Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G165200.2,Sobic.006G165200.3,Sobic.006G165200.1
Synonym CAT6, ATCAT6, Sb06g024120
Functional annotation amino acid permease family protein, putative, expressed
UniProt C5YD20 , A0A1Z5RE98 , A0A1Z5REX7
Pfam PF13906 PF00324 PF00324
Panther DB PTHR11785 PTHR11785:SF331
NCBI CDD KOG1286; Amino acid transporters
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0006810transport GO:0015171amino acid transmembrane transporter activity GO:0003333amino acid transmembrane transport


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G04770 : cationic amino acid transporter 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g45950.2 : amino acid permease family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056650
Brachypodium KQJ83872
Barley HORVU5Hr1G040540.20 , HORVU5Hr1G040540.2 , HORVU5Hr1G040540.3 , HORVU5Hr1G040540.1 , HORVU5Hr1G040540.6 , HORVU5Hr1G040540.7 , HORVU5Hr1G040540.4 , HORVU5Hr1G040540.5 , HORVU5Hr1G040540.8 , HORVU5Hr1G040540.9 , HORVU5Hr1G040540.10 , HORVU5Hr1G040540.11 , HORVU5Hr1G040540.12 , HORVU5Hr1G040540.13 , HORVU5Hr1G040540.14 , HORVU5Hr1G040540.15 , HORVU5Hr1G040540.16 , HORVU5Hr1G040540.17 , HORVU5Hr1G040540.18 , HORVU5Hr1G040540.19
Wheat TraesCS5A02G126900 , TraesCS2D02G388600 , TraesCS2A02G390100 , TraesCS5D02G134500 , TraesCS2B02G409100
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G187700 receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.003G301050 - -
3 Sobic.007G149500 expressed protein -
4 Sobic.009G173700 expansin precursor, putative, expressed -
5 Sobic.003G341900 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
6 Sobic.004G279400 ZR1 protein, putative, expressed -
7 Sobic.003G072000 receptor kinase, putative, expressed -
8 Sobic.008G147600 - -
9 Sobic.003G068150 - -
10 Sobic.009G020600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G202350 - -
12 Sobic.004G305733 - -
13 Sobic.003G162600 expressed protein -
14 Sobic.001G100300 - -
15 Sobic.010G167700 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
16 Sobic.003G068200 receptor kinase, putative, expressed -
17 Sobic.004G074400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
18 Sobic.001G014600 - -
19 Sobic.005G116700 receptor kinase, putative, expressed -
20 Sobic.005G150700 resistance protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G165200 Sobic006G165200 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic006G165200--Sobic005G187700 Sobic003G301050 Sobic003G301050 Sobic006G165200--Sobic003G301050 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic006G165200--Sobic007G149500 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic006G165200--Sobic009G173700 Sobic003G341900 Sobic003G341900 Sobic006G165200--Sobic003G341900 Sobic004G279400 Sobic004G279400 Sobic006G165200--Sobic004G279400 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic006G165200--Sobic003G072000 Sobic008G147600 Sobic008G147600 Sobic006G165200--Sobic008G147600 Sobic003G068150 Sobic003G068150 Sobic006G165200--Sobic003G068150 Sobic005G187700--Sobic003G072000 Sobic005G187700--Sobic009G173700 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic005G187700--Sobic003G142500 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic005G187700--Sobic009G213150 Sobic005G187700--Sobic003G341900 Sobic005G187700--Sobic007G149500 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic005G187700--Sobic002G202350 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic005G187700--Sobic001G527550 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic005G187700--Sobic001G014600 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic003G301050--Sobic010G167700 SobicK043600 SobicK043600 Sobic003G301050--SobicK043600 Sobic003G301050--Sobic003G072000 Sobic003G301050--Sobic001G527550 Sobic003G301050--Sobic005G187700 Sobic004G140900 Sobic004G140900 Sobic003G301050--Sobic004G140900 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic003G301050--Sobic002G074700 Sobic001G251750 Sobic001G251750 Sobic003G301050--Sobic001G251750 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic003G301050--Sobic007G079901 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic007G149500--Sobic002G046150 Sobic001G145550 Sobic001G145550 Sobic007G149500--Sobic001G145550 Sobic007G149500--Sobic005G187700 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic007G149500--Sobic002G208700 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic007G149500--Sobic001G100300 Sobic001G187900 Sobic001G187900 Sobic007G149500--Sobic001G187900 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic007G149500--Sobic009G037500 Sobic007G149500--Sobic003G341900 Sobic007G149500--Sobic009G173700 Sobic009G173700--Sobic005G187700 Sobic009G173700--Sobic001G014600 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic009G173700--Sobic006G221500 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic009G173700--Sobic008G142500 Sobic009G173700--Sobic001G100300 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic009G173700--Sobic006G235801 Sobic009G173700--Sobic003G341900 Sobic009G173700--Sobic007G149500 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic009G173700--Sobic007G042700 Sobic003G341900--Sobic005G187700 Sobic003G341900--Sobic009G173700 Sobic003G341900--Sobic007G149500 Sobic003G341900--Sobic003G072000 Sobic004G305733 Sobic004G305733 Sobic003G341900--Sobic004G305733 Sobic003G341900--Sobic001G100300 Sobic003G341900--Sobic001G145550 Sobic003G341900--Sobic009G213150 Sobic002G176700 Sobic002G176700 Sobic003G341900--Sobic002G176700 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic004G279400--Sobic004G074400 Sobic004G279400--Sobic002G208700 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic004G279400--Sobic006G279100 Sobic004G279400--Sobic007G149500 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic004G279400--Sobic001G150100 Sobic004G279400--Sobic003G068150 Sobic009G180900 Sobic009G180900 Sobic004G279400--Sobic009G180900 Sobic009G020600 Sobic009G020600 Sobic004G279400--Sobic009G020600 Sobic004G279400--Sobic006G165200 Sobic003G072000--Sobic005G187700 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic003G072000--Sobic002G134800 Sobic003G072000--Sobic009G213150 Sobic001G032850 Sobic001G032850 Sobic003G072000--Sobic001G032850 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic003G072000--Sobic004G272950 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic003G072000--Sobic003G168600 Sobic003G072000--SobicK043600 Sobic002G126700 Sobic002G126700 Sobic003G072000--Sobic002G126700 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic003G072000--Sobic001G401750 Sobic002G219100 Sobic002G219100 Sobic008G147600--Sobic002G219100 Sobic008G147600--Sobic004G074400 Sobic008G147600--Sobic009G180900 Sobic005G150700 Sobic005G150700 Sobic008G147600--Sobic005G150700 Sobic008G147600--Sobic006G165200 Sobic008G147600--Sobic009G037500 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic008G147600--Sobic010G025600 Sobic008G147600--Sobic009G020600 Sobic002G099932 Sobic002G099932 Sobic008G147600--Sobic002G099932 Sobic003G068150--Sobic004G074400 Sobic005G116700 Sobic005G116700 Sobic003G068150--Sobic005G116700 Sobic001G279800 Sobic001G279800 Sobic003G068150--Sobic001G279800 Sobic003G068200 Sobic003G068200 Sobic003G068150--Sobic003G068200 Sobic003G068150--Sobic004G279400 Sobic003G068150--Sobic009G037500 Sobic003G068150--Sobic005G187700 Sobic003G068150--Sobic005G150700 Sobic010G055900 Sobic010G055900 Sobic003G068150--Sobic010G055900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.