Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G079600.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P791
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G134400 - -
2 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
4 Sobic.001G323101 - -
5 Sobic.007G127200 ECT protein, putative, expressed K07877: Ras-related protein Rab-2A
6 Sobic.010G039150 - -
7 Sobic.007G132650 - -
8 Sobic.003G260500 - -
9 Sobic.010G247750 - -
10 Sobic.004G133201 - -
11 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
12 Sobic.003G169550 - -
13 Sobic.008G093300 - -
14 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -
15 Sobic.006G107766 - -
16 Sobic.008G100201 - -
17 Sobic.003G394701 - -
18 Sobic.004G115100 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
19 Sobic.003G029150 - -
20 Sobic.007G054200 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic009G079600--Sobic004G134400 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic009G079600--Sobic004G274300 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic009G079600--Sobic003G187600 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic009G079600--Sobic001G323101 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic009G079600--Sobic007G127200 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic009G079600--Sobic010G039150 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic009G079600--Sobic007G132650 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic009G079600--Sobic003G260500 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic009G079600--Sobic010G247750 Sobic004G134400--Sobic009G079600 Sobic004G134400--Sobic004G274300 Sobic004G134400--Sobic007G127200 Sobic004G134400--Sobic003G187600 Sobic004G134400--Sobic010G247750 Sobic004G134400--Sobic003G260500 Sobic004G134400--Sobic001G323101 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic004G134400--Sobic004G133201 Sobic004G134400--Sobic007G132650 Sobic004G274300--Sobic004G134400 Sobic004G274300--Sobic009G079600 Sobic004G274300--Sobic003G187600 Sobic004G274300--Sobic003G260500 Sobic004G274300--Sobic004G133201 Sobic004G274300--Sobic007G132650 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic004G274300--Sobic006G107766 Sobic004G274300--Sobic007G127200 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic004G274300--Sobic003G394701 Sobic003G187600--Sobic004G274300 Sobic003G187600--Sobic009G079600 Sobic003G187600--Sobic004G134400 Sobic003G187600--Sobic007G132650 Sobic003G187600--Sobic006G107766 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic003G187600--Sobic003G029150 Sobic003G187600--Sobic003G260500 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic003G187600--Sobic007G046700 Sobic003G187600--Sobic007G127200 Sobic001G323101--Sobic009G079600 Sobic001G323101--Sobic004G134400 Sobic001G323101--Sobic003G187600 Sobic001G323101--Sobic004G274300 Sobic001G323101--Sobic007G132650 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic001G323101--Sobic003G112100 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic001G323101--Sobic004G129400 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic001G323101--Sobic003G169550 Sobic001G323101--Sobic007G127200 Sobic007G127200--Sobic010G247750 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic007G127200--Sobic004G127733 Sobic007G127200--Sobic004G134400 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic007G127200--Sobic010G052100 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic007G127200--Sobic001G045900 Sobic007G127200--Sobic009G079600 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic007G127200--Sobic006G035350 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic007G127200--Sobic008G093300 Sobic007G127200--Sobic003G260500 Sobic010G039150--Sobic009G079600 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic010G039150--Sobic006G029850 Sobic010G039150--Sobic004G274300 Sobic010G039150--Sobic007G132650 Sobic010G039150--Sobic004G134400 Sobic010G039150--Sobic003G187600 Sobic010G039150--Sobic003G260500 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic010G039150--Sobic004G115100 Sobic010G039150--Sobic001G323101 Sobic007G132650--Sobic003G260500 Sobic007G132650--Sobic004G274300 Sobic007G132650--Sobic003G187600 Sobic007G132650--Sobic009G079600 Sobic007G132650--Sobic006G107766 Sobic007G132650--Sobic004G134400 Sobic007G132650--Sobic001G323101 Sobic007G132650--Sobic010G039150 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic007G132650--Sobic006G149900 Sobic003G260500--Sobic010G247750 Sobic003G260500--Sobic007G132650 Sobic003G260500--Sobic006G035350 Sobic003G260500--Sobic004G274300 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic003G260500--Sobic008G100201 Sobic003G260500--Sobic006G107766 Sobic003G260500--Sobic007G127200 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic003G260500--Sobic010G143700 Sobic003G260500--Sobic003G187600 Sobic010G247750--Sobic007G127200 Sobic010G247750--Sobic003G260500 Sobic010G247750--Sobic006G035350 Sobic010G247750--Sobic008G093300 Sobic010G247750--Sobic004G134400 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic010G247750--Sobic007G103200 Sobic010G247750--Sobic010G143700 Sobic010G247750--Sobic010G052100 Sobic010G247750--Sobic009G079600
Octagon: transcription factors


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