Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K043600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt -
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G168600 cytochrome b6-f complex subunit 4, putative, expressed K02637: cytochrome b6-f complex subunit 4
2 Sobic.K031300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed -
3 Sobic.004G272950 - -
4 Sobic.003G172000 - -
5 Sobic.002G121050 - -
6 Sobic.002G112200 - -
7 Sobic.009G095720 - -
8 Sobic.009G209650 - -
9 Sobic.001G401750 - -
10 Sobic.003G301050 - -
11 Sobic.004G223700 - -
12 Sobic.002G118000 ATP synthase, putative, expressed -
13 Sobic.002G074700 receptor kinase, putative, expressed -
14 Sobic.003G072000 receptor kinase, putative, expressed -
15 Sobic.002G126700 - -
16 Sobic.002G149600 - -
17 Sobic.002G152100 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.006G264400 co-chaperone GrpE protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G081450 - -
20 Sobic.005G024500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample SobicK043600 SobicK043600 Sobic003G168600 Sobic003G168600 SobicK043600--Sobic003G168600 SobicK031300 SobicK031300 SobicK043600--SobicK031300 Sobic004G272950 Sobic004G272950 SobicK043600--Sobic004G272950 Sobic003G172000 Sobic003G172000 SobicK043600--Sobic003G172000 Sobic002G121050 Sobic002G121050 SobicK043600--Sobic002G121050 Sobic002G112200 Sobic002G112200 SobicK043600--Sobic002G112200 Sobic009G095720 Sobic009G095720 SobicK043600--Sobic009G095720 Sobic009G209650 Sobic009G209650 SobicK043600--Sobic009G209650 Sobic001G401750 Sobic001G401750 SobicK043600--Sobic001G401750 Sobic003G168600--SobicK031300 Sobic003G168600--Sobic009G095720 Sobic003G168600--Sobic004G272950 Sobic003G168600--Sobic009G209650 Sobic003G168600--SobicK043600 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic003G168600--Sobic006G264400 SobicK032400 SobicK032400 Sobic003G168600--SobicK032400 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic003G168600--Sobic004G223700 Sobic005G173100 Sobic005G173100 Sobic003G168600--Sobic005G173100 SobicK031300--Sobic003G168600 SobicK031300--Sobic009G095720 SobicK031300--Sobic009G209650 Sobic002G126700 Sobic002G126700 SobicK031300--Sobic002G126700 SobicK031300--SobicK043600 SobicK031300--Sobic006G264400 SobicK031300--SobicK032400 SobicK031300--Sobic004G272950 SobicK032600 SobicK032600 SobicK031300--SobicK032600 Sobic004G272950--Sobic004G223700 Sobic004G272950--Sobic003G168600 Sobic004G272950--Sobic009G209650 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic004G272950--Sobic001G081450 Sobic004G272950--Sobic003G172000 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic004G272950--Sobic007G116150 Sobic004G272950--Sobic002G121050 Sobic004G272950--SobicK031300 Sobic002G152100 Sobic002G152100 Sobic004G272950--Sobic002G152100 Sobic003G172000--Sobic002G121050 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic003G172000--Sobic002G149600 Sobic003G172000--Sobic004G272950 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic003G172000--Sobic002G074700 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic003G172000--Sobic009G094100 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic003G172000--Sobic005G024500 Sobic003G172000--Sobic002G152100 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic003G172000--Sobic006G094900 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic003G172000--Sobic003G263450 Sobic002G121050--Sobic003G172000 Sobic002G121050--Sobic002G149600 Sobic002G121050--Sobic002G074700 Sobic002G121050--Sobic004G272950 Sobic002G121050--Sobic009G094100 Sobic002G121050--Sobic003G263450 Sobic002G121050--Sobic006G094900 Sobic002G121050--Sobic002G152100 Sobic002G121050--Sobic005G024500 Sobic002G112200--Sobic001G401750 Sobic002G112200--Sobic004G223700 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic002G112200--Sobic001G050650 Sobic002G112200--SobicK031300 Sobic002G112200--Sobic009G095720 Sobic002G112200--Sobic003G168600 Sobic002G112200--SobicK043600 Sobic002G112200--Sobic001G081450 Sobic002G112200--Sobic006G264400 Sobic009G095720--Sobic006G264400 Sobic009G095720--Sobic003G168600 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic009G095720--Sobic007G098050 Sobic009G095720--SobicK031300 Sobic009G095720--SobicK032400 Sobic009G095720--SobicK032600 SobicK032350 SobicK032350 Sobic009G095720--SobicK032350 Sobic004G206000 Sobic004G206000 Sobic009G095720--Sobic004G206000 Sobic009G095720--Sobic005G173100 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic009G209650--Sobic004G130500 Sobic009G209650--SobicK032400 Sobic009G209650--Sobic003G168600 Sobic009G209650--SobicK032350 Sobic009G209650--Sobic007G116150 Sobic009G209650--SobicK031300 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic009G209650--Sobic010G143700 Sobic009G209650--Sobic002G126700 Sobic009G209650--SobicK032600 Sobic001G401750--Sobic002G112200 Sobic001G401750--Sobic004G272950 Sobic001G401750--Sobic004G223700 Sobic001G401750--Sobic009G095720 Sobic001G401750--Sobic003G168600 Sobic001G401750--Sobic007G098050 Sobic001G401750--Sobic001G081450 Sobic001G401750--Sobic006G264400 Sobic001G401750--SobicK031300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.