Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G301050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VZM9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G167700 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
2 Sobic.K043600 - -
3 Sobic.003G072000 receptor kinase, putative, expressed -
4 Sobic.001G527550 - -
5 Sobic.005G187700 receptor kinase, putative, expressed -
6 Sobic.004G140900 - -
7 Sobic.002G074700 receptor kinase, putative, expressed -
8 Sobic.001G251750 - K03935: NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 2
9 Sobic.007G079901 - -
10 Sobic.001G032850 - -
11 Sobic.003G068200 receptor kinase, putative, expressed -
12 Sobic.004G305733 - -
13 Sobic.K031300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed -
14 Sobic.001G154450 - -
15 Sobic.010G124100 - -
16 Sobic.003G168600 cytochrome b6-f complex subunit 4, putative, expressed K02637: cytochrome b6-f complex subunit 4
17 Sobic.006G199601 - -
18 Sobic.006G165200 amino acid permease family protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G121050 - -
20 Sobic.003G172000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G301050 Sobic003G301050 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic003G301050--Sobic010G167700 SobicK043600 SobicK043600 Sobic003G301050--SobicK043600 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic003G301050--Sobic003G072000 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic003G301050--Sobic001G527550 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic003G301050--Sobic005G187700 Sobic004G140900 Sobic004G140900 Sobic003G301050--Sobic004G140900 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic003G301050--Sobic002G074700 Sobic001G251750 Sobic001G251750 Sobic003G301050--Sobic001G251750 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic003G301050--Sobic007G079901 Sobic010G167700--Sobic003G301050 Sobic003G411150 Sobic003G411150 Sobic010G167700--Sobic003G411150 Sobic005G110517 Sobic005G110517 Sobic010G167700--Sobic005G110517 Sobic006G199601 Sobic006G199601 Sobic010G167700--Sobic006G199601 Sobic001G288500 Sobic001G288500 Sobic010G167700--Sobic001G288500 Sobic010G167700--SobicK043600 Sobic010G167700--Sobic001G251750 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic010G167700--Sobic010G124100 Sobic003G012750 Sobic003G012750 Sobic010G167700--Sobic003G012750 Sobic003G168600 Sobic003G168600 SobicK043600--Sobic003G168600 SobicK031300 SobicK031300 SobicK043600--SobicK031300 Sobic004G272950 Sobic004G272950 SobicK043600--Sobic004G272950 Sobic003G172000 Sobic003G172000 SobicK043600--Sobic003G172000 Sobic002G121050 Sobic002G121050 SobicK043600--Sobic002G121050 Sobic002G112200 Sobic002G112200 SobicK043600--Sobic002G112200 Sobic009G095720 Sobic009G095720 SobicK043600--Sobic009G095720 Sobic009G209650 Sobic009G209650 SobicK043600--Sobic009G209650 Sobic001G401750 Sobic001G401750 SobicK043600--Sobic001G401750 Sobic003G072000--Sobic005G187700 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic003G072000--Sobic002G134800 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic003G072000--Sobic009G213150 Sobic001G032850 Sobic001G032850 Sobic003G072000--Sobic001G032850 Sobic003G072000--Sobic004G272950 Sobic003G072000--Sobic003G168600 Sobic003G072000--SobicK043600 Sobic002G126700 Sobic002G126700 Sobic003G072000--Sobic002G126700 Sobic003G072000--Sobic001G401750 SobicK032500 SobicK032500 Sobic001G527550--SobicK032500 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic001G527550--Sobic004G334501 Sobic001G527550--Sobic007G079901 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic001G527550--Sobic001G050650 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic001G527550--Sobic002G018200 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic001G527550--Sobic002G022500 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic001G527550--Sobic002G094000 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic001G527550--Sobic005G024500 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic001G527550--Sobic002G073000 Sobic005G187700--Sobic003G072000 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic005G187700--Sobic009G173700 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic005G187700--Sobic003G142500 Sobic005G187700--Sobic009G213150 Sobic003G341900 Sobic003G341900 Sobic005G187700--Sobic003G341900 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic005G187700--Sobic007G149500 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic005G187700--Sobic002G202350 Sobic005G187700--Sobic001G527550 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic005G187700--Sobic001G014600 Sobic004G140900--Sobic002G074700 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic004G140900--Sobic001G504300 Sobic004G140900--Sobic001G032850 Sobic003G414200 Sobic003G414200 Sobic004G140900--Sobic003G414200 Sobic004G140900--Sobic001G251750 Sobic004G140900--Sobic003G012750 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic004G140900--Sobic010G025600 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic004G140900--Sobic001G154450 Sobic004G140900--Sobic003G301050 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic002G074700--Sobic002G149600 Sobic002G074700--Sobic002G121050 Sobic002G074700--Sobic003G172000 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic002G074700--Sobic003G263450 Sobic002G074700--Sobic001G154450 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic002G074700--Sobic004G072600 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic002G074700--Sobic002G163400 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic002G074700--Sobic009G094100 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic002G074700--Sobic006G094900 Sobic001G251750--Sobic004G140900 Sobic001G251750--SobicK043600 Sobic001G251750--Sobic002G074700 Sobic001G251750--Sobic003G301050 Sobic001G251750--Sobic010G167700 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic001G251750--Sobic008G053500 Sobic001G251750--Sobic006G199601 Sobic001G251750--Sobic003G012750 Sobic002G365200 Sobic002G365200 Sobic001G251750--Sobic002G365200 Sobic007G079901--Sobic002G018200 Sobic007G079901--Sobic004G334501 Sobic007G079901--Sobic001G527550 Sobic007G079901--Sobic003G263450 Sobic007G079901--SobicK032500 Sobic007G079901--Sobic002G074700 Sobic007G079901--Sobic002G149600 Sobic007G059150 Sobic007G059150 Sobic007G079901--Sobic007G059150 Sobic007G079901--Sobic002G121050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.