Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G054200.1
Synonym Sb07g004360
Functional annotation harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
UniProt C5YHG4
Pfam -
Panther DB PTHR31852 PTHR31852:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45320 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g49650.1 : harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055062
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.007G054200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G046700 - -
2 Sobic.003G394701 - -
3 Sobic.009G058900 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
4 Sobic.003G169550 - -
5 Sobic.001G323101 - -
6 Sobic.008G156800 - -
7 Sobic.004G133201 - -
8 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
10 Sobic.009G079600 - -
11 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -
12 Sobic.007G132650 - -
13 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
14 Sobic.004G134400 - -
15 Sobic.006G258100 - -
16 Sobic.009G257000 - -
17 Sobic.010G163666 - -
18 Sobic.003G069400 - -
19 Sobic.002G074900 receptor kinase, putative, expressed -
20 Sobic.010G264150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic007G054200--Sobic007G046700 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic007G054200--Sobic003G394701 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic007G054200--Sobic009G058900 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic007G054200--Sobic003G169550 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic007G054200--Sobic001G323101 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic007G054200--Sobic008G156800 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic007G054200--Sobic004G133201 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic007G054200--Sobic004G274300 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic007G054200--Sobic003G187600 Sobic007G046700--Sobic003G394701 Sobic007G046700--Sobic007G054200 Sobic007G046700--Sobic003G187600 Sobic007G046700--Sobic004G133201 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic007G046700--Sobic009G257000 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic007G046700--Sobic006G107766 Sobic005G118500 Sobic005G118500 Sobic007G046700--Sobic005G118500 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic007G046700--Sobic004G129400 Sobic007G046700--Sobic004G274300 Sobic003G394701--Sobic007G046700 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic003G394701--Sobic001G255866 Sobic003G394701--Sobic006G107766 Sobic003G394701--Sobic004G129400 Sobic003G394701--Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic004G133201 Sobic003G394701--Sobic004G274300 Sobic003G394701--Sobic003G169550 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic003G394701--Sobic003G112100 Sobic009G058900--Sobic007G054200 Sobic009G058900--Sobic008G156800 Sobic009G058900--Sobic007G046700 Sobic006G258100 Sobic006G258100 Sobic009G058900--Sobic006G258100 Sobic009G058900--Sobic003G169550 Sobic009G058900--Sobic004G129400 Sobic009G058900--Sobic004G133201 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic009G058900--Sobic003G069400 Sobic009G058900--Sobic001G323101 Sobic003G169550--Sobic004G133201 Sobic003G169550--Sobic004G129400 Sobic003G169550--Sobic003G394701 Sobic003G169550--Sobic004G274300 Sobic003G169550--Sobic003G112100 Sobic003G169550--Sobic007G046700 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic003G169550--Sobic004G134400 Sobic003G169550--Sobic001G323101 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic003G169550--Sobic009G079600 Sobic001G323101--Sobic009G079600 Sobic001G323101--Sobic004G134400 Sobic001G323101--Sobic003G187600 Sobic001G323101--Sobic004G274300 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic001G323101--Sobic007G132650 Sobic001G323101--Sobic003G112100 Sobic001G323101--Sobic004G129400 Sobic001G323101--Sobic003G169550 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic001G323101--Sobic007G127200 Sobic008G156800--Sobic003G112100 Sobic008G156800--Sobic004G129400 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic008G156800--Sobic001G205950 Sobic008G156800--Sobic003G169550 Sobic008G156800--Sobic007G054200 Sobic008G156800--Sobic003G394701 Sobic008G156800--Sobic006G258100 Sobic008G156800--Sobic001G323101 Sobic008G156800--Sobic007G046700 Sobic004G133201--Sobic004G274300 Sobic004G133201--Sobic006G107766 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic004G133201--Sobic008G115200 Sobic004G133201--Sobic003G169550 Sobic004G133201--Sobic003G394701 Sobic004G133201--Sobic007G046700 Sobic004G133201--Sobic004G134400 Sobic004G133201--Sobic001G255866 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic004G133201--Sobic007G090433 Sobic004G274300--Sobic004G134400 Sobic004G274300--Sobic009G079600 Sobic004G274300--Sobic003G187600 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic004G274300--Sobic003G260500 Sobic004G274300--Sobic004G133201 Sobic004G274300--Sobic007G132650 Sobic004G274300--Sobic006G107766 Sobic004G274300--Sobic007G127200 Sobic004G274300--Sobic003G394701 Sobic003G187600--Sobic004G274300 Sobic003G187600--Sobic009G079600 Sobic003G187600--Sobic004G134400 Sobic003G187600--Sobic007G132650 Sobic003G187600--Sobic006G107766 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic003G187600--Sobic003G029150 Sobic003G187600--Sobic003G260500 Sobic003G187600--Sobic007G046700 Sobic003G187600--Sobic007G127200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.