Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G255866.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S7P2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G090433 - -
2 Sobic.009G257000 - -
3 Sobic.001G420150 - -
4 Sobic.003G394701 - -
5 Sobic.001G423200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
6 Sobic.007G116300 - -
7 Sobic.001G093400 - -
8 Sobic.006G107766 - -
9 Sobic.004G133201 - -
10 Sobic.004G129400 pectinesterase, putative, expressed -
11 Sobic.004G276600 expressed protein -
12 Sobic.006G107700 OsMADS27 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
13 Sobic.007G046700 - -
14 Sobic.009G204501 - -
15 Sobic.006G035350 - K02986: RP-S4, small subunit ribosomal protein S4
16 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G115100 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed K03043: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
18 Sobic.008G100201 - -
19 Sobic.003G172966 - K05582: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K
20 Sobic.003G056200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic001G255866--Sobic007G090433 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G255866--Sobic009G257000 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic001G255866--Sobic001G420150 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic001G255866--Sobic003G394701 Sobic001G423200 Sobic001G423200 Sobic001G255866--Sobic001G423200 Sobic007G116300 Sobic007G116300 Sobic001G255866--Sobic007G116300 Sobic001G093400 Sobic001G093400 Sobic001G255866--Sobic001G093400 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic001G255866--Sobic006G107766 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic001G255866--Sobic004G133201 Sobic007G090433--Sobic001G255866 Sobic007G090433--Sobic007G116300 Sobic004G276600 Sobic004G276600 Sobic007G090433--Sobic004G276600 Sobic007G090433--Sobic009G257000 Sobic007G090433--Sobic001G420150 Sobic007G090433--Sobic001G093400 Sobic007G090433--Sobic003G394701 Sobic007G090433--Sobic001G423200 Sobic007G090433--Sobic004G133201 Sobic009G257000--Sobic001G255866 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic009G257000--Sobic006G107700 Sobic009G257000--Sobic003G394701 Sobic009G257000--Sobic001G093400 Sobic009G257000--Sobic007G090433 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic009G257000--Sobic007G046700 Sobic009G257000--Sobic004G133201 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic009G257000--Sobic009G210250 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic009G257000--Sobic003G056200 Sobic001G420150--Sobic007G116300 Sobic001G420150--Sobic001G093400 Sobic001G420150--Sobic004G276600 Sobic001G420150--Sobic001G423200 Sobic001G420150--Sobic001G255866 Sobic001G420150--Sobic007G090433 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic001G420150--Sobic004G129400 Sobic001G420150--Sobic004G133201 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic001G420150--Sobic003G169700 Sobic003G394701--Sobic007G046700 Sobic003G394701--Sobic001G255866 Sobic003G394701--Sobic006G107766 Sobic003G394701--Sobic004G129400 Sobic003G394701--Sobic009G257000 Sobic003G394701--Sobic004G133201 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic003G394701--Sobic004G274300 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic003G394701--Sobic003G169550 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic003G394701--Sobic003G112100 Sobic001G423200--Sobic001G420150 Sobic001G423200--Sobic001G255866 Sobic001G423200--Sobic007G116300 Sobic001G423200--Sobic007G090433 Sobic001G423200--Sobic001G093400 Sobic001G423200--Sobic004G276600 Sobic001G423200--Sobic004G129400 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic001G423200--Sobic006G035350 Sobic001G423200--Sobic009G257000 Sobic007G116300--Sobic001G420150 Sobic007G116300--Sobic001G093400 Sobic007G116300--Sobic001G255866 Sobic007G116300--Sobic007G090433 Sobic007G116300--Sobic001G423200 Sobic007G116300--Sobic004G276600 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic007G116300--Sobic009G260550 Sobic007G116300--Sobic004G129400 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic007G116300--Sobic006G059150 Sobic001G093400--Sobic007G116300 Sobic001G093400--Sobic001G420150 Sobic001G093400--Sobic009G260550 Sobic001G093400--Sobic009G257000 Sobic001G093400--Sobic001G255866 Sobic001G093400--Sobic003G169700 Sobic001G093400--Sobic007G090433 Sobic001G093400--Sobic004G276600 Sobic001G093400--Sobic001G423200 Sobic006G107766--Sobic003G394701 Sobic006G107766--Sobic006G035350 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic006G107766--Sobic003G260500 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic006G107766--Sobic008G119600 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic006G107766--Sobic003G187600 Sobic006G107766--Sobic004G274300 Sobic006G107766--Sobic004G133201 Sobic006G107766--Sobic001G255866 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic006G107766--Sobic004G115100 Sobic004G133201--Sobic004G274300 Sobic004G133201--Sobic006G107766 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic004G133201--Sobic008G115200 Sobic004G133201--Sobic003G169550 Sobic004G133201--Sobic003G394701 Sobic004G133201--Sobic007G046700 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic004G133201--Sobic004G134400 Sobic004G133201--Sobic001G255866 Sobic004G133201--Sobic007G090433
Octagon: transcription factors


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