Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G024500.1
Synonym Sb05g002030
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y418
Pfam -
Panther DB PTHR33087
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g50840.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G094000 expressed protein -
2 Sobic.005G019300 receptor kinase, putative, expressed -
3 Sobic.003G172000 - -
4 Sobic.002G073000 - -
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6 Sobic.006G094900 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
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9 Sobic.009G097500 - -
10 Sobic.010G061400 expressed protein -
11 Sobic.002G149600 - -
12 Sobic.003G263450 - -
13 Sobic.002G152100 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed -
14 Sobic.008G138850 - -
15 Sobic.004G272950 - -
16 Sobic.003G142500 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
17 Sobic.009G213150 - -
18 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -
19 Sobic.002G074700 receptor kinase, putative, expressed -
20 Sobic.002G018200 OsFBX209 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic005G024500--Sobic002G094000 Sobic005G019300 Sobic005G019300 Sobic005G024500--Sobic005G019300 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic005G024500--Sobic003G172000 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic005G024500--Sobic002G073000 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic005G024500--Sobic002G121050 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic005G024500--Sobic006G094900 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic005G024500--Sobic004G334501 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic005G024500--Sobic002G094100 Sobic009G097500 Sobic009G097500 Sobic005G024500--Sobic009G097500 Sobic002G094000--Sobic005G024500 Sobic002G094000--Sobic005G019300 Sobic002G094000--Sobic002G073000 Sobic002G094000--Sobic002G094100 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic002G094000--Sobic003G142500 Sobic002G094000--Sobic006G094900 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic002G094000--Sobic009G213150 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic002G094000--Sobic004G278800 Sobic002G094000--Sobic004G334501 Sobic005G019300--Sobic002G094000 Sobic005G019300--Sobic005G024500 Sobic005G019300--Sobic006G094900 Sobic005G019300--Sobic003G172000 Sobic005G019300--Sobic002G121050 Sobic005G019300--Sobic002G073000 Sobic005G019300--Sobic009G213150 Sobic005G019300--Sobic004G278800 Sobic005G019300--Sobic002G094100 Sobic003G172000--Sobic002G121050 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic003G172000--Sobic002G149600 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic003G172000--Sobic004G272950 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic003G172000--Sobic002G074700 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic003G172000--Sobic009G094100 Sobic003G172000--Sobic005G024500 Sobic002G152100 Sobic002G152100 Sobic003G172000--Sobic002G152100 Sobic003G172000--Sobic006G094900 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic003G172000--Sobic003G263450 Sobic002G073000--Sobic002G094000 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic002G073000--Sobic010G166201 Sobic002G073000--Sobic005G024500 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic002G073000--Sobic010G098800 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic002G073000--Sobic003G173200 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic002G073000--Sobic004G223700 Sobic002G073000--Sobic002G094100 Sobic002G073000--Sobic004G334501 Sobic002G073000--Sobic002G121050 Sobic002G121050--Sobic003G172000 Sobic002G121050--Sobic002G149600 Sobic002G121050--Sobic002G074700 Sobic002G121050--Sobic004G272950 Sobic002G121050--Sobic009G094100 Sobic002G121050--Sobic003G263450 Sobic002G121050--Sobic006G094900 Sobic002G121050--Sobic002G152100 Sobic002G121050--Sobic005G024500 Sobic006G094900--Sobic002G121050 Sobic006G094900--Sobic003G172000 Sobic006G094900--Sobic002G094000 Sobic006G094900--Sobic002G149600 Sobic006G094900--Sobic009G213150 Sobic006G094900--Sobic005G024500 Sobic007G179266 Sobic007G179266 Sobic006G094900--Sobic007G179266 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic006G094900--Sobic001G154450 Sobic006G094900--Sobic009G094100 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic004G334501--Sobic002G018200 Sobic004G334501--Sobic003G263450 Sobic004G334501--Sobic002G121050 Sobic004G334501--Sobic002G073000 Sobic004G334501--Sobic003G172000 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic004G334501--Sobic007G079901 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic004G334501--Sobic001G527550 Sobic004G334501--Sobic002G149600 Sobic004G334501--Sobic005G024500 Sobic002G094100--Sobic002G094000 Sobic002G094100--Sobic002G073000 Sobic001G443400 Sobic001G443400 Sobic002G094100--Sobic001G443400 Sobic002G094100--Sobic003G142500 Sobic002G094100--Sobic005G024500 Sobic002G094100--Sobic004G278800 Sobic002G094100--Sobic010G166201 Sobic002G334700 Sobic002G334700 Sobic002G094100--Sobic002G334700 Sobic002G094100--Sobic005G019300 Sobic009G097500--Sobic003G173200 Sobic009G097500--Sobic003G172000 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic009G097500--Sobic005G176300 Sobic009G097500--Sobic002G121050 Sobic009G097500--Sobic002G152100 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic009G097500--Sobic003G268100 Sobic009G097500--Sobic005G024500 SobicK031400 SobicK031400 Sobic009G097500--SobicK031400 Sobic009G188200 Sobic009G188200 Sobic009G097500--Sobic009G188200
Octagon: transcription factors


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