Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G176300.2
Synonym Sb05g023580, ZAR1
Functional annotation Leucine Rich Repeat family protein, expressed
UniProt A0A1Z5RJM1
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF601
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G50950 : HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g16450.1 : Leucine Rich Repeat family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK03353
Barley HORVU5Hr1G091790.5 , HORVU5Hr1G091790.4 , HORVU5Hr1G091790.1 , HORVU5Hr1G091790.3 , HORVU5Hr1G091790.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G094100 - -
2 Sobic.010G052100 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
3 Sobic.003G268100 - -
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5 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -
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8 Sobic.006G037800 - -
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10 Sobic.002G149600 - -
11 Sobic.007G103200 - -
12 Sobic.004G260250 - -
13 Sobic.003G172000 - -
14 Sobic.002G121050 - -
15 Sobic.009G097500 - -
16 Sobic.004G310350 - -
17 Sobic.002G154450 - -
18 Sobic.006G094900 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G154600 - -
20 Sobic.K031400 ATP synthase protein YMF19, putative, expressed K02109: ATPF0B, F-type H+-transporting ATPase subunit b


Gene co-expression network
sample Sobic005G176300 Sobic005G176300 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic005G176300--Sobic009G094100 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic005G176300--Sobic010G052100 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic005G176300--Sobic003G268100 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic005G176300--Sobic004G072600 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic005G176300--Sobic003G173200 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic005G176300--Sobic003G251000 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic005G176300--Sobic010G247750 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic005G176300--Sobic006G037800 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic005G176300--Sobic004G127350 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic009G094100--Sobic007G103200 Sobic009G094100--Sobic004G127350 Sobic009G094100--Sobic010G052100 Sobic009G094100--Sobic003G268100 Sobic009G094100--Sobic005G176300 Sobic009G094100--Sobic010G247750 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic009G094100--Sobic010G143700 Sobic004G130500 Sobic004G130500 Sobic009G094100--Sobic004G130500 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic009G094100--Sobic003G172000 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic010G052100--Sobic010G225175 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic010G052100--Sobic001G045900 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic010G052100--Sobic002G154450 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic010G052100--Sobic007G127200 Sobic010G052100--Sobic004G127350 Sobic010G052100--Sobic009G094100 Sobic010G052100--Sobic007G103200 Sobic010G052100--Sobic010G247750 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic010G052100--Sobic004G127733 Sobic003G268100--Sobic010G143700 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic003G268100--Sobic007G116150 Sobic003G268100--Sobic003G173200 SobicK031400 SobicK031400 Sobic003G268100--SobicK031400 SobicK031900 SobicK031900 Sobic003G268100--SobicK031900 Sobic003G268100--Sobic004G130500 Sobic003G268100--Sobic009G094100 Sobic003G268100--Sobic010G247750 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic003G268100--Sobic006G035350 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic004G072600--Sobic002G149600 Sobic004G072600--Sobic005G176300 Sobic004G072600--Sobic009G094100 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic004G072600--Sobic002G074700 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic004G072600--Sobic002G163400 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic004G072600--Sobic002G121050 Sobic004G072600--Sobic003G251000 Sobic004G072600--Sobic003G172000 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic004G072600--Sobic003G263450 Sobic003G173200--Sobic003G268100 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic003G173200--Sobic009G215100 Sobic003G173200--SobicK031400 Sobic003G173200--Sobic007G116150 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic003G173200--Sobic010G098800 Sobic003G173200--Sobic010G143700 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic003G173200--Sobic006G053550 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic003G173200--Sobic004G223700 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic003G173200--Sobic002G073000 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic003G251000--Sobic006G149900 Sobic003G251000--Sobic002G154450 Sobic003G251000--Sobic010G052100 Sobic003G251000--Sobic009G094100 Sobic003G251000--Sobic004G127350 Sobic003G251000--Sobic005G176300 Sobic003G251000--Sobic006G037800 Sobic003G251000--Sobic004G072600 Sobic003G251000--Sobic007G103200 Sobic010G247750--Sobic007G127200 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic010G247750--Sobic003G260500 Sobic010G247750--Sobic006G035350 Sobic008G093300 Sobic008G093300 Sobic010G247750--Sobic008G093300 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic010G247750--Sobic004G134400 Sobic010G247750--Sobic007G103200 Sobic010G247750--Sobic010G143700 Sobic010G247750--Sobic010G052100 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic010G247750--Sobic009G079600 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic006G037800--Sobic010G149000 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic006G037800--Sobic007G134700 Sobic006G037800--Sobic010G052100 Sobic006G037800--Sobic002G154450 Sobic006G037800--Sobic003G251000 Sobic006G239200 Sobic006G239200 Sobic006G037800--Sobic006G239200 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic006G037800--Sobic001G202800 Sobic006G037800--Sobic005G176300 Sobic009G011050 Sobic009G011050 Sobic006G037800--Sobic009G011050 Sobic004G127350--Sobic009G094100 Sobic004G127350--Sobic010G052100 Sobic004G127350--Sobic007G103200 Sobic004G127350--Sobic006G149900 Sobic004G127350--Sobic010G247750 Sobic004G127350--Sobic007G127200 Sobic004G127350--Sobic010G225175 Sobic004G127350--Sobic003G260500 Sobic004G127350--Sobic001G045900
Octagon: transcription factors


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