Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G187600.1
Synonym
Functional annotation PPR repeat containing protein, expressed
UniProt A0A1B6Q451
Pfam PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF384
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G20740 : Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g08180.2 : PPR repeat containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045169 , Zm00025a052184
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G079600 - -
3 Sobic.004G134400 - -
4 Sobic.007G132650 - -
5 Sobic.006G107766 - -
6 Sobic.003G029150 - -
7 Sobic.003G260500 - -
8 Sobic.007G046700 - -
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10 Sobic.001G323101 - -
11 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
12 Sobic.003G394701 - -
13 Sobic.008G119600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
14 Sobic.008G100201 - -
15 Sobic.010G247750 - -
16 Sobic.004G133201 - -
17 Sobic.010G039150 - -
18 Sobic.002G256250 - -
19 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -
20 Sobic.003G169550 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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