Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G296250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VZK1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G118000 ATP synthase, putative, expressed -
2 Sobic.007G132650 - -
3 Sobic.010G039150 - -
4 Sobic.003G168600 cytochrome b6-f complex subunit 4, putative, expressed K02637: cytochrome b6-f complex subunit 4
5 Sobic.004G272950 - -
6 Sobic.001G401750 - -
7 Sobic.004G127350 - -
8 Sobic.003G072000 receptor kinase, putative, expressed -
9 Sobic.009G095720 - -
10 Sobic.002G134800 - -
11 Sobic.005G194400 ribulose bisphosphate carboxylase large chain precursor, putative, expressed K01601: ribulose-bisphosphate carboxylase large chain
12 Sobic.006G264400 co-chaperone GrpE protein, putative, expressed -
13 Sobic.K043600 - -
14 Sobic.005G173100 - -
15 Sobic.009G209650 - -
16 Sobic.003G260500 - -
17 Sobic.006G149900 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G098050 - -
19 Sobic.001G323101 - -
20 Sobic.009G079600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G296250 Sobic003G296250 Sobic002G118000 Sobic002G118000 Sobic003G296250--Sobic002G118000 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic003G296250--Sobic007G132650 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic003G296250--Sobic010G039150 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic003G296250--Sobic003G168600 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic003G296250--Sobic004G272950 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic003G296250--Sobic001G401750 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic003G296250--Sobic004G127350 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic003G296250--Sobic003G072000 Sobic009G095720 Sobic009G095720 Sobic003G296250--Sobic009G095720 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic002G118000--Sobic009G209650 Sobic002G118000--Sobic003G168600 Sobic005G194400 Sobic005G194400 Sobic002G118000--Sobic005G194400 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic002G118000--Sobic007G103200 Sobic002G118000--Sobic004G272950 Sobic005G173100 Sobic005G173100 Sobic002G118000--Sobic005G173100 Sobic002G118000--Sobic007G132650 Sobic002G118000--Sobic003G296250 SobicK032350 SobicK032350 Sobic002G118000--SobicK032350 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic007G132650--Sobic003G260500 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic007G132650--Sobic004G274300 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic007G132650--Sobic003G187600 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic007G132650--Sobic009G079600 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic007G132650--Sobic006G107766 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic007G132650--Sobic004G134400 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic007G132650--Sobic001G323101 Sobic007G132650--Sobic010G039150 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic007G132650--Sobic006G149900 Sobic010G039150--Sobic009G079600 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic010G039150--Sobic006G029850 Sobic010G039150--Sobic004G274300 Sobic010G039150--Sobic007G132650 Sobic010G039150--Sobic004G134400 Sobic010G039150--Sobic003G187600 Sobic010G039150--Sobic003G260500 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic010G039150--Sobic004G115100 Sobic010G039150--Sobic001G323101 SobicK031300 SobicK031300 Sobic003G168600--SobicK031300 Sobic003G168600--Sobic009G095720 Sobic003G168600--Sobic004G272950 Sobic003G168600--Sobic009G209650 SobicK043600 SobicK043600 Sobic003G168600--SobicK043600 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic003G168600--Sobic006G264400 SobicK032400 SobicK032400 Sobic003G168600--SobicK032400 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic003G168600--Sobic004G223700 Sobic003G168600--Sobic005G173100 Sobic004G272950--Sobic004G223700 Sobic004G272950--Sobic003G168600 Sobic004G272950--Sobic009G209650 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic004G272950--Sobic001G081450 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic004G272950--Sobic003G172000 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic004G272950--Sobic007G116150 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic004G272950--Sobic002G121050 Sobic004G272950--SobicK031300 Sobic002G152100 Sobic002G152100 Sobic004G272950--Sobic002G152100 Sobic002G112200 Sobic002G112200 Sobic001G401750--Sobic002G112200 Sobic001G401750--Sobic004G272950 Sobic001G401750--Sobic004G223700 Sobic001G401750--Sobic009G095720 Sobic001G401750--Sobic003G168600 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic001G401750--Sobic007G098050 Sobic001G401750--Sobic001G081450 Sobic001G401750--Sobic006G264400 Sobic001G401750--SobicK031300 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic004G127350--Sobic009G094100 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic004G127350--Sobic010G052100 Sobic004G127350--Sobic007G103200 Sobic004G127350--Sobic006G149900 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic004G127350--Sobic010G247750 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic004G127350--Sobic007G127200 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic004G127350--Sobic010G225175 Sobic004G127350--Sobic003G260500 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic004G127350--Sobic001G045900 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic003G072000--Sobic005G187700 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic003G072000--Sobic002G134800 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic003G072000--Sobic009G213150 Sobic001G032850 Sobic001G032850 Sobic003G072000--Sobic001G032850 Sobic003G072000--Sobic004G272950 Sobic003G072000--Sobic003G168600 Sobic003G072000--SobicK043600 Sobic002G126700 Sobic002G126700 Sobic003G072000--Sobic002G126700 Sobic003G072000--Sobic001G401750 Sobic009G095720--Sobic006G264400 Sobic009G095720--Sobic003G168600 Sobic009G095720--Sobic007G098050 Sobic009G095720--SobicK031300 Sobic009G095720--SobicK032400 SobicK032600 SobicK032600 Sobic009G095720--SobicK032600 Sobic009G095720--SobicK032350 Sobic004G206000 Sobic004G206000 Sobic009G095720--Sobic004G206000 Sobic009G095720--Sobic005G173100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.