001G045100 Sobic001G045100 Sobic001G045900--Sobic001G045100 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic001G045900--Sobic007G103200 Sobic001G045900--Sobic002G154450 Sobic004G187701--Sobic001G436450 Sobic009G079400 Sobic009G079400 Sobic004G187701--Sobic009G079400 Sobic004G187701--Sobic001G087850 Sobic004G187701--Sobic006G176900 Sobic004G187701--Sobic002G147550 Sobic004G187701--Sobic004G207733 Sobic004G187701--Sobic004G127733 Sobic004G187701--Sobic003G244250 Sobic004G187701--Sobic010G123650 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic006G065000--Sobic009G184450 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic006G065000--Sobic004G023800 Sobic006G065000--Sobic001G087850 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic006G065000--Sobic003G288700 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic006G065000--Sobic008G056000 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic006G065000--Sobic001G504300 Sobic006G064900 Sobic006G064900 Sobic006G065000--Sobic006G064900 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic006G065000--Sobic001G440401 Sobic006G065000--Sobic004G207733
Octagon: transcription factors


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