Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G149600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QBE1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS6B02G232300 , TraesCS2A02G132700 , TraesCS2D02G247200 , TraesCS5D02G063400 , TraesCS7D02G533100 , TraesCS6B02G187800 , TraesCS6A02G160900 , TraesCS3D02G173700 , TraesCS2D02G405900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G074700 receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.002G121050 - -
3 Sobic.003G172000 - -
4 Sobic.003G263450 - -
5 Sobic.004G072600 - -
6 Sobic.009G094100 - -
7 Sobic.001G154450 - -
8 Sobic.006G094900 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G163400 - -
10 Sobic.005G176300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.007G103200 - -
12 Sobic.004G334501 - -
13 Sobic.005G024500 expressed protein -
14 Sobic.004G130500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
15 Sobic.009G209650 - -
16 Sobic.002G152100 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed -
17 Sobic.010G052100 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
18 Sobic.003G268100 - -
19 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -
20 Sobic.004G272950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic002G149600--Sobic002G074700 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic002G149600--Sobic002G121050 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic002G149600--Sobic003G172000 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic002G149600--Sobic003G263450 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic002G149600--Sobic004G072600 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic002G149600--Sobic009G094100 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic002G149600--Sobic001G154450 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic002G149600--Sobic006G094900 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic002G149600--Sobic002G163400 Sobic002G074700--Sobic002G149600 Sobic002G074700--Sobic002G121050 Sobic002G074700--Sobic003G172000 Sobic002G074700--Sobic003G263450 Sobic002G074700--Sobic001G154450 Sobic002G074700--Sobic004G072600 Sobic002G074700--Sobic002G163400 Sobic002G074700--Sobic009G094100 Sobic002G074700--Sobic006G094900 Sobic002G121050--Sobic003G172000 Sobic002G121050--Sobic002G149600 Sobic002G121050--Sobic002G074700 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic002G121050--Sobic004G272950 Sobic002G121050--Sobic009G094100 Sobic002G121050--Sobic003G263450 Sobic002G121050--Sobic006G094900 Sobic002G152100 Sobic002G152100 Sobic002G121050--Sobic002G152100 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic002G121050--Sobic005G024500 Sobic003G172000--Sobic002G121050 Sobic003G172000--Sobic002G149600 Sobic003G172000--Sobic004G272950 Sobic003G172000--Sobic002G074700 Sobic003G172000--Sobic009G094100 Sobic003G172000--Sobic005G024500 Sobic003G172000--Sobic002G152100 Sobic003G172000--Sobic006G094900 Sobic003G172000--Sobic003G263450 Sobic003G263450--Sobic002G149600 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic003G263450--Sobic002G018200 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic003G263450--Sobic004G334501 Sobic003G263450--Sobic002G121050 Sobic003G263450--Sobic002G074700 Sobic003G263450--Sobic003G172000 Sobic003G263450--Sobic004G072600 Sobic003G263450--Sobic006G094900 Sobic004G159866 Sobic004G159866 Sobic003G263450--Sobic004G159866 Sobic004G072600--Sobic002G149600 Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic004G072600--Sobic005G176300 Sobic004G072600--Sobic009G094100 Sobic004G072600--Sobic002G074700 Sobic004G072600--Sobic002G163400 Sobic004G072600--Sobic002G121050 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic004G072600--Sobic003G251000 Sobic004G072600--Sobic003G172000 Sobic004G072600--Sobic003G263450 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic009G094100--Sobic007G103200 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic009G094100--Sobic004G127350 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic009G094100--Sobic010G052100 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic009G094100--Sobic003G268100 Sobic009G094100--Sobic005G176300 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic009G094100--Sobic010G247750 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic009G094100--Sobic010G143700 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic009G094100--Sobic004G130500 Sobic009G094100--Sobic003G172000 Sobic001G154450--Sobic002G074700 Sobic001G154450--Sobic002G149600 Sobic001G154450--Sobic002G121050 Sobic001G154450--Sobic003G172000 Sobic001G154450--Sobic009G094100 Sobic001G154450--Sobic006G094900 Sobic001G154450--Sobic004G072600 Sobic001G154450--Sobic004G127350 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic001G154450--Sobic001G521800 Sobic006G094900--Sobic002G121050 Sobic006G094900--Sobic003G172000 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic006G094900--Sobic002G094000 Sobic006G094900--Sobic002G149600 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic006G094900--Sobic009G213150 Sobic006G094900--Sobic005G024500 Sobic007G179266 Sobic007G179266 Sobic006G094900--Sobic007G179266 Sobic006G094900--Sobic001G154450 Sobic006G094900--Sobic009G094100 Sobic002G163400--Sobic004G072600 Sobic002G163400--Sobic002G149600 Sobic002G163400--Sobic002G074700 Sobic002G163400--Sobic009G094100 Sobic002G163400--Sobic003G263450 Sobic002G163400--Sobic003G251000 Sobic002G163400--Sobic001G154450 Sobic002G163500 Sobic002G163500 Sobic002G163400--Sobic002G163500 Sobic010G174000 Sobic010G174000 Sobic002G163400--Sobic010G174000
Octagon: transcription factors


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